Institutul de Probleme Matematice de Biologie RAS

Institutul de Probleme Matematice de Biologie al Academiei Ruse de Științe este o ramură a Instituției Federale de Stat „Centrul Federal de Cercetare Institutul de Matematică Aplicată numită după V.I. M.V. Keldysh al Academiei Ruse de Științe ” (abreviat: IMPB RAS - filiala IPM numită după M.V. Keldysh RAS ), așa a început să arate numele oficial al institutului după reorganizarea din 2015-2016. [unu]

Scopul institutului este de a dezvolta metode matematice și computaționale pentru cercetarea biologică , precum și de a rezolva direct probleme de biologie computațională folosind astfel de metode.

Institutul publică revista științifică Mathematical Biology and Bioinformatics. [2]

Structura Institutului

Institutul include [3] :

• Laboratorul de cristalografie de macromolecule
• Laboratorul de sisteme mecanice cuantice
• Laboratorul de dinamică moleculară
• Laboratorul de rețele neuronale
• Laboratorul de Matematică Aplicată
• Laboratorul de Ecologie Computațională
• Departamentul de Tehnologii Informaţionale Avansate
  • Laborator de prelucrare a datelor
  • Laboratorul de Bioinformatică
• Divizia de Calcul și Resurse Informaționale

Activitate științifică

Direcții științifice

• Dezvoltari teoretice ;
  • Fundamentele teoretice ale nanobioelectronicii ;
  • dezvoltarea metodelor spectro-analitice de prelucrare a datelor din experimente biologice;
  • dezvoltarea metodelor numerico-analitice de prelucrare a datelor din experimente biologice;
  • soluții analitice ale ecuațiilor integro-diferențiale ;
  • metode de analiză a sistemelor dinamice .

• Analiza datelor
  • analiza activității creierului uman ;
  • dezvoltarea metodelor de evaluare a biodiversităţii acoperirii vegetative ;
  • dezvoltarea de algoritmi și programe pentru studierea secvențelor genomice : recunoașterea regiunilor codificatoare și a zonelor de omogenitate;
  • dezvoltarea de metode computerizate pentru studiul structurilor primare ale biopolimerilor ;
  • dezvoltarea de noi metode de comparare a biopolimerilor și aplicarea acestora la recunoașterea tipului de structură spațială a proteinelor;
  • crearea de noi metode de descifrare a structurii complexelor de macromolecule biologice pe baza datelor privind împrăștierea razelor X și a neutronilor ;
  • dezvoltarea metodelor de obținere, prelucrare și analiză a imaginilor digitale în biologie și medicină.

• Biologie computațională
  • modelarea prin simulare a dinamicii sistemelor biomoleculare;
  • modele de rețele neuronale de procesare a informațiilor în structurile creierului ;
  • creșterea graficelor aleatoare și aplicațiile lor în neuroștiința matematică ;
  • studiul modelelor de canale ionice dependente de tensiune ale biomembranelor excitabile ;
  • software pentru studiul metabolismului celular ;
  • modele matematice în biomecanică ;
  • rezolvarea numerică a problemelor de cardiofizică .

• Sinergetică (inclusiv secțiuni precum: Sistem dinamic , Teoria haosului , Termodinamică de neechilibru , Biologia sistemului )
  • studiul modelelor neliniare ale stărilor auto-prinse în medii condensate;
  • metode asimptotice si simulare numerica in studiul undelor de excitatie ;
  • bifurcații în ecuații diferențiale care descriu sisteme cu simetrii;
  • Bifurcații în ecuații diferențiale funcționale și fenomene de memorie de bifurcație .

• bioinformatica

• Calcul paralel
  • dezvoltarea unui cluster de calcul de înaltă performanţă ;
  • tehnologii CUDA .

Proiecte științifice de specialitate

• proiectul „Celula matematică” [4] ;
• proiectul „ Metoda spectral-analitică generalizată ” (GSAM) [5] [6] [7] .

Activități didactice și sociale

Personalul Institutului a susținut cursuri de prelegeri la Universitatea de Stat Pushchino [8] (PushchGU); A. M. Molchanov a fost organizatorul Centrului Educațional de Biologie Matematică al Universității de Stat Push și decanul acestuia din 1994 până în 2005, precum și șeful programului de master „Modelarea sistemelor biologice” al Universității de Stat Push (1994-2011).

