Lista obiectelor model (biologie)

Versiunea actuală a paginii nu a fost încă revizuită de colaboratori experimentați și poate diferi semnificativ de versiunea revizuită pe 5 aprilie 2018; verificările necesită 18 modificări .

Organisme model

Viruși

Archaea

Bacterii

Protiști

Ciuperci

Plante

Animale

Nevertebrate
  • Specii din genul Hydra ( Hydra ), polipi de apă dulce; Organismul model al biologiei dezvoltării, în special, servește la studiul proceselor de regenerare. Genomul hidrei (specia nord-americană Hydra magnipapillata ) este parțial descifrat. Există colecții de linii de hidre mutante în Japonia și Germania. S-a dezvoltat o tehnică de obținere a hidrelor transgenice.
  • Nematostella vectensis , nematostella, este o anemonă de mare din familia Edwardsiidae, care în ultimii ani a devenit principalul obiect model pentru studierea biologiei moleculare și a biologiei dezvoltării cnidarilor . În 2007, genomul nematostella a fost secvențiat complet [9] .
  • Symsagittifera roscoffensis (sin. Convoluta roscoffensis ), un reprezentant al grupului primitiv de „turbellarieni intestinali” (acum tipul Acoelomorpha ) - studiul evoluției planului corporal al animalelor simetrice bilateral.
  • Nematodul Caenorhabditis elegans ( C. elegans ) [10]  este un control genetic al dezvoltării și al proceselor fiziologice (primul organism multicelular al cărui genom a fost complet secvențial; în prezent, genomul celei de-a doua specii din acest gen, C. briggsae , a fost secvențial ).
  • Nematodul Pristionchus pacificus , este folosit în biologia evolutivă a dezvoltării pentru comparație cu C. elegans .
  • Lipitoarea medicală Hirudo medicinalis  - neurobiologie (sisteme nervoase simple): studiul locomoției; studiul dezvoltării sistemului nervos în biologia dezvoltării.
  • Gândacul club Tribolium castaneum este un gândac  mic, ușor de crescut, folosit pentru experimente comportamentale și ecologice.
  • Daphnia ( Daphnia pulex , D. magna ) este unul dintre principalele obiecte model de toxicologie acvatică. Ele sunt, de asemenea, folosite pentru a studia genetica populației . Genomul D. pulex este parțial descifrat.
  • Drosophila (genul Drosophila ), în special, specia Drosophila melanogaster  este o muscă a fructelor, un obiect celebru al cercetării genetice. Ușor de păstrat și crescut în laborator, are o schimbare generațională rapidă și multe mutații cu expresie fenotipică diferită. În a doua jumătate a secolului al XX-lea, unul dintre principalele obiecte ale biologiei dezvoltării. Genomul a fost complet secvențiat. Recent a fost folosit pentru cercetare neurofarmacologică [11] .
  • Moluște nudibranche Hermissenda crassicornis  — neurobiologie (sisteme nervoase simple): mecanisme de memorie și de învățare.
  • Iepurele de mare Aplysia californica , moluște branhiale posterioare - neurobiologie (sisteme nervoase simple): mecanisme moleculare de memorie și învățare; rearanjarea citoscheletului.
  • Angelfish Clione limacina  - neurobiologie (sisteme nervoase simple): formarea conexiunilor între neuroni, regenerarea nervilor, controlul locomoției și alte forme de comportament.
  • Calamarul Euprymna scolopes , un model pentru studiul relației simbiotice dintre animale și bacterii, bioluminiscență.
  • Calamarul Loligo pealei , un obiect clasic pentru studiul activității celulelor nervoase și a citoscheletului acestora (are axoni giganți de până la 1 mm în diametru).
  • Aricii de mare Arbacia punctulata și Strongylocentrotus purpuratus , obiecte clasice de embriologie. Genomul Strongylocentrotus purpuratus a fost complet descifrat în 2006 [12]
