Haplogrup L0 (mtDNA)

Haplogrupul L0
Tip de ADNmt
Ora de apariție 188-112,2 mii litri. n. [unu]
Locația de apariție Africa de Sud
Grup ancestral Eva mitocondrială
Subcladele L0a'b'f'k, L0d
Mutații marker 263!, 1048, 3516A, 5442, 6185, 9042, 9347, 10589, 12007, 12720 [2]

Haplogrupul L0  - în genetica populației - haplogrupul ADN mitocondrial uman .

Haplogrupul L0 este una dintre cele două ramuri din cel mai recent strămoș comun (MRCA) pentru o descendență maternă umană comună. Haplogrupul L0 este format din cinci ramuri principale (L0a, L0b, L0d, L0f, L0k). Patru dintre acestea au fost inițial clasificate în clade L1 ca L1a, L1d, L1f și L1K.

Separarea liniilor L0 și L1′2′3 a avut loc acum 124 de mii de ani. n. (interval de încredere 95% - acum 151-97 mii de ani) [3] . În 2019, geneticienii au calculat că descendența L0 a apărut în rămășița paleo-umedă Makgadikgadi - Okavango din sudul Africii, cu aproximativ 200 de mii de ani în urmă. n. (interval de încredere 95% - acum 240-165 mii de ani) [4] .

Specimenele din Malawi au subcladele L0k2 (acum 10000–5000 de ani), L0a2 (acum 7230 de ani), L0f (Fingira, acum 2400 de ani) - toate de la Muntele Hora, L0k2 (acum 5400–4800 de ani BP) și L0k1 (acum 4525 de ani) de la adăpostul în stâncă Chencherere II, L0d1c (acum 5290 de ani) și L0d1b2b (acum 5270 de ani) din Fingira [5] .

Haplogrupul mitocondrial L0a2a1 [6] identificat în specimenele 2/SEII (acum 7970–7800 de ani) și 2/SEI (acum 7920–7690 de ani) din localitatea Shum Laka din Camerun .

L0f1 a fost identificat în specimenul LUK003 de la Lukenya Hill din Kenya (3500 BP , Neolitic) [7] .

L0f2b a fost determinat în proba I3706 (Baqah_MLBA, 1424-1288 î.Hr.) din Peștera B3 (Peștera B3) din Valea Baq҅ah, la 20 km nord-vest de Amman ( Iordania din Epoca Bronzului ), prin secvențierea ADN-ului din partea petroasă a osului temporal. [8] .

În 2014, o sub-ramură L0d2c1c [9] a fost identificată într-un exemplar vechi de 2330 de ani din Africa de Sud (St Helena Bay) .

În 2016, un haplogrup mitocondrial L0 a fost identificat într-o mumie din regiunea Tuli din nordul Botswanei (Epoca Târzie a Fierului ) [10] .

În 2017, trei oameni din epoca de piatră (Ballito Bay A, Ballito Bay B și Doonside) care au trăit cca. 2 mii de litri n., și un bărbat din Epoca Fierului de la Castelul Champagne, care a trăit 448-282 de ani. n., a determinat linia L0d2 [11] .

În 2017, eșantionul sud-african I9133 de la Faraoskop Rock Shelter, vechi de 2000 de ani. n. identificată subclada L0d1b2b1b, în ​​proba I9134 din Kasteelberg, 1310 ani. n. identificată subclada L0d1a1a (date necalibrate). Subclada L0a a fost identificată într-un specimen tanzanian din Pemba (I1048) acum 1520 de ani [5] .

L0a2 (cel mai probabil) a fost determinat din proba kenyană I8931 (White Rock Point (GrJb2), malul de sud al Golfului Winam al Lacului Victoria) din epoca de piatră târzie (N/A), L0a a fost determinat din proba tanzaniană I13981 ( Peștera Gishimangeda, Pastoral_Neolithic (altul), 2730–2460 BP), L0a2d determinat din specimenul kenyan I8758 (Naishi Rockshelter, Pastoral_Neolithic (altul), 2700–2370 BP), L0f2a1 determinat din specimenul Tanzanian I1G39777 (Caveolith, Tanzania) 2000–1890 BP), L0a1d determinat din specimenul kenyan I8805 (Egerton Cave (GrJh10), Pastoral_Neolithic (Elmenteitan), 1870–1740 BP), L0f2a determinat din specimenul kenyan I8892 (Ilkek Mounds/Ilkek6), IIG (PastoralJil6) Epoca fierului, 1170–980 BP), L0a1c1 a fost determinată din specimenul Kenya I12381 (Laikipia District Burial Site (GoJl45), Pastoral Iron Age, 650–560 BP) [12] .

