Un secvențietor ADN (sequencer) este un instrument sau dispozitiv științific care determină automat secvența de nucleotide dintr-o secvențiere a lanțului ADN . O probă de ADN este încărcată în secvențior, rezultatul muncii sale este un set de secvențe de baze de adenină , timină , guanină , citozină , stocate de obicei ca șiruri de text cu literele A, T, G, C (așa-numitele "citește". ").
Primele secvențiere automate au fost introduse de Applied Biosystems în 1987 și au folosit metoda Sanger . Această metodă stă la baza primei generații de secvențiere. Cu ajutorul lui, proiectul genomului uman a fost finalizat în 2001 (lectura completă a genomului uman ). Instalațiile de prima generație au fost automatizarea sistemelor electroforetice care au determinat migrarea fragmentelor de ADN marcate în gel, separându-le după masă (lungime).
Proiectul Genomul Uman a dat naștere dezvoltării unor sisteme de secvențiere de precizie, cu costuri reduse, cu randament ridicat, numite Next Generation Sequencers (NGS). Printre astfel de sisteme: 454, SOLiD, Illumina DNA. Astfel de secvențiere au accelerat procesul de citire a codurilor ADN cu ordine de mărime în comparație cu metoda anterioară Sanger. Pregătirea probelor de ADN pentru astfel de dispozitive este automatizată și durează aproximativ o oră și jumătate. Este nevoie de doar câteva zile pentru a citi de 15 ori un genom de dimensiune umană.
Secvențierele mai noi sunt de a treia generație (de exemplu SMRT și Oxford Nanopore) și funcționează prin măsurarea în timp real a nucleotidelor individuale ale moleculelor de ADN individuale (prin adăugarea de nucleotide sau prin tragerea unui lanț printr-o structură de proteine nanopore ).
Modern[ când? ] secvențiere[ ce? ] au sisteme optice cu ajutorul cărora sunt fixate semnalele - coloranți-terminatori ( de exemplu dye -terminators ) - fluorocromi cu lungimi de undă diferite și, în consecință, de culoare, se atașează la o anumită nucleotidă din ADN (verde - adenină , roșu - timină , negru - guanină , albastru - citozină ).
Primul secvențietor ADN automat bazat pe metoda Sanger a fost dezvoltat de L. M. Smith și comercializat de Applied Biosystems în 1987. [unu]