BioBrick

Versiunea actuală a paginii nu a fost încă examinată de colaboratori experimentați și poate diferi semnificativ de versiunea revizuită la 3 februarie 2019; verificările necesită 8 modificări .

BioBrick  (BioBlock) - secvențe de ADN destinate asamblarii prin metoda ligaturii de restricție, care sunt folosite pentru a dezvolta și crea sisteme biologice artificiale cu anumite proprietăți [1] [2] . Din 2008, a fost recunoscut drept standardul principal pentru biologia sintetică [2] . Odată dezvoltat pe un computer, codul este de obicei injectat în celulele vii, cum ar fi Escherichia coli , pentru a le oferi noi funcții.

Ierarhia standardului

Standardul are un sistem ierarhic pe trei niveluri pe care se bazează biologia sintetică :

  1. Părți: secvență de ADN care formează o unitate funcțională (de exemplu , promotori , situsuri de legare a ribozomilor , secvențe de codificare, secvențe terminatoare etc.)
  2. Dispozitive: un set de părți complementare interconectate care au o funcție dată;
  3. Sisteme: un set de dispozitive care efectuează sarcini de nivel înalt;

Beneficiile standardului

Standardul a fost dezvoltat la MIT pentru a aplica principiile de inginerie ale abstractizării și modularității la programarea sistemelor biologice și a organismelor vii. Beneficiile abordării standardizate Biobrick :

Istoria BioBrick

2003

Standardul BioBrick a fost descris și prezentat de Tom Knight la MIT. De atunci, diverse grupuri de cercetare au început să folosească BioBrick pentru a crea noi dispozitive și sisteme biologice.

2006

În 2006, organizația non-profit BioBricks Foundation a fost fondată de ingineri și oameni de știință cu scopul de a standardiza părțile biologice în acest domeniu al științei. [3]

2008

De la începutul proiectului, peste 2.000 de BioBricks au fost eliberate publicului și sunt disponibile în Registrul părților biologice standard. BioBrick este recunoscut drept standardul lider în biologia sintetică [2]

2015

5018 participanți (280 de echipe) din 38 de țări au participat la competițiile iGEM 2015 [1]

2017

5400 de participanți (310 echipe) au participat la competițiile iGEM 2017.

2018

Catalogul de piese BioBrick avea deja peste 20.000 de părți genetice documentate. Aceste părți sunt disponibile pentru utilizare gratuită de către echipele iGEM și laboratoarele academice [2] .

Standarde alternative

Prima încercare de a crea o listă de părți biologice standardizate ale NOMAD a fost făcută în 1996 de un grup de oameni de știință condus de D. Rebatchuk. Echipa sa a prezentat o strategie de clonare pentru asamblarea fragmentelor scurte de ADN. Dar această încercare timpurie nu a fost adoptată pe scară largă. [patru]

Note

  1. ↑ Tom Knight (2003). Design vectorial idempotent pentru asamblarea standard de biocărămizi . Preluat la 26 septembrie 2014. Arhivat din original la 6 octombrie 2014.
  2. ↑ 1 2 3 Knight, Thomas F; Reshma P Shetty; Drew Andy. Inginerie Vectori BioBrick din piese BioBrick  (neopr.)  // Journal of Biological Engineering. - 2008. - 14 aprilie ( vol. 2 , nr. 5 ). - S. 1-12 . - doi : 10.1186/1754-1611-2-5 . — PMID 18410688 . Arhivat din original pe 28 septembrie 2015.
  3. ↑ Fundația BioBricks . Fundația BioBricks . Preluat la 19 martie 2018. Arhivat din original la 12 martie 2018.
  4. ↑ Rebatciuk, Dmitri; Daraselia, N.; Narita, JO NOMAD: o strategie versatilă pentru manipularea ADN-ului in vitro aplicată analizei promotorilor și designului vectorial.  (engleză)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1996. - 1 octombrie ( vol. 93 , nr. 20 ). - P. 10891-10896 . - doi : 10.1073/pnas.93.20.10891 . Arhivat din original pe 24 septembrie 2015.
 Bioinginerie
Domenii de bioinginerie
Articole similare
Oamenii de știință
Popularizatori