L0k1a2 a fost găsit în specimenul XAR002 din Xaro (1400 BP, Epoca timpurie a fierului) în Botswana, L0d3b1 a fost găsit în specimenul TAU001 din Taukome (1100 BP, Epoca timpurie a fierului) în Botswana, L0a1b1a1 a fost găsit în specimenul KIN004 cu ani înainte ( prezent , 1636-1800) în Republica Democratică Congo [7] .

L0a1a1 a fost determinată din probe de la cimitirul creștin R (~650-1000) de pe insula Kulubnarti (Kulb) din nordul Sudanului [13] .

S-a stabilit că haplogrupul L0 se găsește cel mai adesea în Africa subsahariană. Atinge cea mai mare frecvență în rândul popoarelor Khoisan (73%) [14] , ajungând în Namibi (!Xun) 79%, Africa de Sud (Khwe/!Xun) 83% și Botswana (!Xun) 100% [15] .

Într-un studiu al genomului mitocondrial din grupul Khoisan, Behar și colab., în 2008, au descoperit că genomurile Khoisan antice erau limitate la haplogrupurile mitocondriale L0d și L0k, în estimarea lor a ramurii mitocondriale timpurii L0k, care a apărut acum aproximativ 144.000 de ani, care este de aproximativ 3/4 ori apariția celei mai apropiate rude mitocondriale ( Eve mitocondrială ) [16] . Alte estimări plasează ramificarea liniei mitocondriale L0k între 120.000 și 160.000 de ani în urmă [17] [18] . Divergența haplogrupurilor L0d și L0a'b'f'k a avut loc cu ~ 119.000 (100.100–138.200) de ani în urmă, divergența haplogrupurilor L0k și L0a'b'f a avut loc cu ~ 98.700 de ani (de la 82.300 de ani în urmă cu 40. de L0a a avut loc acum 42.400 (33.000–52.000) de ani [19] .

Arborele filogenetic de mai jos se bazează pe o publicație a lui Van Oven și Manfred Kaiser [2] și pe studii publicate ulterioare.

