Imunologia moleculară este o disciplină științifică care studiază bazele chimice, biochimice și biologice moleculare ale reacțiilor imune . Bazat pe chimia proteinelor, biochimia generală și biologia moleculară. Metodele sale sunt folosite în studiul structurii și funcției proteinelor, în genetica moleculară. Examinează la nivel molecular structura și funcția anticorpilor , chimia complementului.