Histon deacetilaza 8

PDB se bazează pe 1t64.

Structuri disponibile

Căutare ortolog: PDBe , RCSB

Lista ID-urilor PDB
1T64 , 1T67 , 1T69 , 1VKG , 1W22 , 2V5W , 2V5X , 3EW8 , 3EWF , 3EZP , 3EZT , 3F06 , 3F07 , 3F0R , _ 3MZ3 ,_ 3MZ3 , _ _ 3MZ3 _ _ _ _

Identificatori

Simbol

HDAC8 ; CDLS5; HD8; HDACL1; MRXS6; RPD3; WTS

ID-uri externe

OMIM: 300269 MGI : 1917565 HomoloGene : 41274 IUPHAR : ChEMBL : 3192 GeneCards : HDAC8 Gene

numărul CE

3.5.1.98

ontologie genetică
Funcţie	• activitatea histon deacetilazei • legarea factorului de transcripție • Activitate histon deacetilazei dependentă de NAD (specific H3-K14) • legarea ionilor metalici • Activitate histon deacetilazei dependentă de NAD (specifică H3-K9) • Activitate histon deacetilazei dependentă de NAD (specific H4-K16) • Activitate histon deacetilazei dependentă de NAD (specifică H3-K18)
componenta celulara	• complex de histon deacetilază • cromozom nuclear • nucleu • citoplasmă • citosol
proces biologic	• reglarea negativă a transcripției din promotorul ARN polimerazei II • ciclul celular mitotic • asamblarea sau dezasamblarea cromatinei • transcripție, modelat cu ADN • coeziune cromatidei surori • modificarea cromatinei • deacetilarea histonei H3 • deacetilarea histonei H4 • reglarea localizării coezinei la cromatină
Surse: Amigo / QuickGO

ortologii

Vedere

Uman

Mouse

Entrez

RefSeq (ARNm)

RefSeq (proteină)

Locus (UCSC)

Chr HG1438_PATCH:
71,55 – 71,79 Mb

Chr X:
102,28 – 102,51 Mb

Căutați în PubMed

[unu]

[2]

Histone deacetilaza 8 ( Histone deacetilaza 8 ) este o enzimă codificată la om de gena HDAC8 [1] [2] [3] .

Funcția

Histonele joacă un rol critic în reglarea transcripției , progresia ciclului celular și procesele de dezvoltare. Acetilarea/dezacetilarea histonelor modifică structura cromozomială și afectează accesul factorilor de transcripție la ADN . Proteina codificată de această genă aparține clasei I din familia histonă deacetilază/acuc/Apha. Are activitate histon deacetilază și reprimă transcripția atunci când este legat de un promotor [3] .

Histone deacetilaza 8 este implicată în morfogeneza craniului [4] și controlul metabolic al complexului de transcripție ERR-alfa / PGC1-alfa [5] [5] .

Semnificație clinică

HDAC8 a fost asociat cu o serie de stări de boală, în special leucemia mieloidă acută , și este, de asemenea, asociat cu citoscheletul de actină din celulele musculare netede. siRNA -urile care vizează HDAC8 au demonstrat efecte anticancer [6] . Inhibarea apoptozei induse de către HDAC8 a fost observată în limfoamele cu celule T [7] . În plus, enzima HDAC8 este implicată în patogeneza neuroblastomului [8] . Astfel, există interes pentru dezvoltarea inhibitorilor selectivi pe baza HDAC8 [9] [10] .

Interacțiuni

ERR-alfa [5] .