Note

  1. ↑ Soares, Pedro; Ermini, Luca; Thomson, Noel; Mormina, Maru; Rito, Teresa; Rohl, Arne; Salas, Antonio; Oppenheimer, Stephen; MacAulay, Vincent. Corectarea pentru purificarea selecției: un ceas molecular mitocondrial uman îmbunătățit  // The American  Journal of Human Genetics : jurnal. - 2009. - Vol. 84 , nr. 6 . - P. 740-759 . - doi : 10.1016/j.ajhg.2009.05.001 . — PMID 19500773 .
  2. ↑ 1 2 Van Oven, Mannis; Kaiser, Manfred. Arborele filogenetic cuprinzător actualizat al variației globale a ADN-ului mitocondrial uman  //  Mutația umană : jurnal. - 2009. - Vol. 30 , nr. 2 . - P. E386-94 . - doi : 10.1002/humu.20921 . — PMID 18853457 .
  3. ↑ Emily HM Wong, Andrey Khrunin, Larissa Nichols, Dmitri Pușkarev, Denis Khokhrin, Dmitri Verbenko, Oleg Evgrafov, James Knowles, John Novembre, Svetlana Limborska, Anton Valouev. Reconstruirea istoriei genetice a populațiilor din Siberia și nord-estul Europei , 2015
  4. ↑ Eva KF Chan și colab. Originile umane într-o zonă paleo-umedă din Africa de Sud și primele migrații , 2019
  5. ↑ 1 2 Pontus Skoglund și colab. Reconstruirea structurii populației africane preistorice Arhivat 31 ianuarie 2019 la Wayback Machine , 21 septembrie 2017
  6. ↑ Mark Lipson și colab. Furătorii antici din Africa de Vest în contextul istoriei populației africane Arhivat 25 ianuarie 2020 la Wayback Machine , 2020
  7. ↑ 1 2 Ke Wang și colab. Genoamele antice dezvăluie modele complexe de mișcare, interacțiune și înlocuire a populației în Africa sub-sahariană Arhivat 12 iunie 2020 la Wayback Machine // Science Advances, 12 iunie 2020
  8. ↑ Lily Agranat-Tamir et al. Istoria genomică a epocii bronzului Levantul de Sud Arhivată 8 august 2021 la Wayback Machine , 28 mai 2020 (Tabelul S1. Prezentare generală a celor 73 de indivizi recent raportați în acest studiu, în legătură cu figura 1)
  9. ↑ Alan G. Morris, Anja Heinze, Eva KF Chan, Andrew B. Smith, Vanessa M. Hayes. Primul genom uman mitocondrial antic de la un pre-pastoral din Africa de Sud  // Biologia și evoluția  genomului : jurnal. - 2014. - doi : 10.1093/gbe/evu202 .
  10. ↑ Frank J. Rühli, Maryna Steyn, Morongwa N. Mosothwane, Lena Öhrström, Molebogeng K. Bodiba, Abigail Bouwman. Analiza radiologică și genetică a unei mumii din epoca târzie a fierului din blocul Tuli, Botswana  // South African Journal of  Science : jurnal. — Vol. 112 , nr. 1/2 . Arhivat din original pe 21 iunie 2016.
  11. ↑ Carina M. Schlebusch și colab. Genomul antic din Africa de Sud împinge divergența umană modernă dincolo de acum 260.000 de ani , 2017
  12. ↑ Mary E. Prendergast și colab. ADN-ul antic dezvăluie o răspândire în mai multe etape a primilor păstori în Africa subsahariană Arhivat 1 iunie 2019 la Wayback Machine (Tabelul S7. (fișier separat) haplogrupuri mtDNA), 2019
  13. ↑ Kendra A. Sirak și colab. Stratificare socială fără diferențiere genetică la locul lui Kulubnarti în perioada creștină Nubia Arhivată la 6 martie 2021 la Wayback Machine , 17 februarie 2021 ( Figura suplimentară 5, 6 Arhivată la 23 octombrie 2021 la Wayback Machine )
  14. ↑ Rosa, Alexandra; Brehm, Antonio; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Williams, Richard. Profilul ADNmt al guineenilor din Africa de Vest: către o mai bună înțelegere a regiunii Senegambia   // Analele geneticii umane : jurnal. - 2004. - Vol. 68 , nr. 4 . - P. 340-352 . doi : 10.1046/ j.1529-8817.2004.00100.x . — PMID 15225159 .
  15. ↑ Tishkoff, SA; Gonder, M.K.; Henn, BM; Mortensen, H.; Knight, A.; Gignoux, C.; Fernandopulle, N.; Lema, G.; Nyambo, TB Istoria populațiilor africane care vorbesc clicuri, deduse din ADNmt și variația genetică a cromozomului Y  // Biologie  moleculară și evoluție : jurnal. - Oxford University Press , 2007. - Vol. 24 , nr. 10 . - P. 2180-2195 . - doi : 10.1093/molbev/msm155 . — PMID 17656633 .
  16. ↑ Behar, D.M.; Willems, R; Williams; Goodyall, H; Goodyall; Blue-Smith, J; albastru-fier; Pereira, L; Pereira; Metspalu, E; Metspalu; Scozzari, R; Scozzari; Makkan, H; Makkan; Tzur, S; Tzur; D. Zorii diversității matrilineale umane  // American Journal of Human  Genetics : jurnal. - 2008. - Mai ( vol. 82 , nr. 5 ). - P. 1130-1140 . - doi : 10.1016/j.ajhg.2008.04.002 . — PMID 18439549 .
  17. ↑ Soares, P; Ermini, L; Ermini; Thomson, N; Thomson; Mormina, M; Mormina; Rito, T; Rito; Rohl, A; Rohl; Salas, A; salas; Oppenheimer, S; Oppenheimer; Macaulay, V; MacAulay; MB Corectare pentru purificarea selecției: un ceas molecular mitocondrial uman îmbunătățit  // American  Journal of Human Genetics : jurnal. - 2009. - iunie ( vol. 84 , nr. 6 ). - P. 740-759 . - doi : 10.1016/j.ajhg.2009.05.001 . — PMID 19500773 .
  18. ↑ Gonder, M.K.; Mortensen, HM; Mortensen; Reed, F. A.; stuf; de Sousa, A; De Sousa; Tishkoff, SA; Tishkoff. Analiza secvenței genomului întreg mtDNA a liniilor antice africane  (engleză)  // Mol. Biol. Evol: jurnal. - 2007. - Decembrie ( vol. 24 , nr. 3 ). - P. 757-768 . - doi : 10.1093/molbev/msl209 . — PMID 17194802 .
  19. ↑ Daniel Shriner și colab. Ascendența genetică a popoarelor Hadza și Sandawe dezvăluie structura populației antice în Africa Arhivată la 17 februarie 2019 la Wayback Machine , Biologia și evoluția genomului, volumul 10, numărul 3, 1 martie 2018, paginile 875–882, 14 martie 2018
  20. ↑ Primul genom uman mitocondrial antic de la un pre-pastoral din Africa de Sud . Preluat la 9 mai 2016. Arhivat din original la 8 octombrie 2014.
  21. ↑ Alan G. Morris și colab. Primul genom uman mitocondrial antic de la un pre-pastorist din Africa de Sud

Vezi și

Arborele haplogrupului mtDNA uman

Eva mitocondrială
|
L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7
|
M N
| |
cz D E G Q R O A S X Y N1 N2
| | | |
C Z B F R0 pre-JT P Regatul Unit eu N1a W
| | |
HV JT U K
| |
H V J T Clustere IWX moștenite


Link -uri

Informații generale

Haplogrup L3