Din 2006, o dată la doi ani, Institutul ține o conferință „Biologie matematică și bioinformatică”.

Istorie

Institutul a fost fondat la 17 februarie 1972 la Pușchino , iar AM Molchanov a fost numit director . Până în 1992, a fost numit Centrul de calcul al cercetării (NICC) al Academiei de Științe a URSS ; până în februarie 2016, a fost denumită Instituția Federală a Bugetului de Stat al Științei Institutul de Probleme Matematice de Biologie al Academiei Ruse de Științe ( Institutul de Probleme Matematice de Biologie , IMPB RAS ).

Repere

• 17 februarie 1972 - a fost organizat Centrul de Cercetare Informatică (NICC) al Academiei de Științe a URSS;
• 1972 - a fost creat departamentul de tehnologie informatică (șef - V. G. Erokhin );
• 1983 - a fost creat departamentul de informatică (șef - V. V. Kornilov ); transformat ulterior în sectorul sistemelor de regăsire a informațiilor (șeful - V.V. Vasilchikov ), care a funcționat până în 1989;
• 1984 - grupul de suport al sarcinilor al departamentului de tehnologie informatică a fost transformat în departamentul de organizare a muncii de calcul (șef - V. A. Korolev );
• 1986 - a fost creat Sectorul Problemelor Învățarii Calculatoarelor (condus de R. M. Borisyuk );
• 1990 - s-a organizat sectorul problemelor matematice de biomecanica
• 1992 - NIVT-urile Academiei de Științe a URSS au fost redenumite în Institutul de Probleme Matematice de Biologie (IMPB) al Academiei Ruse de Științe; au fost desființate departamentele de informatică și organizarea muncii de calcul;
• 1998 - Doctor în filozofie a fost ales ca noul director al institutului. n. V. D. Lakhno
• 2000 - a fost creat Departamentul Inter-Institut de Calcul și Resurse Informaționale (MOVIR)
• 2004 — înființat laborator de bioinformatică
• 2015 - prin decizie a FASO , Institutul a fost fuzionat cu Institutul de Matematică Aplicată [1]

Lideri

• Molchanov, Albert Makarievici (1972-1998, regizor)
• Lakhno, Victor Dmitrievich (1998-2016, regizor)
• Lakhno, Victor Dmitrievich (din 2016, șef al filialei)

Colaboratori de seamă

• Dedus, Florenc Fiodorovich
• Molchanov, Albert Makarievici
• Shnol, Emmanuil Elevich

Link -uri

• Site-ul oficial Arhivat la 28 februarie 2008 la Wayback Machine
• O scurtă istorie a Institutului Arhivat la 2 martie 2009 la Wayback Machine

Note

1. ↑ 1 2 Ordin privind aderarea IMPB la IPM . Consultat la 1 martie 2016. Arhivat din original pe 6 martie 2016. (nedefinit)
2. ↑ Site-ul oficial al jurnalului . Consultat la 10 octombrie 2017. Arhivat din original la 11 octombrie 2017. (nedefinit)
3. ↑ Laboratoarele IMPB RAS . Consultat la 3 aprilie 2022. Arhivat din original pe 2 martie 2009. (nedefinit)
4. ↑ Site-ul oficial al proiectului Mathematical Cell . Data accesului: 30 iunie 2016. Arhivat din original la 11 ianuarie 2016. (nedefinit)
5. ↑ Proc. SPIE. Vol.2363. 1995. P.109-112 . Data accesului: 30 iunie 2016. Arhivat din original pe 18 august 2016. (nedefinit)
6. ↑ Proc. SPIE. Vol.2363. 1995. P.113-118 . Data accesului: 30 iunie 2016. Arhivat din original pe 18 august 2016. (nedefinit)
7. ↑ SBARS - Abordare bazată pe spectru pentru căutarea repetărilor . Preluat la 26 septembrie 2017. Arhivat din original la 26 septembrie 2017. (nedefinit)
8. ↑ Site-ul oficial al Universității Pushchino  (link inaccesibil)