BioRxiv

bioRxiv
URL biorxiv.org
Comercial Nu
Tipul site-ului Știința
limbi) Engleză
Proprietar Laborator la Cold Spring Harbor
Autor Richard North, John Inglis
Începutul lucrării noiembrie 2013  ( 2013-11 )
Țară

bioRxiv (pronunțat „bio(a)rhiv”) este o arhivă electronică gratuită de lucrări științifice și preprinturi despre biologie, creată în 2013 de membrii personalului Cold Spring Harbor Laboratory , Richard Sever și John Inglis, similar cu deja popularul arXiv.org .

Autorii postează lucrări nerevizuite anterior pe bioRxiv pentru a primi feedback de la alți membri ai portalului sau pentru a afirma primatul descoperirii. Manuscrisele nu sunt revizuite înainte de publicare, dar sunt verificate inițial de către moderatori pentru a detecta plagiat. Aproximativ 30% dintre autori postează ulterior versiuni editate pe baza comentariilor primite pe portal. Ca urmare, majoritatea manuscriselor trimise la bioRxiv sunt publicate în reviste revizuite de colegi.

În noiembrie 2021, peste 140.000 de lucrări au fost postate pe portal.

Istorie

BioRxiv a fost lansat ca urmare a popularității depozitelor de preprint online , primul dintre care a fost creat de fizicianul Laboratorului Național Los Alamos , Paul Ginsparg , în 1991, portalul ArXiv.org (pronunțat [arhivă]). În momentul în care arXiv a fost creat, practica de a partaja preprinturi în domeniul fizicii era destul de comună - cercetătorii și-au trimis cu succes rapoartele nepublicate despre experimente sau versiunile preliminare ale lucrărilor înainte de publicarea în jurnal. Un astfel de schimb a făcut posibil nu numai primirea de comentarii și critici de la colegi înainte de revizuire, ci și de a preveni duplicarea datelor sau de a consolida primatul descoperirii [2] [3] . În curând arXiv a câștigat o mare popularitate și până în iulie 2021, aproximativ 1,9 milioane de lucrări au fost postate pe site [4] .

Inițial, arXiv.org a acceptat lucrări exclusiv din domeniul fizicii, dar odată cu creșterea cererii pentru alte ramuri ale științei, în 2003 Ginsparg a inițiat crearea unei secțiuni separate pentru descărcarea preprinturilor în biologie cantitativă, inclusiv statistică biologică , bioinformatică , populație . biologie . În același timp, o secțiune separată pentru preprinturi de biologie a fost deschisă de revista cu acces deschis PeerJ . Cu toate acestea, în ciuda popularității tot mai mari a acestor secțiuni în depozite (lucrările de biologie găzduite în arXiv au fost publicate ulterior în Nature și PLOS Biology ), portalurile nu au căutat să extindă în continuare posibilitățile de publicare a lucrărilor în acest domeniu [5] [6] .

În 2013, biologul molecular Richard Sever de la Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL), împreună cu colegul John Inglis, au lansat un portal similar arXiv numit bioRxiv găzduit de HighWire [ [7] [5] . BioRxiv a fost afiliat oficial cu CSHL [8] și obiectivele sale principale au fost să accelereze diseminarea cunoștințelor și să ofere oportunități pentru comentarii critice și feedback cu privire la lucrările încă nepublicate în biologie [9] . Abia în primul an de funcționare, pe portal au fost încărcate 800 de preprinturi [10] , iar în total pentru perioada 2013-2016, aproximativ 3.000 de lucrări [11] . Până în 2019, numărul acestora a crescut la 40.000 [12] . În noiembrie 2021, portalul conține date despre peste 140.000 de preprinturi [13] .

În 2016, bioRxiv a semnat un acord cu Biophysical Journal , ELife , The EMBO Journal , EMBO Molecular Medicine , EMBO Reports , G3: Genes, Genomes, Genetics , Molecular Systems Biology , conform căruia autorii preprinturilor publicate pe portal își pot trimite articolele spre revizuire direct prin bioRxiv fără a fi nevoie să reîncarce fișiere și să reintroducă informații pe site-ul revistei [11] .

Consiliul consultativ al bioRxiv include, printre alții, creatorul arXiv Paul Ginsparg și co-fondatorul Academiei Google Anurag Acharya [9] .

Cum funcționează

Numai manuscrisele care nu au fost publicate anterior în reviste științifice și care nu au fost supuse unei evaluări inter pares sunt permise pentru plasare pe bioRxiv. Atunci când publică un articol, autorii își pot caracteriza munca ca fiind nouă, pot confirma sau infirma cercetările științifice existente și, de asemenea, pot alege una dintre cele 26 de categorii tematice. După ce un articol este trimis, moderatorii îl verifică pentru conținut ofensator sau neștiințific, dar nu editează sau revizuiesc textul în sine. De obicei, articolele devin publice în câteva ore de la încărcare [14] . Ulterior, cercetătorii pot fie să publice versiuni revizuite ale lucrării, fie să adauge link-uri către publicațiile de jurnal ale preprintului [9] .

