DDX17

Cutie Helicase 17 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp).
Identificatori
SimbolDDX17  ; P72; RH70
ID-uri externeOMIM:  608469 MGI :  1914290 HomoloGene :  101101 GeneCards : DDX17 Gene
numărul CE3.6.4.13
Profilul expresiei ARN
Mai multe informatii
ortologii
VedereUmanMouse
Entrez1052167040
AnsambluENSG00000100201ENMUSG00000055065
UniProtQ92841Q501J6
RefSeq (ARNm)NM_001098504NM_001040187
RefSeq (proteină)NP_001091974NP_001035277
Locus (UCSC)Chr 22:
38,88 – 38,9 Mb
Chr 15:
79,53 – 79,55 Mb
Căutați în PubMed[unu][2]

ARN helicaza putativă dependentă de ATP DDX17 (p72)  este o enzimă codificată la om de gena DDX17 [1] [2] .

Funcția

Proteinele Box DEAD, caracterizate printr-un motiv conservat Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), sunt probabil helicaze ARN . Ele sunt implicate în multe procese celulare care implică alterarea structurii secundare a ARN, cum ar fi inițierea translației, splicing -ul nuclear și mitocondrial , asamblarea ribozomilor și spliceosomului . Pe baza naturii distribuției lor, se presupune că unii membri ai acestei familii sunt implicați în embriogeneză , spermatogeneză , precum și în creșterea și diviziunea celulară. Această genă (DDX17) codifică proteina DEAD box, care este ATPaza activată de diferite tipuri de ARN , dar nu de ADN -ul dublu catenar . Această proteină și cea codificată de gena DDX5 sunt mai strâns legate între ele decât cu orice alt membru al familiei DEAD box. Îmbinarea alternativă a acestei gene produce două variante de transcrieri care codifică diferite izoforme ale proteinei, transcriptul mai lung fiind raportat că poate iniția translația din codonul CUG, mai degrabă decât din codonul AUG, ca alte proteine ​​[2] .

Interacțiuni

S-a demonstrat că DDX17 interacționează cu:

Note

  1. Lamm GM , Nicol SM , Fuller-Pace FV , Lamond AI p72: o proteină de cutie DEAD nucleară umană foarte înrudită cu p68.  (engleză)  // Cercetarea acizilor nucleici. - 1996. - Vol. 24, nr. 19 . - P. 3739-3747. — PMID 8871553 .
  2. 1 2 Gena Entrez: polipeptidă cutie DDX17 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) 17 .
  3. Ogilvie VC , Wilson BJ , Nicol SM , Morrice NA , Saunders LR , Barber GN , Fuller-Pace FV Helicazele ARN cutite DEAD, foarte înrudite p68 și p72, există ca heterodimeri în celule.  (engleză)  // Cercetarea acizilor nucleici. - 2003. - Vol. 31, nr. 5 . - P. 1470-1480. — PMID 12595555 .
  4. ^ Wilson BJ , Giguère V. Identificarea partenerilor noi de cale a helicazelor ARN p68 și p72 prin meta-analiză Oncomine.  (engleză)  // BMC genomics. - 2007. - Vol. 8. - P. 419. - doi : 10.1186/1471-2164-8-419 . — PMID 18005418 .
  5. 1 2 3 4 5 Watanabe M. , Yanagisawa J. , Kitagawa H. , Takeyama K. , Ogawa S. , Arao Y. , Suzawa M. , Kobayashi Y. , Yano T. , Yoshikawa H. , Masuhiro Y. , Kato S. O subfamilie de proteine ​​DEAD-box care leagă ARN-ul acționează ca un coactivator alfa al receptorului de estrogen prin domeniul de activare N-terminal (AF-1) cu un coactivator de ARN, SRA.  (engleză)  // Jurnalul EMBO. - 2001. - Vol. 20, nr. 6 . - P. 1341-1352. - doi : 10.1093/emboj/20.6.1341 . — PMID 11250900 .
  6. ^ Wilson BJ , Bates GJ , Nicol SM , Gregory DJ , Perkins ND , Fuller-Pace FV Helicazele p68 și p72 DEAD box ARN interacționează cu HDAC1 și reprimă transcripția într-o manieră specifică promotorului.  (engleză)  // Biologie moleculară BMC. - 2004. - Vol. 5. - P. 11. - doi : 10.1186/1471-2199-5-11 . — PMID 15298701 .