Coronavirus uman OC43

Coronavirus uman OC43
clasificare stiintifica
Grup:Viruși [1]Tărâm:RiboviriaRegatul:OrthornaviraeTip de:PisuviricotaClasă:PisoniviricetesOrdin:NidoviralesSubordine:CornidovirineaeFamilie:CoronavirusuriSubfamilie:CoronavirusuriGen:betacoronavirusSubgen:EmbecovirusVedere:Betacoronavirus 1Fără rang:Coronavirus uman OC43
Denumire științifică internațională
coronavirus uman OC43
Sinonime
  • HCoV-OC43
Grupul Baltimore
IV: virusuri (+)ssRNA

Coronavirusul uman OC43 [2] ( Eng.  Coronavirusul uman OC43 ) este un virus din familia coronavirusului , reprezentant al speciei Betacoronavirus 1 , infecțios pentru oameni și bovine [3] [4] . Un virus ARN monocatenar învelit (+) care intră în celulă prin legarea de receptorul acidului N-acetil-9-O-acetilneuraminic [5] . Are, ca și alte coronavirusuri din subgenul Embecovirus , o proteină cu vârf scurt , așa-numita hemaglutinină esterază (HE) [6] [3] .

OC43 este unul dintre cele șapte coronavirusuri cunoscute care infectează oamenii și este responsabil pentru aproximativ 10-15% din cazurile de SARS [7] [8] . Cercetătorii sugerează că toate cele patru coronavirusuri cauzatoare de răceală au trecut pentru a infecta oamenii în ultimele câteva secole și, făcând acest lucru, probabil au provocat pandemii în momentul tranziției [9] .

Virologie

Au fost identificate patru genotipuri HCoV-OC43 (de la A la D), genotipul D fiind cel mai probabil rezultat din recombinarea genetică . Secvențierea întregului genom a două tulpini ale genotipurilor C și D și analiza bootscan arată semne de recombinare între genotipurile B și C pentru a forma genotipul D. Din cele 29 de tulpini identificate, niciuna nu aparține genotipului mai vechi A. Metoda ceasului molecular cu vârf și nucleocapside atribuie cel mai apropiat strămoș comun dintre toate genotipurile până în anii 1950, genotipul B până în anii 1990 și genotipul C până la sfârșitul anilor 1990 și începutul anilor 2000. Tulpinile recombinante ale genotipului D au fost descoperite deja în 2004 [7] .

Comparația HCoV-OC43 cu cea mai apropiată tulpină a speciei Betacoronavirus 1 , coronavirusul bovin , a arătat că au avut cel mai apropiat strămoș comun la sfârșitul secolului al XIX-lea, cu mai multe metode care datează separarea în jurul anului 1890, făcând cercetătorii să speculeze că intrarea primei tulpini în populația umană a provocat pandemia de gripă din 1889-1890 [10] [9] . HCoV-OC43 își are originea probabil în rozătoare [11] .

Patogeneza

Alături de HCoV-229E , o specie din genul Alphacoronavirus , HCoV-OC43 se numără printre virusurile cunoscute care provoacă răceala comună . Ambele virusuri pot provoca infecții severe ale tractului respirator inferior, inclusiv pneumonie la sugari, vârstnici și cei care sunt imunocompromiși, cum ar fi cei supuși chimioterapiei și persoanele cu HIV/SIDA [12] [13] [14] .

Epidemiologie

Coronavirusurile sunt omniprezente în întreaga lume, provocând până la 20-30% din răceli [9] (cel mai frecvent virus care provoacă răceala este rinovirusul , întâlnit în 30-50% din cazuri). Infecțiile sunt sezoniere , majoritatea cazurilor aparând în lunile de iarnă [15] [16] [17] .

Natura de rutină a virusului nu a atras mult timp atenția cercetătorilor: ca și 229E, era un „virus orfan” care, spre deosebire de SARS și MERS , nu avea nici măcar un nume „complicat”. Cu toate acestea, ipotezele despre legătura sa cu pandemia de gripă rusă din 1889-1890 - bazate pe studiul de mai sus al genomului și pe similaritatea simptomelor de deteriorare a sistemului nervos  - pot indica o slăbire semnificativă și relativ rapidă a patogenității coronavirusului. Dacă Covid-19 urmează aceeași traiectorie, în timp se va transforma într-un alt virus al răcelii [9] .

