Protomer

Un protomer în biologie  este o unitate structurală a proteinelor oligomerice. Este cea mai mică unitate, constând din cel puțin două lanțuri proteice diferite, care formează un hetero-oligomer mai mare prin combinarea a două sau mai multe copii ale acestei unități. Termenul a fost introdus de Chetverin [1] pentru a face o nomenclatură lipsită de ambiguitate în enzima Na/K-At Phase . Această enzimă este compusă din două subunități, o subunitate mare catalitică α și o subunitate mai mică de glicoproteină β (plus o proteolipidă , numită subunitate γ). Atunci nu a fost clar cum interacționează între ele și în ce secvențe se află. De asemenea, când oamenii vorbeau despre un dimer, au vrut să spună αβ sau (αβ) 2 ? Chetverin a sugerat numirea αβ protomer și (αβ) 2 diprotomer.

Protomerii sunt de obicei aranjați în simetrie ciclică pentru a forma o simetrie de grup închis

Exemple

Hemoglobina este un heterotetramer format din patru subunități (două α și două β). Cu toate acestea, hemoglobina este mai bine descrisă structural și funcțional ca (αβ) 2 , deci poate fi numită un dimer a doi protomeri aβ, adică un diprotomer.

Aspartat-carbamoil transferaza constă dintr-o subunitate α 6 β 6 . Șase protomeri αβ sunt aranjați în simetrie D3.

Note

  1. Chetverin. Dovezi pentru o structură diprotomerică a Na, K-ATPaza: Determinarea precisă a concentrației proteinelor și analiza cantitativă a grupului final // 1986.