ARL6

Versiunea actuală a paginii nu a fost încă examinată de colaboratori experimentați și poate diferi semnificativ de versiunea revizuită la 1 iulie 2019; verificările necesită 2 modificări .

Factorial de ribozilare ADP 6

Redare PDB bazată pe 2h57.

Structuri disponibile

PDB

Căutare ortolog: PDBe , RCSB

Lista ID-urilor PDB
2H57

Identificatori

Simbol

ARL6 ; BBS3; RP55

ID-uri externe

OMIM: 608845 MGI : 1927136 HomoloGene : 12960 GeneCards : ARL6 Gene

ontologie genetică
Funcţie	• legarea de proteine • legarea GTP • legarea fosfolipidelor • legarea ionilor metalici
componenta celulara	• citoplasmă • microtubul axonemal • axonem • membrană • înveliș membranar • BBSome • membrană ciliară • exozom vezicular extracelular
proces biologic	• ţintirea proteinelor către membrană • transducția semnalului mediată de GTPază mică • determinarea simetriei stânga/dreapta • percepția vizuală • calea de semnalizare Wnt • transportul melanozomului • ansamblul ciliului • diferențierea celulelor adipoase • polimerizarea proteinelor
Surse: Amigo / QuickGO

Profilul expresiei ARN

Mai multe informatii

ortologii

Vedere

Uman

Mouse

Entrez

RefSeq (ARNm)

RefSeq (proteină)

Locus (UCSC)

Chr 3:
97,48 – 97,52 Mb

Chr 16:
59,61 – 59,64 Mb

Căutați în PubMed

[unu]

[2]

Proteina 6 a factorului de ribozilare ADP este o proteină codificată la om de gena ARL6 [1] [2] [3] .

Proteina codificată de această genă aparține familiei ARF de proteine de legare a GTP . Proteinele ARF sunt regulatori importanți ai transportului celular și membri exemplari ai unei familii în continuă expansiune de proteine omoloage și secvențe genomice. Ele diferă de alte proteine mici de legare a GTP prin prezența unui dispozitiv structural unic care implementează comunicarea reciprocă între capătul N-terminal și situsul de legare a nucleotidelor . Studiile ortologului murin al acestei proteine sugerează implicarea în transportul proteinelor, transportul veziculelor intracelulare sau semnalizarea celulară în timpul maturării hematopoietice . Există splicing alternativ la acest locus și au fost descrise două variante de transcripte care codifică această proteină [3] .

Note

↑ Chiang AP, Nishimura D., Searby C., Elbedour K., Carmi R., Ferguson AL, Secrist J., Braun T., Casavant T., Stone EM, Sheffield VC Analiza genomică comparativă identifică un factor de ribozilare ADP- gena asemănătoare ca cauză a sindromului Bardet-Biedl (BBS3 ) // Am J Hum Genet : jurnal. - 2004. - iulie ( vol. 75 , nr. 3 ). - P. 475-484 . - doi : 10.1086/423903 . — PMID 15258860 .
↑ Fan Y., Esmail MA, Ansley SJ, Blacque OE, Boroevich K., Ross AJ, Moore SJ, Badano JL, May-Simera H., Compton DS, Green JS, Lewis RA, van Haelst MM, Parfrey PS, Baillie DL, Beales PL, Katsanis N., Davidson WS, Leroux MR Mutațiile într-un membru al superfamiliei Ras a proteinelor mici de legare a GTP provoacă sindromul Bardet-Biedl (engleză) // Nat Genet : jurnal. - 2004. - Septembrie ( vol. 36 , nr. 9 ). - P. 989-993 . - doi : 10.1038/ng1414 . — PMID 15314642 .
↑ 1 2 Gena Entrez: ARL6 ADP-ribozilation factor-like 6 . Arhivat din original pe 5 decembrie 2010. (nedefinit)

Literatură

Sheffield VC, Carmi R., Kwitek-Black A., et al. Identificarea unui locus al sindromului Bardet-Biedl pe cromozomul 3 și evaluarea unei abordări eficiente a cartografierii homozigozității // Genetica moleculară umană : jurnal. - Oxford University Press , 1995. - Vol. 3 , nr. 8 . - P. 1331-1335 . - doi : 10.1093/hmg/3.8.1331 . — PMID 7987310 .
Bonaldo MF, Lennon G., Soares MB Normalizare și scădere: două abordări pentru a facilita descoperirea genelor // Genome Res . : jurnal. - 1997. - Vol. 6 , nr. 9 . - P. 791-806 . - doi : 10.1101/gr.6.9.791 . — PMID 8889548 .
Jacobs S., Schilf C., Fliegert F., et al. 4, 6 și 7 asemănător factorului de ribozilare ADP (ARF) reprezintă un subgrup al caracterizarii familiei ARF prin schimb rapid de nucleotide și un semnal de localizare nucleară // FEBS Lett . : jurnal. - 1999. - Vol. 456 , nr. 3 . - P. 384-388 . - doi : 10.1016/S0014-5793(99)00759-0 . — PMID 10462049 .
Ingley E., Williams JH, Walker CE, et al. Un nou factor asemănător ADP-ribozilării (ARL-6), interacționează cu subunitatea SEC61beta canal conducător de proteine // FEBS Lett . : jurnal. - 1999. - Vol. 459 , nr. 1 . - P. 69-74 . - doi : 10.1016/S0014-5793(99)01188-6 . — PMID 10508919 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA Clonarea ADN-ului utilizând recombinare specifică site-ului in vitro // Genome Res . : jurnal. - 2001. - Vol. 10 , nr. 11 . - P. 1788-1795 . - doi : 10.1101/gr.143000 . — PMID 11076863 .
Wiemann S., Weil B., Wellenreuther R., et al. Către un catalog de gene și proteine umane: secvențierea și analiza a 500 de proteine complete noi care codifică ADNc uman // Genome Res . : jurnal. - 2001. - Vol. 11 , nr. 3 . - P. 422-435 . - doi : 10.1101/gr.GR1547R . — PMID 11230166 .
Pasqualato S., Renault L., Cherfils J. Proteinele Arf, Arl, Arp și Sar: o familie de proteine de legare a GTP cu un dispozitiv structural pentru comunicare „față-spate” // EMBO Rep . : jurnal. - 2003. - Vol. 3 , nr. 11 . - P. 1035-1041 . - doi : 10.1093/embo-reports/kvf221 . — PMID 12429613 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH și colab. Generarea și analiza inițială a mai mult de 15.000 de secvențe de ADNc umane și de șoarece de lungime completă // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA, et al. Starea, calitatea și extinderea proiectului ADNc complet al NIH: Colecția de gene de mamifere (MGC ) // Genome Res. : jurnal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Wiemann S., Arlt D., Huber W., et al. De la ORFeome la biologie: o conductă genomică funcțională // Genome Res . : jurnal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2136-2144 . - doi : 10.1101/gr.2576704 . — PMID 15489336 .
Rual JF, Venkatesan K., Hao T., et al. Către o hartă la scară proteomă a rețelei de interacțiune proteină-proteină umană (engleză) // Nature : journal. - 2005. - Vol. 437 , nr. 7062 . - P. 1173-1178 . - doi : 10.1038/nature04209 . — PMID 16189514 .
Mehrle A., Rosenfelder H., Schupp I., et al. Baza de date LIFEdb în 2006 // Nucleic Acids Res . : jurnal. - 2006. - Vol. 34 , nr. Problema baza de date . - P.D415-8 . doi : 10.1093 / nar/gkj139 . — PMID 16381901 .