Vezi și

Histone deacetilaze

Note

↑ McDonell N., Ramser J., Francis F., Vinet MC, Rider S., Sudbrak R., Riesselman L., Yaspo ML, Reinhardt R., Monaco AP, Ross F., Kahn A., Kearney L., Buckle V., Chelly J. Caracterizarea unei regiuni extrem de complexe în Xq13 și maparea a trei puncte de întrerupere izodicentrice asociate cu preleucemie // Genomics : journal. - Academic Press , 2000. - Mai ( vol. 64 , nr. 3 ). - P. 221-229 . - doi : 10.1006/geno.2000.6128 . — PMID 10756090 .
↑ Van den Wyngaert I., de Vries W., Kremer A., Neefs J., Verhasselt P., Luyten WH, Kass SU Clonarea și caracterizarea histonei deacetilazei umane 8 // FEBS Lett : jurnal. - 2000. - August ( vol. 478 , nr. 1-2 ). - P. 77-83 . - doi : 10.1016/S0014-5793(00)01813-5 . — PMID 10922473 .
↑ 1 2 Gena Entrez: HDAC8 histon deacetilaza 8 . (nedefinit)
↑ Haberland M., Mokalled MH, Montgomery RL, Olson EN Controlul epigenetic al morfogenezei craniului prin histone deacetilază 8 // Genes Dev . : jurnal. - 2009. - iulie ( vol. 23 , nr. 14 ). - P. 1625-1630 . - doi : 10.1101/gad.1809209 . — PMID 19605684 .
↑ 1 2 Wilson BJ, Tremblay AM, Deblois G., Sylvain-Drolet G., Giguère V. Un comutator de acetilare modulează activitatea transcripțională a receptorului alfa legat de estrogen // Mol . Endocrinol. : jurnal. - 2010. - iulie ( vol. 24 , nr. 7 ). - P. 1349-1358 . — doi : 10.1210/me.2009-0441 . — PMID 20484414 .
^ Gallinari P., Di Marco S., Jones P., Pallaoro M., Steinkühler C. HDACs, histone deacetylation and gene transcription: from molecular biology to cancer therapeutics // Cell Res . : jurnal. - 2007. - Martie ( vol. 17 , nr. 3 ). - P. 195-211 . - doi : 10.1038/sj.cr.7310149 . — PMID 17325692 .
↑ Balasubramanian S., Ramos J., Luo W., Sirisawad M., Verner E., Buggy JJ . - 2008. - Mai ( vol. 22 , nr. 5 ). - P. 1026-1034 . - doi : 10.1038/leu.2008.9 . — PMID 18256683 .
↑ Oehme I., Deubzer HE, Wegener D., Pickert D., Linke JP, Hero B., Kopp-Schneider A., Westermann F., Ulrich SM, von Deimling A., Fischer M., Witt O. Histone deacetilază 8 în neuroblastom tumorigenesis (engleză) // Clin. Cancer Res. : jurnal. - 2009. - ianuarie ( vol. 15 , nr. 1 ). - P. 91-9 . - doi : 10.1158/1078-0432.CCR-08-0684 . — PMID 19118036 .
↑ Patil V., Sodji QH, Kornacki JR, Mrksich M., Oyelere AK 3-Hydroxypyridin-2-thione ca nou grup de legare a zincului pentru inhibarea selectivă a histonei deacetilazei // Journal of Medicinal Chemistry : jurnal. - 2013. - Mai ( vol. 56 , nr. 9 ). - P. 3492-3506 . doi : 10.1021 / jm301769u . — PMID 23547652 .
↑ Suzuki T., Ota Y., Ri M., Bando M., Gotoh A., Itoh Y., Tsumoto H., Tatum PR, Mizukami T., Nakagawa H., Iida S., Ueda R., Shirahige K. ., Miyata N. Descoperirea rapidă a inhibitorilor extrem de puternici și selectivi ai histonei deacetilazei 8 folosind chimia clic pentru a genera biblioteci candidate // Journal of Medicinal Chemistry : jurnal. - 2012. - noiembrie ( vol. 55 , nr. 22 ). - P. 9562-9575 . doi : 10.1021 / jm300837y . — PMID 23116147 .

