Bradyrhizobium japonicum

Bradyrhizobium japonicum

Bradyrhizobium japonicum tulpina USDA 110 pe o placă cu agar
clasificare stiintifica
Domeniu:bacteriiTip de:ProteobacteriiClasă:Alfa ProteobacteriiOrdin:RhizobiumFamilie:BradyrhizobiaceaeGen:BradyrhizobiumVedere:Bradyrhizobium japonicum
Denumire științifică internațională
Bradyrhizobium japonicum
( Kirchner 1896 ) Iordania 1982
Sinonime
  • Rhizobacterium japonicum
    Kirchner 1896
  • Rhizobium japonicum
    (Kirchner 1896) Buchanan 1926     [1]

Bradyrhizobium japonicum   (lat.) este o specie de bacterii nodulare ,simbiont de soia fixator de azot saprofit ( Glycine max ). Una dintre cele mai importante specii bacteriene din punct de vedere economic [2] .

Descriere

Bacteria Gram -negativă în formă de bastonaș . Ca și alte specii din genul Bradyrhizobium crește lent în cultură și alcalinizează mediul fără ser. Din 2002, a existat o secvență de genom pentru B. japonicum . Mărimea genomului este de 9105828 perechi de baze, conținutul secvențelor GC este de aproximativ 64,1% [3] .

B. japonicum este capabil să degradeze catechina pentru a forma acid phloroglucic , care este apoi decarboxilat pentru a forma phloroglucinum , care este dehidroxilat la rezorcinol . Resorcinolul, la rândul său, este hidroxilat pentru a forma hidroxichinol [4] .

Respirație cu nitrați

B. japonicum posedă gena nosRZDFYLX , care codifică o enzimă implicată în denitrificare. Această enzimă are două subunități catalitice, Cu-a și Cu-z (cu mai multe resturi de histidină). Declanșează o cascadă secvenţială de expresie a genelor, denumită „FixJ-FixK2-FixK1”, care este sensibilă la concentrația de oxigen. FixJ reglează pozitiv FixK2, care activează genele de respirație a nitraților, precum și proteina FixK1. Mutanții FixK1 nu sunt capabili de respirație a nitraților din cauza unui defect în subunitatea catalitică care conține cupru (Cu-z) din gena nosRZDFYLX [5] .

Utilizare

Această bacterie este adesea folosită ca organism model pentru studiul enzimelor respiratorii [6] . Tulpina USDA 110 de B. japonicum , care a fost izolată pentru prima dată din noduli de soia în Florida, SUA, în 1957, este utilizată pe scară largă pentru cercetări în domeniul geneticii moleculare, fiziologiei și ecologiei [7] . Acest lucru se datorează faptului că tulpina B. japonicum USDA110 are un nivel mai ridicat de fixare a azotului decât alte tulpini [7] .

Note

  1. ↑ Transfer de Rhizobium japonicum Buchanan 1980 la Bradyrhizobium gen. nov., un gen de bacterii nodulare rădăcinoase cu creștere lentă din plante leguminoase. Int. J. Syst. Bacteriol., 1982, 32, 136-139.
  2. ↑ AB Hollis, WE Kloos și GE Elkan. ADN: studii de hibridizare ADN ale Rhizobium japonicum și   Rhizobiaceae înrudite // Microbiologie. — Societatea de microbiologie, 1981. - Vol. 123 . - P. 215-222 . - doi : 10.1099/00221287-123-2-215 .
  3. ↑ Takakazu Kaneko, Yasukazu Nakamura, Shusei Sato, Kiwamu Minamisawa, Toshiki Uchiumi, Shigemi Sasamoto, Akiko Watanabe, Kumi Idesawa, Mayumi Iriguchi, Kumiko Kawashima, Mitsuyo Kohara, Midori Matsumoto, Sayakazu Shimpoo, Hisa, Tsuyukobu, Hisa, Sayakazu, Tsuyukobu tabata. Secvența genomică completă a bacteriei simbiotice care fixează azotul Bradyrhizobium japonicum USDA110   : jurnal . - 2002. - P. 189-197 .
  4. ↑ Waheeta Hopper & A. Mahadevan. Degradarea catechinei de către Bradyrhizobium japonicum  (engleză)  : jurnal. — 1997.
  5. ↑ D. Nellen-Anthamatten, P. Rossi et al. Bradyrhizobium japonicum, FixK2, un distribuitor crucial în cascada de reglementare dependentă de FixLJ pentru controlul genelor induse de niveluri scăzute de oxigen  //  [Journal of Bacteriology] : jurnal. - 1998. - Vol. 180 , nr. 19 . - P. 5251-5255 .
  6. ^ Westenberg , DJ Bradyrhizobium japonicum (link indisponibil) . Universitatea de Știință și Tehnologie din Missouri (2008). Preluat la 11 iulie 2011. Arhivat din original la 16 septembrie 2012. 
  7. ↑ 1 2 [EBI] Institutul European de Bioinfomatică Bacteria Genomes - BRADYRHIZOBIUM JAPONICUM . Institutul European de Bioinfomatică (2011). Preluat la 12 iulie 2011. Arhivat din original la 14 mai 2011.