Un grafic molecular este un grafic nedirecționat conectat care este în corespondență unu-la-unu cu formula structurală a unui compus chimic, astfel încât vârfurile graficului să corespundă atomilor moleculei , iar marginile graficului să corespundă la legăturile chimice dintre acești atomi. Conceptul de „graf molecular” este de bază pentru chimia computerizată și chimioinformatica . La fel ca o formulă structurală, un grafic molecular este un model al unei molecule și, ca orice model , nu reflectă toate proprietățile prototipului. Spre deosebire de formula structurală, unde este întotdeauna indicat cărui element chimic îi aparține un anumit atom, vârfurile graficului molecular pot fi neetichetate - în acest caz, graficul molecular va reflecta doar structura, dar nu și compoziția moleculei. În mod similar, marginile unui grafic molecular pot fi neetichetate, caz în care nu se va face distincție între legăturile chimice simple și multiple. În unele cazuri, poate fi utilizat un grafic molecular care reflectă doar scheletul de carbon al unei molecule de compus organic. Acest nivel de abstractizare este convenabil pentru rezolvarea computațională a unei game largi de probleme chimice.
O extensie naturală a graficului molecular este graficul de reacție , ale cărui margini corespund formării, ruperii și reordonării legăturilor dintre atomi.
„Subliniem că ideea empirică a aditivității a fost fundamentată pentru prima dată în teoria lui R. Bader [1] , această teorie a făcut posibilă acordarea unui sens fizic strict unui număr de concepte ale clasicului. teoria structurii chimice , în special, „primul de valență” (calea de legătură) și formula chimică structurală (graficul molecular)." [2]
| Vizualizare moleculară | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Formule chimice |
| ||||
| Modele moleculare |
| ||||
| Alte | |||||
| Chimie structurală | |
|---|---|
| legătură chimică | |
| Afișarea structurii | |
| Proprietăți electronice | |
| Stereochimie | |