Coronavirus (subfamilie)

Coronavirusuri

Coronavirus legat de sindromul respirator acut sever (SARSCoV)
clasificare stiintifica
Grup:Viruși [1]Tărâm:RiboviriaRegatul:OrthornaviraeTip de:PisuviricotaClasă:PisoniviricetesOrdin:NidoviralesSubordine:CornidovirineaeFamilie:CoronavirusuriSubfamilie:Coronavirusuri
Denumire științifică internațională
Orthocoronavirinae
Sinonime
  • Coronavirinae
Grupul Baltimore
IV: virusuri (+)ssRNA

Coronavirusurile [2] ( lat.  Orthocoronavirinae ) sunt o subfamilie de virusuri din familia Coronaviridae [3] care combină ARN încapsulat - care conțin viruși pleomorfi [K 1] care provoacă o gamă largă de boli de severitate diferită la animale, inclusiv la om [4] ] . În majoritatea cazurilor, infecțiile cu coronavirus sunt ușoare, dar în secolul 21 au existat focare de boli grave cauzate de betacoronavirusurile MERS-CoV și SARS-CoV [4] , precum și SARS-CoV-2 . Acestea sunt viruși cu o genă ARN monocatenar (+) și o nucleocapsidă elicoidală. Dimensiunea genomului coronavirusurilor variază de la aproximativ 27 până la 34 kilobaze, cel mai mare virus ARN cunoscut.

Genomul

Coronavirusurile conțin un genom ARN simț monocatenar . Dimensiunea genomului lor variază de la 27 la 34 kilobaze și este unul dintre cele mai mari dintre virusurile ARN. Genomul are un capac 5’-metilat și o coadă 3’-poliadenilată. Organizarea genomică a coronavirusului: secvența lider 5'-UTR - replicază / transcriptază - vârf (S) - coajă (E) - nucleocapsid (N) - 3'UTR - coadă poli(A). Cadrele de citire deschise 1a și 1b, care ocupă primele două treimi din genom, codifică o poliproteină replicază/transcriptază. Poliproteina replicază/transcriptază se auto-clindează pentru a forma proteine ​​nestructurale (nsps). Urmează cadrele de citire care codifică cele patru proteine ​​structurale majore: vârf, înveliș, membrană și nucleocapsid. Intercalate cu aceste cadre sunt cadrele de citire pentru proteinele accesorii. Numărul de proteine ​​accesorii și funcția lor sunt diferite pentru diferite coronavirusuri.

Ciclul de viață

Origine

Infecția începe atunci când glicoproteina virală (S) se atașează de receptorul complementar al celulei gazdă. După atașare, proteaza celulei gazdă scindează și activează proteina de vârf atașată la receptor. În funcție de proteaza disponibilă a celulei gazdă, clivajul și activarea permit celulei să intre prin endocitoză sau fuziunea directă a învelișului viral cu membrana gazdă. La pătrunderea în celula gazdă, particula virală nu are acoperire și genomul său intră în citoplasma celulei. Genomul ARN coronavirusului are un capac 5’-metilat și o coadă poliadenilata 3’, ceea ce permite ARN-ului să se atașeze de ribozomul celulei gazdă pentru traducere. Ribozomul gazdă traduce cadrul de citire deschis suprapus original al genomului viral și formează o poliproteină lungă. Poliproteina are propriile sale proteaze care scindează poliproteina în multe proteine ​​nestructurale.

Clasificare

Până în 2009, reprezentanții subfamiliei au fost combinați în genul Coronavirus [5] , dar în 2009 a fost revizuită taxonomia coronavirusurilor: Coronavirusul a fost împărțit în 3 genuri ( Alphacoronavirus , Betacoronavirus , Gammacoronavirus ), unite în subfamilia Coronavirinae [6] .

Comitetul Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV) din aprilie 2020 identifică 4 genuri în subfamilie [7] :

Note

Comentarii
  1. Virușii pleomorfi sunt viruși care variază ca formă și dimensiune.
Surse
  1. Taxonomia Virușilor  pe site-ul web al Comitetului Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV) .
  2. Coronaviruses  / Gorbalenya A.E.  // Congo - Botez. - M  .: Marea Enciclopedie Rusă, 2010. - S. 352. - ( Marea Enciclopedie Rusă  : [în 35 de volume]  / redactor-șef Yu. S. Osipov  ; 2004-2017, v. 15). - ISBN 978-5-85270-346-0 .
  3. Shchelkanov M. Yu., Popova A. Yu., Dedkov V. G., Akimkin V. G., Maleev V. V. Istoria studiului și clasificării moderne a coronavirusurilor (Nidovirales: Coronaviridae)  // Infecție și imunitate  : articol științific. - 2020. - T. 10 , nr 2 . - S. 221-246 . Arhivat din original pe 25 iunie 2020.
  4. 1 2 Zumla A., Chan JFW, Azhar EI, Hui DSC, Yuen K.-Y. Coronavirus - descoperire de medicamente și opțiuni terapeutice  (engleză)  // Nature Reviews Drug Discovery . - 2016. - Vol. 15 . - P. 327-347 . - doi : 10.1038/nrd.2015.37 .
  5. Istoricul taxonomiei ICTV pentru Coronavirus Arhivat 9 august 2016 la Wayback Machine pe site-ul web ICTV  ( accesat  la 19 iulie 2019) .
  6. Revizia familiei Coronaviridae  : [ ing. ] // ICTV. — Cod(e) atribuit(e): 2008.085-126V. - 2008. - P. 3-6. — 37 p.m.
  7. Taxonomia Virușilor  pe site-ul web al Comitetului Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV) . (Accesat: 25 mai 2020) .

Link -uri