Argonaute

Argonaut  - proteine ​​care sunt componente catalitice ale RISC ( complex de tăcere indus de ARN ) - un complex proteic care asigură tăcere genetică prin mecanismul interferenței ARN (ARNi).

Proteinele argonaute leagă micile ARN interferente ( siRNAs ) și au activitate de endonuclează împotriva ARNm complementară fragmentului de siRNA legat . [unu]

Mecanismele moleculare de legare a ARN de către proteinele Argonaute au fost stabilite folosind cristalografia cu difracție de raze X a domeniului de legare a ARN. Capătul 5’ fosforilat al catenei de ARN intră într-un buzunar principal conservat și formează contacte prin cationi divalenți (de exemplu , Mg ++ ) și prin stivuire aromatică între 5’-nucleotida din siARN și reziduul de tirozină conservat . Acest sit pare să formeze un „situs de nucleare” pentru ca ARNsi să se lege la ținta sa de ARNm. [2]

La eucariote, proteinele Argonaute au fost identificate în concentrații mari în regiunile citoplasmei celulare cunoscute sub numele de corpuri citoplasmatice , unde ARNm-urile sunt degradate. [3]

Proteinele argonaute sunt, de asemenea, implicate în formarea și reglarea activității miARN .

  1. Ago2 taie pre-miARN și formează un precursor suplimentar (ac-pre-miARN); [patru]
  2. Ago2 este, de asemenea, membru al RISC și mediază legarea microARN-urilor la 3'UTR corespunzător ARNm și inhibă translația (în unele cazuri, provoacă deadenilare și degradarea ARNm). Ago2 interacționează cu TRBP și Dicer (care procesează pre-miARN în miARN) și formează cu ei un complex triplu care se leagă și miARN, pe baza căruia RISC este asamblat în continuare prin atașarea altor proteine. [5]

Familia de proteine ​​Argonaute este reprezentată printre eucariote , unele arhei și chiar bacterii , cum ar fi Aquifex aeolicus . Conform genomicii comparative, familia Argonaute pare să fi evoluat din factorii de inițiere a translației [6] .

Rolul în susceptibilitatea la infecții virale

Șoarecii cu deficit de Argonaute 4 (AGO4) infectați cu virus gripal au titruri virale semnificativ mai mari in vivo în comparație cu șoarecii normali [7] și, de asemenea, în contrast cu șoarecii cu deficiență AGO1 sau AGO3 [8] . Astfel, activarea specifică a funcției AGO4 în celulele de mamifere poate fi o strategie antivirală eficientă.


Link -uri

  1. ↑ Rand TA, Petersen S, Du F, Wang X. (2005). Argonaute2 scindează catena anti-ghid a ARNsi în timpul activării RISC. Celula 123(4):621-9.
  2. ↑ Ma J., Yuan Y., Meister G., Pei Y., Tuschl T., Patel D. Baza structurală pentru recunoașterea 5’-specifică a ARN-ului ghid de către proteina  A. fulgidus Piwi // - 2005. - Vol. 434 , nr. 7033 . - P. 666-670 . - doi : 10.1038/nature03514 . — PMID 15800629 .
  3. ↑ Sen GL, Blau HM. (2005). Argonautul 2/RISC se află în locurile de dezintegrare a ARNm de mamifere cunoscute sub numele de corpuri citoplasmatice. Nat Cell Biol 7(6):633-6.
  4. ↑ Diederichs S., Haber DA Dual Role for Argonautes in MicroARN Processing and Posttranscriptional Regulation of MicroRNA Expression (decembrie 2007) Cell, Volumul 131, Issue 6, 14 1097-1108 PMID 18083100
  5. ↑ Chendrimada TP, Gregory RI, Kumaraswamy E, Norman J, Cooch N, Nishikura K, Shiekhattar R. (aug 2005) TRBP recrutează complexul Dicer la Ago2 pentru procesarea microARN și tăcere genetică. Nature, 4;436(7051):740-4. PMID 15973356
  6. ↑ Anantharaman V., Koonin E., Aravind L. Genomica comparativă și evoluția proteinelor implicate în metabolismul ARN  //  Nucleic Acids Res : jurnal. - 2002. - Vol. 30 , nr. 7 . - P. 1427-1464 . doi : 10.1093 / nar/30.7.1427 . — PMID 11917006 .
  7. ↑ Adiliaghdam, F., Basavappa, M., Saunders, TL, Harjanto, D., Prior, JT, Cronkite, DA, ... și Jeffrey, KL (2020). O cerință pentru Argonaute 4 în apărarea antivirală a mamiferelor. Cell reports, 30(6), 1690-1701. doi : 10.1016/j.celrep.2020.01.021 PMC 7039342 PMID 32049003
  8. ↑ Van Stry, M., Oguin, T.H., Cheloufi, S., Vogel, P., Watanabe, M., Pillai, M.R., ... & Bix, M. (2012). Susceptibilitate sporită a șoarecilor Ago1/3 dublu nul la infecția cu virusul gripal A. Journal of virology, 86(8), 4151-4157. doi : 10.1128/JVI.05303-11 PMC 3318639 PMID 22318144