Microcipul de proteine este o tehnologie folosită în biologia moleculară. Un microcip proteic este un suport (bază) solid pe care mii de proteine diferite ( antigeni , anticorpi , enzime etc.) sunt atașate covalent în diferite puncte ale microcipului. Fiecare proteină individuală formează o zonă cu concentrația sa ridicată pe microarray. Această tehnologie este foarte asemănătoare cu tehnologia ADN microarray , doar proteinele acționează ca sonde , mai degrabă decât molecule de ADN monocatenar.
În prezent, trei tipuri de micromatrice de proteine sunt utilizate relativ pe scară largă: micromatrice analitice, funcționale și în fază inversă. [unu]
Microarrays analiticeAceste micromatrice sunt utilizate în mod obișnuit pentru profilarea unui amestec complex de proteine: măsurarea afinității, specificității și a nivelului de exprimare a proteinei în amestec. În această tehnică, biblioteci de anticorpi , aptameri , antigeni sunt depuse pe substraturi solide care formează baza unui microcip. Apoi, un astfel de cip este scufundat într-un amestec de proteine pentru care este necesar să se profileze. Micromatricele de proteine care foloseau anticorpi au fost cele mai comune în anii 00 ai secolului XXI. [2] Micromatricele analitice pot fi folosite pentru a căuta expresia diferențială și în diagnosticul clinic. Un exemplu este compararea țesuturilor sănătoase și bolnave, precum și răspunsul țesuturilor la condițiile de mediu în schimbare [3] .
Microcipuri funcționaleAcest tip de microcip diferă de cele analitice prin faptul că proteinele sau domeniile complet funcționale sunt situate pe o bază solidă, și nu o triadă analitică (anticorpi, aptameri, antigeni). Astfel de microarrays fac posibilă analiza activității biochimice a întregului proteom într-un singur experiment. În plus, ele sunt folosite pentru a studia numeroase interacțiuni ale proteinelor cu alte proteine, ADN, ARN, lipide, liganzi cu greutate moleculară mică [4] [5] .
Microcipuri cu fază inversă (RPM)La fabricarea microcipurilor de acest tip, celulele izolate din diferite țesuturi suferă liză. Lizatul este aplicat pe membrana de nitroceluloză folosind o mașină specială - formând un microcip, apoi fiecare celulă a microcipului rezultat este analizată de diferiți anticorpi împotriva proteinei de interes. Acest tip de microarray face posibilă detectarea proteinelor, sau modificărilor conformaționale ale acestora, care apar doar în timpul anumitor boli [6] .