Domeniul proteic

Un domeniu proteic  este un element al structurii terțiare a unei proteine , care este o substructură destul de stabilă și independentă a proteinei, a cărei pliere are loc independent de restul părților. Un domeniu conține de obicei mai multe elemente de structură secundară . Domenii similare ca structură se găsesc nu numai în proteinele înrudite (de exemplu, în hemoglobinele diferitelor animale), ci și în proteine ​​complet diferite.

Destul de des, domeniilor li se atribuie nume separate, deoarece prezența lor afectează direct funcțiile biologice îndeplinite de proteină - de exemplu, domeniul de legare a Calmodulin Ca 2+ , homeodomeniul , responsabil pentru legarea de ADN în diverși factori de transcripție etc.

Întrucât domeniile sunt destul de „autonome” în formarea structurii și în îndeplinirea funcției lor, cu ajutorul ingineriei genetice este posibil să „coaseți” un domeniu aparținând altuia uneia dintre proteine ​​(creând astfel o proteină himerică ). O astfel de himeră, cu noroc, va combina funcțiile ambelor proteine. De exemplu, prin fuzionarea domeniului de legare a ADN-ului Cas9 cu diferite domenii de reglementare, a fost posibil să se obțină factori de transcripție artificiali (crisprTF) care sunt direcționați selectiv către regiunile dorite ale genomului folosind „ghiduri ARN” personalizate [1] [2] [3] . Domeniul Cas9 poate fi, de asemenea, utilizat pentru a construi endonucleaze de restricție artificiale , represori și enzime de modificare a epigenomului , cum ar fi ADN-metilazele și demetilazele.

Exemple de domenii proteice

Vezi și

Note

  1. Lei S. Qi, Matthew H. Larson, Luke A. Gilbert, Jennifer A. Doudna, Jonathan S. Weissman, Adam P. Arkin, Wendell A. Lim . (2013) Reutilizarea CRISPR ca o platformă ghidată de ARN pentru controlul specific secvenței al expresiei genelor. Cell, 152 (5): 1173-1183 DOI:10.1016/j.cell.2013.02.022
  2. Farzadfard, F., Perli, SD și Lu, TK (2013). Factori de transcripție eucarioți reglabili și multifuncționali pe baza CRISPR/Cas. ACS biologie sintetică, 2(10), 604-613. DOI: 10.1021/sb400081r
  3. Gilbert, L.A., Larson, MH, Morsut, L., Liu, Z., et al. & Qi, L.S. (2013). Reglarea modulară ghidată de ARN mediată de CRISPR a transcripției la eucariote. Cell, 154(2), 442-451.