Afinitate (biochimie)

În biochimie , afinitatea (de asemenea afinitatea de legare ) este o măsură a tendinței moleculelor de a se lega de alte molecule, de exemplu între partenerii de legare într - o interacțiune proteină - ligand : cu cât afinitatea este mai mare, cu atât este mai mare constanta de asociere Ka ( numită și constanta de legare).

Caracteristici

Totuși, în prezent, în locul constantei de asociere , se folosește de obicei măsura inversă, constanta de disociere Kd : cu cât afinitatea proteinei pentru ligandul său este mai mare, cu atât constanta de disociere a complexului este mai mică. Pe exemplul formării/clivajului complexului enzimă-substrat [ES].

definițiile conform legii acțiunii masei sau constantele cinetice (constantele de viteză k) sunt enumerate aici:

constantă de asociere (constantă de legare)	$K_{a}={[ES] \over [E]\cdot [S]}$	$K_{a}={k_{1} \over k'_{1}}$
constanta de disociere	$K_{d}={[E]\cdot [S] \over [ES]}$	$K_{d}={k'_{1} \over k_{1))$ .

În cinetica enzimatică , Km , constanta Michaelis , este uneori folosită ca măsură a afinității unei enzime pentru substratul său. În practică, aceasta are un anumit drept, dar teoretic, constanta de disociere a complexului ES K d și constanta Michaelis trebuie să fie strict distinse. Potrivit lui Briggs și Haldane, constanta Michaelis depinde și de numărul de modificări k 2 și se calculează după cum urmează:

K_{m}={k'_{1}+k_{2} \over k_{1))

Derivarea de la K m la K d este posibilă numai dacă . Această ipoteză nu este potrivită în toate cazurile, dar a fost făcută inițial de Leonor Michaelis și Maud Menten pentru a deriva ecuația Michaelis-Menten . $k_{2}\ll k'_{1)$

Afinitatea poate fi determinată utilizând un test de legare a ligandului .

Vezi și

Literatură

Jeremy M. Berg, John L. Timochko, Lubert Strayer: Biochimie. Ediția a 6-a, Spectrum Academic Publishing, Heidelberg, 2007. ISBN 978-3-8274-1800-5 .
Donald Voet, Judith G. Voet: Biochimie. 3. Ediție, John Wiley & Sons, New York, 2004. ISBN 0-471-19350-X .
Bruce Alberts , Alexander Johnson, Peter Walter, Julian Lewis, Martin Ruff, Keith Roberts: The Molecular Biology of the Cell , Ediția 5, Taylor și Francis, 2007, ISBN 978-0-8153-4106-2 .