Fiecărui preprintare i se atribuie un DOI care, împreună cu alte date altmetrice și PDF, este disponibil pentru toți utilizatorii. Când un preprint este publicat ca articol într-un jurnal științific, bioRxiv actualizează versiunea veche cu un link către publicație. Articolele despre bioRxiv sunt indexate de motorul de căutare Google și Google Scholar, dar nu sunt incluse în sistemul PubMed , care stochează doar materiale evaluate de colegi [14] .

Începând cu 2016, majoritatea lucrărilor publicate pe bioRxiv au fost în biologie evolutivă , genetică și genomică [14] .

BioRxiv acceptă articole pretipărite care acoperă toate aspectele cercetării în biologie. Când postează un articol, autorul îl trimite la una dintre următoarele categorii [15] :

Influență

În 2019, cercetătorii au analizat 7.087 de lucrări trimise la bioRxiv și au comparat măsurătorile altmetrice cu lucrări nedepuse. Rezultatele au arătat că preprinturile publicate în bioRxiv au fost citate în medie cu 36% mai des și au avut valori altmetrice cu 49% mai mari [16] . Datele obținute indică un impact pozitiv pe termen lung al publicării preprinturilor asupra numărului de citări, și nu doar asupra ratei de apariție a acestora, așa cum s-a dovedit anterior în analiza lucrărilor postate pe arXiv.org [16] [17] [16] .

Aproximativ 30% din preprinturile publicate pe bioRxiv rămân nepublicate în reviste - date similare au fost obținute la analiza activității de publicare pe arXiv. În același timp, aproape jumătate din preprinturile publicate ulterior ale bioRxiv apar în jurnale Elsevier , Nature , Public Library of Science și Oxford University Press [12] . BioRxiv este cel mai popular printre cercetătorii din SUA și Marea Britanie , cu mult mai puțină popularitate în China , Rusia și Turcia [18] .

Note

  1. ↑ WorldCat  (pl.) - 1971.
  2. ↑ Pinfield, 2001 .
  3. ↑ Vivienne Bachelet. Ce sunt preprinturile? . Medwave (2017). Preluat la 1 mai 2021. Arhivat din original la 11 mai 2021.
  4. ↑ Trimiteri lunare . Universitatea Cornell. Data accesului: 37-04-2021. Arhivat 7 mai 2021.
  5. ↑ 1 2 Ewen Callaway. Preprinturile prind viață . Natura (12 noiembrie 2013). Preluat la 2 iulie 2021. Arhivat din original la 15 decembrie 2021.
  6. ↑ Ewen Callaway. Geneticienii analizează potențialul arXiv . Natura (31 iulie 2012). Preluat la 29 iunie 2021. Arhivat din original la 11 august 2021.
  7. ↑ HighWire la 25 de ani: Richard Sever (bioRxiv) se uită înapoi . High Wire (12 august 2020). Preluat la 5 iulie 2021. Arhivat din original la 9 iulie 2021.
  8. ↑ Serverul de preprint pentru biologie . CSHL (12 noiembrie 2013). Preluat la 3 iulie 2021. Arhivat din original la 9 iulie 2021.
  9. ↑ 1 2 3 Jocelyn Kaiser. Noul server Preprint își propune să fie răspunsul biologilor la arXiv al fizicienilor . Știință (12 noiembrie 2013). Preluat la 28 iunie 2021. Arhivat din original la 9 iulie 2021.
  10. ↑ Jocelyn Kaiser. BioRxiv la 1 an: Un început promițător . Știință (11 noiembrie 2014). Preluat la 29 iunie 2021. Arhivat din original la 28 iulie 2021.
  11. ↑ 1 2 preprinturi bioRxiv pot fi acum trimise direct la reviste de cercetare de top . Physics org (15 ianuarie 2016). Preluat la 29 iunie 2021. Arhivat din original la 18 martie 2018.
  12. ↑ 12 Anderson , 2019 .
  13. ↑ Toate articolele . BioRxiv. Preluat la 22 noiembrie 2021. Arhivat din original la 21 noiembrie 2021.
  14. ↑ 1 2 3 John Sever. bioRxiv: un raport de progres . ASAPbio. Preluat la 29 iunie 2021. Arhivat din original la 9 iulie 2021.
  15. ↑ Despre bioRxiv . bioRxiv. Preluat la 3 iulie 2021. Arhivat din original la 1 decembrie 2018.
  16. ↑ 1 2 3 Fraser, 2020 , p. 618-636.
  17. ↑ Gemma Conroy. Preprints-ul stimulează citările și mențiunile articolelor . Indexul naturii (9 iulie 2019). Preluat la 3 iulie 2021. Arhivat din original la 9 iulie 2021.
  18. ↑ Abdill, 2020 .

Literatură

Link -uri

  Accesați articolul Wikidata  În rețelele sociale
Site-uri tematice