Note

  1. ↑ Taxonomia Virușilor  pe site-ul web al Comitetului Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV) .
  2. ↑ Popov N. N., Kolotova T. Yu. Evoluția moleculară a infecțiilor virale emergente deosebit de periculoase Copie de arhivă din 4 decembrie 2021 la Wayback Machine // Annals of the Mechnikov Institute. - 2016. - Nr 1. - S. 38-47 [38].
  3. ↑ 1 2 Browser de taxonomie (Betacoronavirus 1) . www.ncbi.nlm.nih.gov . Preluat la 29 februarie 2020. Arhivat din original la 5 noiembrie 2020.
  4. ↑ Lim, Yvonne Xinyi (25.07.2016). „Coronavirusurile umane: o analiză a interacțiunilor virus-gazdă.” boli . 4 (3): 26. doi : 10.3390/diseases4030026 . PMID  28933406 . Vezi tabelul 1.
  5. ↑ Li, Fang (29.09.2016). „Structura, funcția și evoluția proteinelor Spike Coronavirus.” Revizuirea anuală a virologiei . 3 (1): 237-261. DOI : 10.1146/annurev-virology-110615-042301 . PMID27578435  . _ BCoV S1-NTD nu recunoaște galactoza așa cum o fac galectinele. În schimb, recunoaște acidul 5-N-acetil-9-O-acetilneuraminic (Neu5,9Ac2) (30, 43). Același receptor de zahăr este recunoscut și de coronavirusul uman OC43 (43, 99). OC43 și BCoV sunt strâns legate genetic, iar OC43 ar fi putut rezulta din răspândirea zoonotică a BCoV (100, 101).
  6. ^ Woo, Patrick CY (24.08.2010). „Genomica coronavirusului și analiza bioinformatică”. Virușii . 2 (8): 1804-1820. DOI : 10.3390/v2081803 . PMID21994708  . _ În toți membrii subgrupului A de Betacoronavirus, o genă a hemaglutinin esterazei (HE), care codifică o glicoproteină cu activitate de neuraminat O-acetil-esterază și situsul activ FGDS, este prezentă în aval de ORF1ab și în amonte de gena S (Figura 1).
  7. ↑ 1 2 Lau, Susanna KP (2011). „Epidemiologia moleculară a coronavirusului uman OC43 dezvăluie evoluția diferitelor genotipuri de-a lungul timpului și apariția recentă a unui genotip nou datorită recombinării naturale” . Jurnalul de Virologie . 85 (21): 11325-11337. DOI : 10.1128/JVI.05512-11 . PMID21849456  . _
  8. ↑ Gaunt, ER (2010). „Epidemiologia și prezentările clinice ale celor patru coronavirusuri umane 229E, HKU1, NL63 și OC43 detectate pe parcursul a 3 ani folosind o nouă metodă PCR multiplex în timp real” . J Clinic Microbiol . 48 (8): 2940-2947. DOI : 10.1128/JCM.00636-10 . PMID20554810  . _
  9. ↑ 1 2 3 4 King A. An uncommon cold Arhivat 7 ianuarie 2021 la Wayback Machine // New Sci. 2020;246(3280):32-35. doi : 10.1016/S0262-4079(20)30862-9
  10. ↑ Vijgen, Leen (2005). „Secvența genomică completă a coronavirusului uman OC43: Analiza ceasului molecular sugerează un eveniment de transmitere a coronavirusului zoonotic relativ recent” . Jurnalul de Virologie . 79 (3): 1595-1604. DOI : 10.1128/JVI.79.3.1595-1604.2005 . PMID  15650185 .
  11. ↑ Fung, To Sing (2019). „Coronavirus uman: interacțiunea gazdă-patogen”. Revizuirea anuală a microbiologiei . 73 : 529-557. DOI : 10.1146/annurev-micro-020518-115759 . PMID  31226023 .
  12. ^ Wevers, Brigitte A. (2009). „Coronavirusuri umane descoperite recent”. Clinici în medicină de laborator . 29 (4): 715-724. DOI : 10.1016/j.cll.2009.07.007 . PMID  19892230 .
  13. ↑ Manual de microbiologie clinică. - Societatea Americană de Microbiologie, 2007. - ISBN 978-1-55581-371-0 .
  14. ↑ Pyrc, K. (2007). „Strategii antivirale împotriva coronavirusurilor umane”. Tulburări infecțioase ținte medicamentoase . 7 (1): 59-66. DOI : 10.2174/187152607780090757 . PMID  17346212 .
  15. ↑ Van Der Hoek, L (2007). „Coronavirusurile umane: ce provoacă?” . Terapia antivirală . 12 (4 Pt B): 651-658. PMID  17944272 . Arhivat din original pe 28.01.2022 . Extras 2020-08-09 . Parametrul depreciat folosit |deadlink=( ajutor )
  16. ↑ Wat, Dennis (2004). „Răceala comună: o revizuire a literaturii”. Jurnalul European de Medicină Internă . 15 (2): 79-88. DOI : 10.1016/j.ejim.2004.01.006 . PMID  15172021 .
  17. ↑ Kissler, Stephen M. (14 aprilie 2020). „Proiectarea dinamicii transmiterii SARS-CoV-2 în perioada postpandemică”. Știință : eabb5793. doi : 10.1126/science.abb5793 . PMID  32291278 .