Bacterioclorofilele

Bacterioclorofilele  sunt un grup eterogen de pigmenți tetrapirolici fotosintetici care sunt sintetizați de diferite bacterii fototrofe anoxigenice care efectuează fotosinteza fără evoluție de oxigen .

Proprietățile spectrale ale bacterioclorofilelor din celule diferă semnificativ de soluții și sunt determinate de interacțiunile necovalente ale moleculelor lor cu proteinele care le conțin, precum și între ele.

Structura chimică a bacterioclorofilelor

Bacterioclorofilele a , b și g  sunt bacterioclorine , adică conțin un macrociclu bacteriocloric cu două inele pirol reduse (II și IV).

Bacterioclorofilele c-f , ca și clorofilele, au un inel de macrociclu de clor cu un singur inel pirolic complet redus IV. Spre deosebire de toate celelalte clorofile și bacterioclorofile, le lipsește reziduul -COOCH 3 în poziția R5 , care este caracteristic tuturor celorlalte clorofile și bacterioclorofile. Fiecare dintre aceste bacterioclorofile are mai multe forme, diferă în radicalii R 3 și R 4 , precum și în alcoolul de esterificare R 5 [1] [2] .

Nume Structura R1 _ R2 _ R3 _ Comunicare C7-C8 R4 _ R5 R6 _ R7 _
Bacterioclorofila a –CO–CH 3 –CH3a _ _ –CH2CH3 _ _ _ singur -CH3 _ -CO-O-CH 3 -fitil

-geranilgeranil

-H
Bacterioclorofila  b -CO- CH3 -CH3a _ _ =CH- CH3 singur –CH3 _ –CO–O–CH 3 -fitil – H
Bacterioclorofila c –CHOH– CH3 –CH3 _ –C 2 H 5 b
–C 3 H 7
–C 4 H 9
dubla –CH3 –C2H5 _ _ _ _
– H Farnezil etc. –CH3 _
Bacterioclorofila d –CHOH– CH3 –CH3 _ –C 2 H 5 b
–C 3 H 7
–C 4 H 9
dubla –CH3 –C2H5 _ _ _ _
– H Farnezil etc. – H
Bacterioclorofila e –CHOH– CH3 –CHO –C 2 H 5 b
–C 3 H 7
–C 4 H 9
dubla –CH3 –C2H5 _ _ _ _
– H Farnezil etc. –CH3 _
Bacterioclorofila f –CHOH– CH3 –CHO –C 2 H 5 b
–C 3 H 7
–C 4 H 9
dubla ––CH3 –C2H5 _ _ _ _
– H Farnezil etc. – H
Bacterioclorofila g –CH = CH2 –CH3a _ _ \u003d CH-CH 2 singur –CH3 _ –CO–O–CH 3 –geranilgeranil – H

Proprietăți chimice

Bacterioclorofilele sunt instabile la lumină, acizi și agenți oxidanți. În solvenții polari (de exemplu, în metanol), aceștia suferă ușor alomerizare; în prezenţa acizilor pierd atomul central de magneziu (sunt feofitinizat) şi/sau restul de esterificare (fitol/farnesol/geranilgeriniol etc.) [3] .

Bacterioclorofilele b   și g , având un reziduu de etiliden la C-8, izomerizează într-un mediu ușor acid pentru a forma cloruri. Bacterioclorofila g este deosebit de ușor de izomerizat , rezultând clorofila a G [4] .

Sub acțiunea oxigenului în moleculele de bacterioclorofile are loc o ruptură oxidativă a inelului V cu cinci membri; în viitor, reziduurile acide formate la atomii C-13 și C-14 se pot închide din nou într-un inel anhidridă cu șase atomi cu formarea de bacteriopurpurine sau purpurine [3] [5] .  

Biosinteza

O schemă simplificată pentru biosinteza bacterioclorofilidelor a, b și g , precum și a (E,M)-bacterioclorofilidelor c-e [6] [7] este prezentată în figură.

Anterior, se presupunea că primul pas în biosinteza bacterioclorofilelor c-e, formarea inelului V fără un substituent carboximetil la C13 2 , poate avea loc chiar înainte de formarea 3,8-divinil-protoclorofilidei a [8] . Acest lucru este considerat în prezent puțin probabil [6] [9] .

Ultima etapă a biosintezei, conversia bacterioclorofilidelor în bacterioclorofile, se realizează cu ajutorul esterazelor codificate de genele BchG în bacterioclorofilele a, b și g și BchK în clorofilele-clorofile. La sinteza formelor metilate de bacterioclorofile c-e participă, de asemenea , metilaza C121 - carbon BchR și C82 - metilaza BchQ. Aparent, substraturile lor sunt orice clorofilide cu un reziduu hidroximetil la C3, adică metilarea poate avea loc în orice stadiu după formarea 8-etil-12-metil-bacterioclorofilidei d .

