Thermococcaceae

Thermococcaceae
Thermococcus gammatolerans
clasificare stiintifica
Domeniu:ArchaeaTip de:EuryarheotesClasă:Thermococci Zillig și Reysenbach 2002Ordin:Thermococcales Zillig 1988Familie:Thermococcaceae
Denumire științifică internațională
Thermococcaceae Zillig 1988
genul tip
Thermococcus Zillig 1983
Sistematică la Wikispecies Imagini la Wikimedia Commons ESTE   951477 NCBI   2259 EOL   7929

Thermococcaceae  (lat.) ( Termococci ) este o familie dearhee din tipul Euryarchaeota , singura din ordinul Thermococcales și din clasa Thermococci [1] [2] (sinonim cu Protoarchaea Cavalier-Smith 2002 [3] ). Familia cuprinde 3 genuri, peste 40 de specii cunoscute, ceea ce o face cea mai numeroasă familie din domeniul arheilor. Probabil că doar o mică parte din speciile din această clasă existente în natură a fost studiată [4] .

Descriere

Se caracterizează printr-o temperatură foarte ridicată de creștere optimă (80 ° C mai sus) la un pH aproape de neutru (optim pentru majoritatea se află în intervalul 6-8) și salinitate apropiată de cea a apei de mare. Cele mai comune habitate sunt gurile hidrotermale subacvatice. Reprezentanți ai genului Thermococcus au fost găsiți și în hidrotermele terestre din Noua Zeelandă. În prezent nu există informații despre locuirea termococilor în ecosistemele aerobe și cu temperatură scăzută și în medii cu pH ridicat sau scăzut [4] .

Clasificare

Din iunie 2017, familia include următorii taxoni [1] [5] :

• Genul Palaeococcus Takai et al. 2000 [6]
  • Palaeococcus ferrophilus Takai și colab. 2000 ( specie tip )
  • Palaeococcus helgesonii Amend și colab. 2006
  • Palaeococcus pacificus Zeng și colab. 2013
• Genul Pyrococcus Fiala și Stetter 1986 [7]
  • Pyrococcus abyssi Erauso et al. 1993 - absent de la LPSN
  • Pyrococcus endeavori - absent din LPSN
  • Pyrococcus furiosus Fiala și Stetter 1986 (specie tip)
  • Pyrococcus glycovorans Barbier et al. 1999
  • Pyrococcus horikoshii González și colab. 1999
  • Pyrococcus kukulkanii Callac și colab. 2016
  • Pyrococcus woesei Zillig 1988
  • Pyrococcus yayanosii Birrien și colab. 2011
• Genul Thermococcus Zillig 1983 [8]
  • Thermococcus acidaminovorans Dirmeier și colab. 2001
  • Thermococcus aegaeus corrig. Arab şi colab. 2000
  • Thermococcus aggregans Canganella și colab. 1998
  • Thermococcus alcaliphilus Keller și colab. 1997
  • Thermococcus atlanticus Cambon-Bonavita et al. 2004
  • Thermococcus barophilus Marteinsson et al. 1999
  • Thermococcus barossii Duffaud et al. 2005
  • Thermococcus celer Zillig 1983 (specie tip)
  • Thermococcus celericrescens Kuwabara și colab. 2007
  • Thermococcus chitonophagus Huber și Stetter 1996
  • Thermococcus cleftensis Hensley și colab. 2014
  • Thermococcus coalescens Kuwabara și colab. 2005
  • Thermococcus eurythermalis Zhao și colab. 2015
  • Thermococcus fumicolans Godfroy și Meunier 1996
  • Thermococcus gammatolerans Jolivet și colab. 2003
  • Thermococcus gorgonarius Miroshnichenko și colab. 1998
  • Thermococcus guaymasensis Canganella et al. 1998
  • Thermococcus hydrothermalis Godfroy și colab. 1997
  • Thermococcus kodakarensis corrig. Atomi și colab. 2005
  • Thermococcus litoralis Neuner et al. 2001
  • Thermococcus marinus - absent din LPSN
  • Thermococcus mexicalis - absent din LPSN
  • Thermococcus nautili Gorlas et al. 2014
  • Thermococcus onnurineus Bae și colab. 2006 - absent de la LPSN
  • Thermococcus pacificus Miroshnichenko și colab. 1998
  • Thermococcus paralvinellae Hensley et al. 2014
  • Thermococcus peptonophilus González și colab. 1996
  • Thermococcus piezophilus Dalmasso et al. 2016 - nu în LPSN
  • Thermococcus prieurii Gorlas et al. 2013
  • Thermococcus profundus Kobayashi și Horikoshi 1995
  • Thermococcus radiotolerans - absent din LPSN
  • Thermococcus sibiricus Miroshnichenko și colab. 2001
  • Thermococcus siculi Grote et al. 2000
  • Thermococcus stetteri Miroshnichenko 1990
  • Thermococcus thioreducens Pikuta et al. 2007
  • Thermococcus waimanguensis - absent din LPSN
  • Thermococcus waiotapuensis González și colab. 2001
  • Thermococcus zilligii Ronimus et al. 1999

