Diftamidă

Versiunea actuală a paginii nu a fost încă examinată de colaboratori experimentați și poate diferi semnificativ de versiunea revizuită la 1 februarie 2021; verificările necesită 2 modificări .
diftamidă
General

Nume sistematic
​(2S)​-2-amino-3-[2-[​(3S)​-4-amino-4-oxo-3-​(trimetilazaniumil)​butil] -1H-imidazol-5-il]propanoat
Nume tradiționale 2-(3-carboxamido-3(trimetilamonio)propil)histidină
Chim. formulă C13H23N5O3 _ _ _ _ _ _ _
Proprietăți fizice
Stat cristale incolore
Masă molară 297,353 g/ mol
Clasificare
Reg. numar CAS 75645-22-6
PubChem
ZÂMBETE   C[N+](C)(C)C(CCC1=NC=C(N1)CC(C(=O)[O-])N)C(=O)N
InChI   InChI=1S/C13H23N5O3/c1-18(2.3)10(12(15)19)4-5-11-16-7-8(17-11)6-9(14)13(20)21/ h7, 9-10H,4-6,14H2,1-3H3,(H3-,15,16,17,19,20,21)/p+1/t9-,10-/m0/s1FOOBQHKMWYGHCE-UWVGGRQHSA-O
CHEBI 15949
ChemSpider
Siguranță
Personaj scurt. pericol (H) H201 , H202 , H235+H410
masuri de precautie. (P) P201
Pictograme GHS Pictograma „Butelie de gaz” a sistemului CGSPictograma „Bombă care explodează” a sistemului CGS
NFPA 704 NFPA 704 diamant în patru culori 0 0 0
Datele se bazează pe condiții standard (25 °C, 100 kPa), dacă nu este menționat altfel.

Diftamida este un aminoacid necodant derivat din histidină , găsit exclusiv în factorul de alungire eucariotic eEF- 2 și în unele arhee . Este sintetizat în timpul modificării post-translaționale și este o țintă pentru mono -ADP-ribozilarea în procesul de reglare a sintezei proteinelor ribozomale .

Diftamida a fost descoperită în studiul mecanismului de acțiune al toxinei difterice, datorită căruia și-a primit numele. Cel puțin cinci toxine ribozilante ADP (toxine pertussis, holeră și difterie, toxina E. coli LT și exotoxina A Pseudomonas) sunt cunoscute a avea un loc comun de legare a NAD, trei dintre ele (difterie, holeră, exotoxina A) sunt diftamidă. -dependent [ 1] , [2] .

Biosinteza

Deși diftamida este cunoscută de mai bine de două decenii, detaliile etapelor inițiale ale biosintezei sale rămân neclare.

Primul pas în biosinteza diftamidei este transferul restului de 3-carboxi-3-aminopropil la restul de histidină al lanțului proteic eEF-2 [3] . Donatorul reziduului este S-adenosilmetionina (SAM) și are loc atacul nucleofil al fragmentului imidazol al histidinei pe carbonul SAM activat de centrul sulfoniului. Spre deosebire de majoritatea acestor reacții care implică SAM, care au loc ca atacuri nucleofile asupra carbonului grupării metil și conduc la transferul acestuia pe substratul nucleofil, în timpul biosintezei diftamidei nu se transferă gruparea metil, ci 3-carboxi-3. - rest aminopropil per atom de carbon în poziţia 2 a inelului imidazol al histidinei pentru a forma 2-(3-carboxi-3-aminopropil)-L-histidină.

În etapa următoare, gruparea amino a fragmentului 3-aminopropil al restului de 2-(3-carboxi-3-aminopropil)-L-histidină suferă o metilare completă cu formarea reziduului de difnină (2-[3-carboxi- 3-(trimetilamonio)propil]-L-histidină), această reacție este catalizată de enzima diftin sintaza (EC 2.1.1.98), S-adenosilmetionina acționează ca donor de grupare metil [4] .

În ultima etapă, gruparea carboxil a diftinei, atunci când interacționează cu amoniacul catalizat de ligaza diftin-amoniac (EC 6.3.1.14), se transformă într-o grupare amidă cu formarea diftamidei [5]

Note

  1. Informații despre EC 2.4.2.36 - NAD+-diftamid ADP-ribosiltransferaza // BRENDA . Preluat la 4 iulie 2013. Arhivat din original la 10 iulie 2013.
  2. Supotnitsky , M.V. Toxinele bacteriene. Natura lor, mecanismele de acțiune, posibilitățile de construire a toxinelor hibride și modificate (link inaccesibil) . Biologice . Preluat la 4 iulie 2013. Arhivat din original la 18 iulie 2013. 
  3. la mamifere - în poziția 715, la drojdie - 699, la Pyrococcus horikoshii  - 600
  4. EC 2.1.1.98 // Nomenclatura enzimelor IUBMB . Preluat la 14 mai 2013. Arhivat din original la 23 mai 2013.
  5. EC 6.3.1.14 // Nomenclatura enzimelor IUBMB . Consultat la 14 mai 2013. Arhivat din original la 20 octombrie 2012.