Distribuție

Pigmentul cel mai răspândit al bacteriilor fototrofice anoxigenice este bacterioclorofila a . Este pigmentul de clor predominant în centrele de reacție ale majorității proteobacteriilor fototrofe, ale tuturor bacteriilor verzi cu sulf (Chlorobiaceae) și ale fototrofelor anoxigenice filamentoase (Chloroflexia). La câteva proteobacterii fototrofe, bacterioclorofila a este complet înlocuită cu bacterioclorofila b . Bacterioclorofila g se găsește într-un singur grup de bacterii, mic ca număr de specii și distribuție, heliobacteriile .

Bacterioclorofilele c-f sunt prezente exclusiv în clorozomi, complexe speciale de antene fotosintetice care se găsesc în toate bacteriile verzi cu sulf (Chlorobiales) , unele fototrofe anoxigenice filamentoase (Chloroflexia), precum și în acidobacteria fotoheterotrofă recent descoperită Chloracidobacterium thermophilum10 .

Pigment Grupul de bacterii Absorbție maximă în infraroșu in vivo ( nm )
Bacterioclorofila  a Bacteriile violet (majoritate), Chlorobiaceae, Chloroflexales și Chloracidobacterium thermophilum 805-815, 830-890
Bacterioclorofila b Bacteriile violet (unele) 835-850, 1020-1040
Bacterioclorofila c Chlorobiaceae (tulpini verzi) majoritatea Chloroflexia , Chloracidibacterium thermophilum 745-755
Bacterioclorofila  d tulpini verzi de Chlorobiaceae , Chloronema ( Chloroflexia ) 705-740
Bacterioclorofila e tulpini brune de Chlorobiaceae 719-726
Bacterioclorofila f unele tulpini de laborator ale Chlorobiaceae ~705-707
Bacterioclorofila g Heliobacteriile 670-788

Note

  1. Scheer, H. (2006). O privire de ansamblu asupra clorofilelor și bacterioclorofilelor: biochimie, biofizică, funcții și aplicații   În: B. Grimm et al. (eds): Clorofile și bacterioclorofile. Springer Olanda. (pag. 1-26)
  2. Orf, GS, Blankenship, RE (2013). Complexe de antene de clorozom din bacterii fotosintetice verzi. Cercetarea fotosintezei ,  116 (2-3), p. 15-331.
  3. 1 2 Keely, BJ (2006). Geochimia clorofilelor. În  Chlorophylls and Bacteriochlorophylls  (p. 535-561). Springer Olanda.
  4. Kobayashi, M., Hamano, T., Akiyama, M., Watanabe, T., Inoue, K., Oh-oka, H., Amesz J., Yamamura M., Kise, H. (1998). Izomerizarea independentă de lumină a bacterioclorofilei g la clorofila a catalizată de acizi slabi in vitro. Analytica chimica acta ,  365 (1), 199-203.
  5. Grin, MA, & Mironov, AF (2008). Bacteriocloruri sintetice și naturale: sinteză, proprietăți și aplicații. În: Procese chimice cu participare de compuși biologici și înrudiți: aspecte biofizice și chimice ale porfirinelor, pigmenților, medicamentelor, polimerilor și nanofibrelor biodegradabili , 5.
  6. 1 2 Liu, Z. și Bryant, D. A. (2011). Identificarea unei gene esențiale pentru primul pas angajat în biosinteza bacterioclorofilei c. Journal of Biological Chemistry ,  286 (25), 22393-22402.
  7. Tsukatani Y., Yamamoto H., Harada J., Yoshitomi T., Nomata J., Kasahara M., Mizoguchi T., Fujita Y., Tamiaki H. (2013). O cale de biosinteză ramificată în mod neașteptat pentru bacterioclorofila b este capabilă să absoarbă lumina în infraroșu apropiat. Rapoarte științifice ,  3 .
  8. Frigaard, NU, Chew, AGM, Maresca, JA, & Bryant, D.A. (2006). Biosinteza bacterioclorofilei în bacteriile verzi. În  Chlorophylls and Bacteriochlorophylls  (p. 201-221). Springer Olanda.
  9. Harada, J., Teramura, M., Mizoguchi, T., Tsukatani, Y., Yamamoto, K., & Tamiaki, H. (2015). Conversia stereochimică a grupării C3-vinil în grupare 1-hidroxietil în bacterioclorofila c de către hidrazazele BchF și BchV: adaptarea bacteriilor cu sulf verde la medii cu lumină limitată. Molecular Microbiology ,  98 (6), 1184-1198.
  10. Bryant, Donald A.; Costas, A.M.; Maresca, JA & Chew, AG (2007-07-27), Candidatus Chloracidobacterium thermophilum: An Airobic Phototrophic Acidobacterium , Science T. 317 (5837): 523–526, PMID 17656724 , doi : 10.111126 / science3.126 . //www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/317/5837/523 > Arhivat 14 septembrie 2009 la Wayback Machine