Orientarea este orientarea unei structuri monocatenare într- o moleculă de acid nucleic [1] .
Denumirea atomilor de carbon din nucleotide (pe baza numerotării atomilor de carbon din molecula de zahăr pentoză) dă naștere la două capete - 5’ și 3’ (pronunțate ca cinci timpi și trei timpi , în engleză five prime end, three prime). sfârşit ).
Pozițiile relative ale analogilor structurali ai lanțurilor de acid nucleic, genelor , factorilor de transcripție , polimerazelor , sunt de obicei denumite în funcție de poziția față de sau departe de capetele 5’ și respectiv 3’. Sinteza acizilor nucleici este posibilă in vivo numai în direcția de la 5’ la 3’, deoarece polimerazele ADN și ARN atașează noi resturi de nucleotide numai la gruparea 3’- hidroxil (-OH) folosind o legătură fosfodiester . În mod obișnuit, înregistrarea secvențelor de nucleotide ADN și ARN este efectuată în direcția de la 5’ la 3’ [2] .