Poliketid sintază
Poliketide sintetaze (PKC, ing. Polyketide synthase , EC 6.4) sunt enzime sau complexe multienzimatice care sintetizează policetide ( metaboliți secundari , cum ar fi antibiotice , toxine sau statine ). Poliketide sintazele se găsesc în bacterii , ciuperci , animale și plante și sunt foarte asemănătoare cu sintazele acizilor grași în organizarea și mecanismul lor de biosinteză . De regulă, genele sintetazei pentru o anumită policetidă sunt incluse într-un operon (în bacterii ) sau într-un grup (în eucariote ).
Tipuri
Există 3 tipuri de poliketide sintetaze în funcție de structura lor cuaternară și mecanismul de cataliză .
- Tip I - proteine modulare mari , constând din mai multe domenii care au o anumită activitate enzimatică sau altă activitate funcțională și sunt interconectate prin fragmente scurte de peptide, adică domeniile par a fi „înșirate” pe un „fir”, formând o „linie de asamblare”. " pe care și sinteza unui anumit produs.
- Tipul II - complexe de mai multe proteine monofuncționale.
- Tipul III diferă de primele două tipuri prin aceea că folosește malonil- coenzima A ca substrat , în timp ce sintazele de tip 1 și 2 folosesc un rest malonil-C-panthetoinil asociat cu un domeniu purtător de acil (tip 1) sau un purtător de acil. proteine (tip 2).
Module și domenii
Fiecare poliketid sintază de tip I constă din mai multe „blocuri de construcție” - domenii. Un singur domeniu poate avea o activitate enzimatică specifică. Numărul de domenii determină complexitatea produsului sintetizat. Au fost găsite următoarele tipuri de domenii (denumirea acceptată este indicată între paranteze):
În PCS se disting următoarele module:
- Pornire sau încărcare ( AT-ACP -)
- Alungire sau extindere (- KS-AT-[DH-ER-KR]-ACP -))
- Încetarea sau eliberarea (- TE )
Deși ordinea modulelor este întotdeauna conservată și determinată de mecanismul de sinteză, PCS-urile individuale pot diferi foarte mult în compoziția și ordinea domeniilor.
Note
- Fischbach MA, Walsh CT Enzimologie linie de asamblare pentru antibiotice peptidice polyketide și nonribozomale: logică, mașini și mecanisme // Chem . Rev. : jurnal. - 2006. - august ( vol. 106 , nr. 8 ). - P. 3468-3496 . - doi : 10.1021/cr0503097 . — PMID 16895337 .
- Weissman KJ Biochimie. Anatomia unei poliketide sintetaze fungice (engleză) // Science : journal. - 2008. - Aprilie ( vol. 320 , nr. 5873 ). - P. 186-187 . - doi : 10.1126/science.1157677 . — PMID 18403699 .