| structura de bază helix-buclă-helix a domeniului de legare la ADN. | |
|---|---|
| motivul structural de bază al translocatorului nuclear helix-loop-helix AHR (ARNT). Două elice α (albastre) interacționează cu o buclă scurtă (roșu) [1] . | |
| Identificatori | |
| Simbol | bHLH |
| Pfam | PF00010 |
| InterPro | IPR001092 |
| INTELIGENT | SM00353 |
| PROZITA | PDOC00038 |
| SCOP | 1mdy |
| SUPERFAMILIE | 1mdy |
| CDD | cd00083 |
| Structuri proteice disponibile | |
| Pfam | structurilor |
| PDB | RCSB PDB ; PDBe ; PDBj |
| PDBsum | Model 3D |
| Fișiere media la Wikimedia Commons | |
Structura de bază helix-loop-helix (din limba engleză basic helix-loop-helix , prescurtare bHLH ) este motivul structural de bază prezent în multe proteine aparținând superfamiliei factorilor de transcripție dimerizanți [2] [3] [4] [ 5 ] . Aceste proteine sunt numite proteine bHLH. Acest motiv structural proteic nu trebuie confundat cu un alt motiv structural proteic similar, așa-numitul motiv helix-turn-helix.
Motivul se caracterizează prin prezența a două elice α legate printr-o buclă. În general, factorii de transcripție care includ acest domeniu sunt dimerici, fiecare având o singură spirală care conține resturi de aminoacizi bazici care facilitează legarea moleculelor de ADN [6] . În motiv, un helix este mai mic și, datorită flexibilității buclei, permite dimerizarea prin pliere și împachetare pe un alt helix. Helixul mare conține de obicei locuri de legare a ADN-ului. Proteinele bHLH se leagă de obicei la o secvență consens numită E-box, CANTG [7] . Secvența canonică a cutiei E este CACGTG (palindromic), cu toate acestea, unii factori de transcripție bHLH, în special din familia bHLH-PAS, se leagă de secvențe non-palindromice înrudite care sunt similare cu caseta E. TF-urile bHLH se pot homodimeriza sau heterodimeriza cu alte TF-uri bHLH și pot forma o mare varietate de dimeri, fiecare cu funcții specifice [8] .
Exemple de factori de transcripție care conțin bHLH:
Factorii de transcripție bHLH sunt adesea importanți în dezvoltarea sau activitatea celulară. BMAL1/Clock este principalul complex de transcripție în oscilatorii moleculari circadieni. Alte gene precum c-Myc și HIF-1 au fost asociate cu cancerul datorită influenței lor asupra creșterii și metabolismului celular.
Deoarece mulți factori de transcripție bHLH sunt heterodimerici [8] , activitatea lor este adesea puternic reglată de dimerizarea subunității. Expresia sau disponibilitatea unei subunități este adesea controlată, în timp ce cealaltă subunitate este exprimată constitutiv. Multe dintre proteinele de reglementare cunoscute, cum ar fi cea a Drosophila extramacrochaetae , au o structură helix-buclă-helix, dar le lipsește o regiune de bază, făcându-le incapabile să se lege de ADN pe cont propriu . Ele sunt, totuși, capabile să formeze heterodimeri cu proteine care au structura bHLH și astfel își dezactivează capacitatea de factori de transcripție [9] .
AHR ; AHRR ; ARNT ; ARNT2 ; ARNTL ; ARNTL2 ; ASCL1 ; ASCL2 ; ASCL3 ; ASCL4 ; ATOH1 ; ATOH7 ; ATOH8 ; BHLHB2 ; BHLHB3 ; BHLHB4 ; BHLHB5 ; BHLHB8 ; CEAS ; EPAS1 ; FERD3L ; FIGLA ; MÂNĂ1 ; MÂNĂ2 ; HES1 ; HES2 ; HES3 ; HES4 ; HES5 ; HES6 ; HES7 ; HEY1 ; HEY2 ; HIF1A ; ID1 ; ID2 ; ID3 ; ID4 ; KIAA2018 ; LYL1 ; MASH1 ; MATH2 ; MAX ; MESP1 ; MESP2 ; MIST1 ; MITF ; MLX ; MLXIP ; MLXIPL ; MNT ; M.S.C .; MSGN1 ; MXD1 ; MXD3 ; MXD4 ; MXI1 ; MYC ; MYCL1 ; MYCL2 ; MYCN ; MYF5 ; MYF6 ; MYOD1 ; MYOG ; NCOA1 ; NCOA3 ; NEUROD1 ; NEUROD2 ; NEUROD4 ; NEUROD6 ; NEUROG1 ; NEUROG2 ; NEUROG3 ; NHLH1 ; NHLH2 ; NPAS1 ; NPAS2 ; NPAS3 ; NPAS4 ; OAF1 ; OLIG1 ; OLIG2 ; OLIG3 ; PTF1A ; SCL ; SCXB ; SIM1 ; SIM2 ; SOHLH1 ; SOHLH2 ; SREBF1 ; SREBF2 ; TAL1 ; TAL2 ; TCF12 ; TCF15 ; TCF21 ; TCF3 ; TCF4 ; TCFL5 ; TFAP4 ; TFE3 ; TFEB ; TFEC ; TWIST1 ; TWIST2 ; USF1 ; USF2 ;