Afinitate

Afinitatea  este capacitatea unui obiect (corp) de a comunica cu un alt obiect și de a forma astfel un nou obiect complex. Conceptul de afinitate se aplică atât obiectelor fizice ( particule elementare , atomi  - de exemplu, afinitatea electronică ), cât și moleculelor complexe (în chimie ), inclusiv proteinelor (în biochimie ). Coeficientul care caracterizează puterea de afinitate este energia de legare eliberată sau consumată atunci când are loc o legătură de obiecte (denumite în continuare molecule), măsurată în kilojuli (kJ) sau electron volți (eV) .

Termenul „ afinitate ” sau „afinitate” este de fapt un sinonim pentru conceptul de „afinitate”, dar în limba științifică rusă acest cuvânt este mai folosit în imunologie (interacțiunea antigenului și anticorpului ). În chimia anorganică, termenul „ electronegativitate ” are un înțeles similar , caracterizând afinitatea atomilor unici pentru ceilalți.

În biochimie, afinitatea unui ligand pentru un receptor este caracterizată de așa-numitul coeficient Ki ( abreviat de la o constantă de disociere utilizată în legarea receptorului și inhibarea enzimatică - constantă de disociere în raport cu legarea la receptori (legarea receptorului ) , ca precum și inhibiția enzimatică ). K i poate fi calculat [1] prin următoarea formulă. Dacă EC50 este jumătate  din concentrația maximă efectivă a ligandului, care caracterizează puterea acțiunii ligandului asupra receptorului, [ligand] este concentrația ligandului în soluție, K d  este constanta de disociere pentru legătura ligand-receptor .

Astfel, Ki este  concentrația unui ligand concurent dacă acesta este conectat la jumătate din receptorii disponibili în starea de echilibru a sistemului. Cu cât este mai mic Ki ,  cu atât este mai mare afinitatea pentru receptorul pentru acest ligand. [unu]

Există mai multe baze de date publice ( Ki Database ) cu coeficienţi Ki , cum ar fi BindingDB.org sau PDSP Ki Database .

Rețineți că K i caracterizează puterea interacțiunii (inclusiv timpul în care receptorul este ocupat de ligand), dar nu caracterizează modalitatea (polaritatea) acestei forțe (inhibarea sau activarea receptorului).

Există simulatoare utilizate în cercetarea farmacologică , cu ajutorul cărora puteți calcula coeficienții de conectare ai liganzilor dați la proteinele receptor date ( vezi Modelarea moleculară ).

Link -uri

• Afinitate chimică // Dicționar enciclopedic al lui Brockhaus și Efron  : în 86 de volume (82 de volume și 4 suplimentare). - Sankt Petersburg. , 1890-1907.
• Modelarea computerizată a structurii enzimelor amilolitice
• Context despre proteine, molecule mici și legare

Note

1. ↑ 1 2 date de legare cu o clasă de receptori  (link inaccesibil)