4,5-Dicianimidazol

4,5-Dicianimidazol [1] [2]
General
Chim. formulă C5H2N4 _ _ _ _ _
Proprietăți fizice
Stat cristale incolore
Masă molară 118,10 g/ mol
Densitate 1,43 g/cm³
Proprietati termice
Temperatura
 •  topirea 175-176°C
 •  clipește 170,2°C
Clasificare
Reg. numar CAS 1122-28-7
Siguranță
Personaj scurt. pericol (H) H315 , H318 , H335
masuri de precautie. (P) P280 , P302+P352 , P305+P351+P338+P310
cuvant de semnal Periculos
Pictograme GHS Pictograma „Coroziunea” a sistemului CGSPictograma „Semnul exclamării” a sistemului CGS
Datele se bazează pe condiții standard (25 °C, 100 kPa), dacă nu este menționat altfel.

4,5-Dicianimidazolul este o substanță organică, un derivat de imidazol . Își găsește aplicație ca activator în sinteza automată a oligonucleotidelor , precum și în sinteza amidofosfiților nucleozidici .

Obținerea

4,5-Dicianimidazolul este disponibil comercial. Purificarea suplimentară include albirea cu cărbune activ și cristalizarea din apă fierbinte [1] .

Aplicație

Sinteza în fază solidă a oligonucleotidelor

Etapa cheie în sinteza automată a oligonucleotidelor este alungirea lanțului. Pentru a face acest lucru, reactivul amidofosfit este activat cu un acid slab, datorită căruia fosforilează gruparea 5’-hidroxil a lanțului în creștere pe suportul solid. Rolul activatorului poate fi îndeplinit și de 4,5-dicianimidazol. Se crede că în acest caz înlocuiește gruparea diizopropilamină din amidofosfit, iar compusul intermediar rezultat reacționează rapid cu gruparea hidroxil a lanțului în creștere, dând fosfotriesterul. Ciclul sintetic se termină apoi cu blocarea grupărilor hidroxil nereacționate și oxidarea fosfotriesterului la fosfat [1] .

Activatorul clasic în această etapă a sintezei este o soluție de 1H-tetrazol în acetonitril , cu toate acestea, soluțiile de 4,5-dicianimidazol foarte pur s-au dovedit a avea anumite avantaje. Diferența cheie este că 4,5-dicianimidazolul prezintă proprietăți mai puțin acide (pKa = 5,2 față de 4,8 pentru tetrazol), ceea ce reduce pierderea accidentală a grupărilor dimetoxitritil în timpul procesului de condensare și evită formarea de produse secundare. În plus, s-a demonstrat că rata de activare a reactanților amidofosfit de către 4,5-dicianimidazol este de două ori mai mare decât cea a tetrazolului. Aceste două fapte sunt deosebit de importante atunci când se utilizează nucleozide modificate 2’, care sunt mai dificile și, prin urmare, necesită timpi de condensare mai lungi. În consecință, nu este de dorit ca astfel de reactivi să fie în prezența unui reactiv acid pentru o perioadă lungă de timp: acest lucru duce la formarea de produse de sinteză alungite (N+1, N+2...) [1] .

De asemenea, 4,5-dicanimidazolul are o solubilitate mai mare în acetonitril (până la 1,1 M față de 0,5 M pentru tetrazol). În cele din urmă, 4,5-dicianimidazolul este considerat mai sigur decât tetrazolul exploziv enumerat [1] .

Sinteza amidofosfiților nucleozidici

Sinteza amidofosfiților nucleozidici în sine implică, de asemenea, o reacție între gruparea alcool și funcția amidofosfit a N,N,N',N'-tetraizopropil-O-(2-cianoetil)diamidofosfit. În consecință, în acest caz, 4,5-dicianimidazolul poate servi și ca un activator al reactivului de fosfilare [1] .

Note

  1. ↑ 1 2 3 4 5 6 EROS, 2018 .
  2. ↑ 4,5 -Dicianoimidazol  . Sigma Aldrich . Data accesului: 7 ianuarie 2021.

Literatură

Link -uri