Tupanvirus

Tupanvirus
clasificare stiintifica
Grup:Viruși [1]Tărâm:VaridnaviriaRegatul:BamfordviraeTip de:NucleocytoviricotaClasă:MegaviricetesOrdin:ImiterviralesFamilie:MimiviridaeGen:Tupanvirus
Denumire științifică internațională
Tupanvirus
feluri
Tupanvirus Soda Lake Tupanvirus Deep Ocean
Sistematică la Wikispecies Imagini la Wikimedia Commons NCBI   2094720

Tupanvirus  (lat.)  este un gen de virusuri care conțin ADN din familia Mimiviridae . Reprezentanții genului se numără printre cele mai mari virusuri cunoscute [2] . Genul a fost descris în februarie 2018 de ungrup de microbiologi brazilian - francez . Include două vederi [3] [4] . Din martie 2020, genul nu este înregistrat la Comitetul Internațional pentru Taxonomia Virușilor [5] .

Titlu

Numele generic este dat în onoarea lui Tupan, zeul tunetului printre indienii guarani [2] .

Structura virionului

Virionul atinge o lungime de 1,2 microni (datorită variațiilor în lungimea cozii, se găsesc virioni de până la 2,3 microni lungime), iar capsida este similară ca mărime (~450 nm ) și structură cu capsidei Mimivirus . Virionul Tupanvirus  este cea mai mare particulă de virus descrisă până în prezent. Tupanvirusul are o coadă cilindrică cu un diametru de ~550 × 450 nm , care este atașată la baza capsidei - acest virus este cel mai „cu coadă lungă” membru al familiei Mimiviridae . Se arată însă că nu există nicio legătură rigidă între coadă și capside. Sub capside se află o membrană lipidică , care fuzionează cu membrana fagozomului atunci când celula este infectată , eliberând conținutul capsidei în citoplasmă . Conținutul cozii este eliberat după ce membrana fagozomului iese în coadă [4] .

Genomul

Genomul este reprezentat de un ADN liniar dublu catenar care conține 1,44-1,51 milioane de perechi de baze care codifică proteine ​​1276-1425 . Aceasta este mai mult decât unele bacterii [2] . Genomul Tupanvirus codifică cel mai mare aparat de traducere dintre viruși . Include 70 de ARNt (inclusiv o specie are ARNt pentru aminoacidul rar pirolizină ), 20 de aminoacil-ARNt sintetaze , 11 factori de translație și proteine ​​necesare pentru maturarea ARNt și ARNm , precum și modificarea proteinelor ribozomale . Mai mult, genomul Tupanvirus conține și exprimă în mod activ două secvențe similare cu intronii din genele ARNr 18S . Astfel, pentru setul complet necesar pentru traducere, Tupanvirusului îi lipsesc doar ribozomi [4] .

Ciclul de viață

Spre deosebire de majoritatea virusurilor gigantice , Tupanvirusul se reproduce cu succes în două specii de amibe: Acanthamoeba castellanii și Vermamoeba vermiformis . Virusul intră în celulă, atașându-se de membrana acesteia și intră în celulă în timpul fagocitozei (1 oră după infectare). Membrana de sub capside fuzionează cu membrana fagozomului, iar genomul virusului intră în citoplasmă (2-6 ore după infectare). După aceasta, se formează o fabrică virală în care sunt asamblate noi particule virale, cu coada atașată de capside după ce este complet formată (7-12 ore după infecție). La 16-24 de ore după infecție, citoplasma amebei este complet umplută cu particule virale, iar după liza celulară , acestea intră în mediul extern. Citotoxicitatea Tupanvirusului este exprimată prin suprimarea exprimării ARNr și distrugerea progresivă a nucleului celulei gazdă [4] .

Evoluție

Analiza secvenței a arătat că Tupanvirusul  este un grup soră de mimivirusuri din familia Mimiviridae. Este probabil ca strămoșii acestor viruși să nu fi fost foarte specializați și să fi infectat o mare varietate de protisti . Din acest punct de vedere, strămoșii Tupanvirusului (și posibil mimivirusurilor) au fost viruși giganți care au suferit o evoluție reductivă , timp în care, totuși, au dobândit unele gene. Evoluția reductivă este caracteristică multor paraziți intracelulari obligați . De regulă, ei pierd genele asociate cu obținerea energiei , deoarece toate nevoile lor energetice sunt satisfăcute de celula gazdă. Este posibil și un scenariu alternativ, conform căruia strămoșul Tupanvirus a fost un virus relativ simplu, care a dobândit multe gene noi în timpul evoluției [4] .

Specie

• Lacul Tupanvirus Soda se găsește în lacul alcalin Nhecolândia ( Pantanal în sudul Braziliei ). Acest lac este foarte sărat, cu o valoare ridicată a pH-ului .
• Tupanvirus Deep Ocean a fost găsit în sedimentele marine colectate la o adâncime de 3.000 de metri în largul coastei Campos dos Goitacasis din Brazilia [4] .

Note

1. ↑ Taxonomia Virușilor  pe site-ul web al Comitetului Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV) .
2. ↑ 1 2 3 Oamenii de știință pot recunoaște virușii ca ființe vii
3. ↑ Garisto, Dan Acești viruși giganți au mai multe echipamente de producere a proteinelor decât orice virus cunoscut (27 februarie 2018). Preluat la 11 mai 2018. Arhivat din original la 1 iulie 2018. (nedefinit)
4. ↑ 1 2 3 4 5 6 Abrahão Jônatas , Silva Lorena , Silva Ludmila Santos , Khalil Jacques Yaacoub Bou , Rodrigues Rodrigo , Arantes Thalita , Assis Felipe , Boratto Paulo , Andrade Miguel , Kroon Erna Geligessien , Ribeiro Bergier Ivan , Ribeiro Bergmann , Ghigo , Colson Philippe , Levasseur Anthony , Kroemer Guido , Raoult Didier , La Scola Bernard. Tupanvirusul gigant cu coadă posedă cel mai complet aparat de translație al virosferei cunoscute  //  Nature Communications. - 2018. - 27 februarie ( vol. 9 , nr. 1 ). — ISSN 2041-1723 . - doi : 10.1038/s41467-018-03168-1 .
5. ↑ Taxonomia Virușilor  pe site-ul web al Comitetului Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV) . (Accesat: 23 aprilie 2020) .