| Tioredoxină | |
|---|---|
| O moleculă de tioredoxină umană (PDB ID 1ERT), exemplul canonic al pliului tioredoxină. | |
| Identificatori | |
| Simbol | Tioredoxină, Trx |
| Pfam | PF00085 |
| Clanul Pfam | CL0172 |
| PROZITA | PDOC00172 |
| SCOP | 3trx |
| SUPERFAMILIE | 3trx |
| CDD | cd01659 |
| Structuri proteice disponibile | |
| Pfam | structurilor |
| PDB | RCSB PDB ; PDBe ; PDBj |
| PDBsum | Model 3D |
Pliul tioredoxină este un pliu proteic comun enzimelor care catalizează formarea și izomerizarea legăturilor disulfurice . Pliul este numit după exemplul canonic de tioredoxină și se găsește atât în proteinele procariote , cât și în cele eucariote . Acesta este un exemplu de pliu al proteinei alfa/beta care are activitate de oxidoreductază . Topologia spațială a pliului constă dintr-o foaie beta antiparalelă cu patru catene, închisă între trei elice alfa .
În ciuda variabilității secvenței în multe regiuni de pliere, proteinele tioredoxinei împărtășesc o secvență de situs activ cu două reziduuri reactive de cisteină : Cys-XY-Cys unde X și Y sunt adesea, dar nu neapărat, aminoacizi hidrofobi . Forma redusă a proteinei conține două grupări tiol libere la reziduurile de cisteină, în timp ce forma oxidată conține o legătură disulfurică între ele.
Diferitele proteine care conțin pliul de tioredoxină diferă foarte mult în ceea ce privește reactivitatea și pKa -ul tiolilor liberi, ceea ce se datorează capacității structurii totale a proteinei de a stabiliza tiolatul activat . Deși structura este destul de universală în rândul proteinelor care conțin pliul tioredoxină, pKa este extrem de sensibil la mici modificări ale structurii, în special la locația atomilor din coloana vertebrală a proteinei în apropierea primei cisteine.
Proteinele umane care conțin acest domeniu includ:
| Structura terțiară a unei proteine | |
|---|---|
| informatii generale | |
| Stil all-α: |
|
| Stil all-β: |
|
| stivuire α/β: |
|
| stivuire α+β: | |
| Styling neregulat | |