Note

1. ↑ 1 2 Clasificarea domeniilor și phyla - Clasificarea ierarhică a procariotelor (bacterii) : Versiunea 2.0  : [ ing. ]  // LPSN. - 2016. - 2 octombrie.
2. ↑ Browser taxonomie : Thermococci  : [ ing. ]  // NCBI.  (Accesat: 23 iulie 2017) .
3. ↑ Clasa Protoarchaea  : [ ing. ]  // LPSN.  (Accesat: 23 iulie 2017) .
4. ↑ 1 2 Slobodkina G. B. Detectarea moleculară a reprezentanților arheilor hipertermofile și caracterizarea ADN polimerazei termostabile arheale Arhivat 9 mai 2012.  : dizertaţie ... candidat la ştiinţe biologice: 03.00.07. - M. , 2005. - 118 p. : bolnav. - RSL OD.
5. ↑ Browser taxonomie: Thermococcaceae  : [ ing. ]  // NCBI.  (Accesat: 23 iulie 2017) .
6. ↑ Genul Palaeococcus  : [ ing. ]  // LPSN.  (Accesat: 23 iulie 2017) .
7. ↑ Genul Pyrococcus  : [ ing. ]  // LPSN.  (Accesat: 23 iulie 2017) .
8. ↑ Genul Thermococcus  : [ ing. ]  // LPSN.  (Accesat: 23 iulie 2017) .

Literatură

• Cavalier-Smith T. Originea neomurană a arheebacteriilor, rădăcina nebacteriană a arborelui universal și megaclasificarea bacteriană  (engleză)  // Int. J. Syst. Evol. microbiol. : jurnal. - 2002. - Vol. 52 , nr. Pt 1 . - P. 7-76 . — PMID 11837318 .  (link indisponibil)
• Woese CR, Kandler O., Wheelis ML Către un sistem natural de organisme: propunere pentru domeniile Archaea, Bacteria și Eucarya  (engleză)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1990. - Vol. 87 , nr. 12 . - P. 4576-4579 . - doi : 10.1073/pnas.87.12.4576 . - . — PMID 2112744 .
• Zillig W., Reysenbach AL Clasa IV (sic) [V]. Clasa termococilor. nov. // Manualul lui Bergey de bacteriologie sistematică Volumul 1: Archaea și bacteriile profund ramificate și fototrofice  (engleză) / DR Boone și RW Castenholz, eds. — al 2-lea. - New York: Springer Verlag , 2001. - P. 169. - ISBN 978-0387987712 .
• Atomi H., Fukui T., Kanai T., Morikawa M. și Imanaka T. 2004. Descrierea Thermococcus kodakaraensis sp. nov., un arheon hipertermofil bine studiat, reoprtat anterior ca Pyrococcus sp. KOD1 . Archaea 1 : 263-267.
• Fukuda W., Ismail YS, Fukui T., Atomi H. și Imanaka T. 2005. Caracterizarea unei enzime malice arheale din arheonul hipertermofil Thermococcus kodakaraensis KOD1 . Archaea 1 : 293-301.
• Fukui T., Atomi H., Kanai T., Matsumi R., Fujiwara S. și Imanaka T. 2005. Secvența completă a genomului a arheonului hipertermofil Thermococcus kodakaraensis KOD1 și comparație cu genomii Pyrococcus . Genome Research 15 : 352-363.
• Jolivet E., L'Haridon S., Corre E., Forterre P., Prieur D. 2003. Thermococcus gammatolerans sp. nov., un arheon hipertermofil dintr-un canal hidrotermal de adâncime care rezistă radiațiilor ionizante . Jurnalul Internațional de Microbiologie Sistematică și Evolutivă 53 : 847-851.
• Miroshnichenko ML, Gongadze GM, Rainey FA, ​​​​Kostyukova AS, Lysenko AM, Chernyh NA și Bonch-Osmolovskaya EA 1998. Thermococcus gorgonarius sp. nov. și Thermococcus pacificus sp. nov.: arhei heterotrofe extrem de termofile din gurile calde submarine din Noua Zeelandă . Jurnalul Internațional de Bacteriologie Sistematică 48 : 23-29.

Link -uri

• Referințe despre arheile hipertermofile .