Literatură

Waltregny D., De Leval L., Glénisson W., Ly Tran S., North BJ, Bellahcène A., Weidle U., Verdin E., Castronovo V. Exprimarea histonei deacetilazei 8, o histone deacetilazei de clasa I, este restricționată la celulele care prezintă diferențiere musculară netedă în țesuturile umane normale. (engleză) // Am J Pathol. : jurnal. - 2004. - Vol. 165 , nr. 2 . - P. 553-564 . - doi : 10.1016/S0002-9440(10)63320-2 . — PMID 15277229 .
Glénisson W., Waltregny D., Tran SL, North BJ, Verdin E., Colige A., Castronovo V. Histone deacetilaza HDAC8 se asociază cu alfa-actina mușchilor netezi și este esențială pentru contractilitatea celulelor musculare netede. (Engleză) // Jurnalul FASEB : jurnal. — Federația Societăților Americane pentru Biologie Experimentală, 2005. - iunie ( vol. 19 , nr. 8 ). - P. 966-968 . - doi : 10.1096/fj.04-2303fje . — PMID 15772115 .
Wedel T., Van Eys GJ, Waltregny D., Glénisson W., Castronovo V., Vanderwinden JM. Markeri noi de mușchi neted dezvăluie anomalii ale musculaturii intestinale în tulburările severe de motilitate colorectală. (engleză) // Neurogastroenterol Motil. : jurnal. - 2006. - Vol. 18 , nr. 7 . - P. 526-538 . - doi : 10.1111/j.1365-2982.2006.00781.x . — PMID 16771768 .
Verdin E., Dequiedt F., Kasler HG Clasa II histon deacetilaze: regulatori versatili. (engleză) // Trends Genet. : jurnal. - 2003. - Vol. 19 , nr. 5 . - P. 286-293 . - doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . — PMID 12711221 .
Hu E., Chen Z., Fredrickson T., și colab. Clonarea și caracterizarea unei noi histon deacetilaze umane de clasa I care funcționează ca un represor al transcripției. (engleză) // J. Biol. Chim. : jurnal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 20 . - P. 15254-15264 . - doi : 10.1074/jbc.M908988199 . — PMID 10748112 .
Buggy JJ, Sideris ML, Mak P., et al. Clonarea și caracterizarea unei noi histon deacetilaze umane, HDAC8. (engleză) // Biochim. J. : jurnal. - 2001. - Vol. 350 , nr. 1 . - P. 199-205 . - doi : 10.1042/0264-6021:3500199 . — PMID 10926844 .
Amann JM, Nip J., Strom DK, et al. ETO, o țintă a t (8; 21) în leucemia acută, face contacte distincte cu multiple histon deacetilaze și leagă mSin3A prin domeniul său de oligomerizare. (engleză) // Mol. celulă. Biol. : jurnal. - 2001. - Vol. 21 , nr. 19 . - P. 6470-6483 . - doi : 10.1128/MCB.21.19.6470-6483.2001 . — PMID 11533236 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH și colab. Generarea și analiza inițială a mai mult de 15.000 de secvențe de ADNc umane și de șoarece de lungime completă. (engleză) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Durst KL, Lutterbach B., Kummalue T., et al. Proteina de fuziune inv(16) se asociază cu corepresori prin intermediul unui domeniu de lanț greu al miozinei musculare netede. (engleză) // Mol. celulă. Biol. : jurnal. - 2003. - Vol. 23 , nr. 2 . - P. 607-619 . - doi : 10.1128/MCB.23.2.607-619.2003 . — PMID 12509458 .
Rodriguez M., Yu X., Chen J., Songyang Z. Specificitățile de legare la fosfopeptide ale domeniilor BRCA1 COOH-terminal (BRCT). (engleză) // J. Biol. Chim. : jurnal. - 2004. - Vol. 278 , nr. 52 . - P. 52914-52918 . - doi : 10.1074/jbc.C300407200 . — PMID 14578343 .
Johnson JM, Castle J., Garrett-Engele P., et al. Studiu la nivel de genom al splicing-ului pre-ARNm alternativ uman cu microarrays de joncțiune de exon. (engleză) // Știință: jurnal. - 2004. - Vol. 302 , nr. 5653 . - P. 2141-2144 . - doi : 10.1126/science.1090100 . — PMID 14684825 .
Lee H., Rezai-Zadeh N., Seto E. Reglarea negativă a activității histon deacetilazei 8 de către protein kinaza A ciclică dependentă de AMP // Mol . celulă. Biol. : jurnal. - 2004. - Vol. 24 , nr. 2 . - P. 765-773 . - doi : 10.1128/MCB.24.2.765-773.2004 . — PMID 14701748 .
Vannini A., Volpari C., Filocamo G., et al. Structura cristalină a unei histon deacetilaze eucariote dependente de zinc, HDAC8 umană, complexată cu un inhibitor al acidului hidroxamic. (engleză) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2004. - Vol. 101 , nr. 42 . - P. 15064-15069 . - doi : 10.1073/pnas.0404603101 . — PMID 15477595 .
Waltregny D., North B., Van Mellaert F., et al. Screening-ul exprimării histon-deacetilazelor (HDAC) în cancerul de prostată uman dezvăluie profiluri HDAC distincte de clasa I între celulele epiteliale și cele stromale. (engleză) // European Journal of Histochemistry : jurnal. - 2005. - Vol. 48 , nr. 3 . - P. 273-290 . — PMID 15590418 .
Waltregny D., Glénisson W., Tran SL, et al. Histone deacetilaza HDAC8 se asociază cu alfa-actina musculară netedă și este esențială pentru contractilitatea celulelor musculare netede. (Engleză) // Jurnalul FASEB : jurnal. — Federația Societăților Americane pentru Biologie Experimentală, 2006. - Vol. 19 , nr. 8 . - P. 966-968 . - doi : 10.1096/fj.04-2303fje . — PMID 15772115 .
Gantt SL, Gattis SG, Fierke CA Activitatea catalitică și inhibarea histonei deacetilazei umane 8 sunt dependente de identitatea ionului metalic al situsului activ. (engleză) // Biochimie : jurnal. - 2006. - Vol. 45 , nr. 19 . - P. 6170-6178 . doi : 10.1021/ bi060212u . — PMID 16681389 .
Lee H., Sengupta N., Villagra A., et al. Histone deacetilaza 8 protejează proteina telomerilor 1B (hEST1B) uman, din ce în ce mai scurt, de degradarea mediată de ubiquitină. (engleză) // Mol. celulă. Biol. : jurnal. - 2006. - Vol. 26 , nr. 14 . - P. 5259-5269 . - doi : 10.1128/MCB.01971-05 . — PMID 16809764 .
Vannini A., Volpari C., Gallinari P., et al. Legarea substratului la histon deacetilaze, așa cum este arătat de structura cristalină a complexului HDAC8-substrat. (ing.) // Rapoarte EMBO : jurnal. - 2007. - Vol. 8 , nr. 9 . - P. 879-884 . - doi : 10.1038/sj.embor.7401047 . — PMID 17721440 .
Nakagawa M., Oda Y., Eguchi T., et al. Profilul de expresie al histon deacetilazelor de clasa I în țesuturile canceroase umane. (engleză) // Oncol. Reprezentant. : jurnal. - 2007. - Vol. 18 , nr. 4 . - P. 769-774 . doi : 10.3892 / or.18.4.769 . — PMID 17786334 .

Link -uri

MeSH HDAC8+proteină,+umană