Căpitan de pavilion - o poziție în marina , corespunzătoare șefului de stat major al flotei sau formației de nave (în cazul în care această funcție a fost deținută de un ofițer de stat major și nu de un amiral ). Toți ceilalți ofițeri de stat major sunt subordonați căpitanului pavilionului. În flota engleză a secolelor XVIII-XIX, căpitanul de pavilion a comandat nava amiral a unei escadrile sau a flotei . În Marina Imperială Rusă , cartierul general al comandanților flotei prevedea două posturi de căpitan de pavilion: pentru părțile operaționale și administrative. Conform articolului 110 din Carta navală a flotei imperiale ruse, căpitanul pavilionului nu a putut conduce escadrila după moartea comandantului, iar comanda ar fi trebuit să treacă la cea mai mare dintre navele amirale .
În secolul al XVIII-lea, căpitanul-drapel reprezenta întregul cartier general de marș al comandantului, dar această funcție însemna recunoașterea aproape automată a distincțiilor în cazul operațiunilor navale reușite, chiar dacă proprietarul său personal nu s-a remarcat în luptă.