  • Appendicularia Oikopleura dioica [13] .
  • Ascidia Ciona intestinalis — embriologie, evoluția genomului cordatelor / Genomul a fost secvențiat „aproximativ” în 2002 [14] .
Vertebrate
  • Lampreele (familia Petromyzontidae) - un model pentru studierea măduvei spinării
  • Medaka Oryzias latipes , un model în biologia dezvoltării (mai iertător decât tradiționalul Danio rerio
  • Fugu Takifugu rubripes  , un pește din familia Tetraodontidae  , are un genom compact cu puține secvențe necodante. Genomul a fost secvențiat.
  • Pește zebra dungat ( Danio rerio ), (în literatura engleză zebra-fish) - pește de apă dulce aproape transparent în stadiile incipiente de dezvoltare; un obiect important al biologiei dezvoltării, toxicologiei acvatice și toxicopatologiei [15] . Genomul a fost secvențiat.
  • Broasca africană cu gheare Xenopus laevis  este unul dintre subiectele principale ale biologiei dezvoltării; ovocitele sunt de asemenea folosite pentru a studia expresia genelor. Genomul a fost secvențiat.
  • Anolis carolinensis — genomul a fost secvențiat complet în 2011 [2]
  • Pui ( Gallus gallus domesticus ) - un obiect model al embriologiei amnioților, folosit din cele mai vechi timpuri până în zilele noastre
  • Cinteze zebra ( Taeniopygia guttata ) - un obiect model de neurobiologie și etologie (studiul cântului păsărilor și al sistemului auditiv)
  • Pisica ( Felis catus ) este un obiect model al neurofiziologiei, în special, studiul funcțiilor cerebelului și al mecanismelor de locomoție .
  • Câinele ( Canis familiaris ) este un obiect clasic al fiziologiei animalelor (studiul activității sistemelor respirator, circulator și digestiv), studiul dezvoltării reflexelor condiționate în laboratorul lui I.P. Pavlov („câinele lui Pavlov” este aceeași imagine colectivă ca „cobai de laborator”) .
  • Șoarecele de casă ( Mus musculus )  este principalul animal model printre mamifere. Au fost obținute multe linii pure consangvinizate , inclusiv cele selectate pentru trăsături de interes pentru medicină. etologie etc.(o tendință la obezitate, creșterea și scăderea inteligenței, tendința de a consuma alcool, speranța de viață diferită etc.). Genomul a fost complet secvențiat. Au fost dezvoltate metode pentru obținerea de șoareci transgenici folosind celule stem. Prezintă un interes suplimentar ca obiect pentru studierea geneticii populațiilor și a proceselor de speciație, deoarece are o structură intraspecifică complexă (multe subspecii care diferă în rase de cromozomi cariotip ).
  • Șobolanul cenușiu ( Rattus norvegicus ) este un model important pentru toxicologie, neuroștiință și fiziologie; De asemenea, este folosit, împreună cu șoarecele, în genetică moleculară și genomică. Genomul a fost complet secvențiat.
  • Porcușor de Guineea ( Cavia porcellus ) , utilizat în dezvoltarea timpurie a bacteriologiei, în special de Robert Koch și Emil Behring în studiul difteriei (de unde „cobaiul” ca denumire colectivă)
  • Hamsteri ( hamsteri ), mai multe specii de rozătoare din diferite genuri ale subfamilia Cricetinae (cele mai întâlnite în laboratoare sunt hamsterul sirian ( Mesocricetus auratus ) , hamsterul Djungarian ( Phodopus sungorus ) și hamsterul chinezesc ( Cricetulus griseus ) ); au fost utilizate pentru prima dată în 1919 în locul șoarecilor pentru tipărirea pneumococică și în studiul leishmaniozei ; în prezent, unul dintre cele mai comune mamifere de laborator (al doilea ca lățime de utilizare numai după șoareci, șobolani și, în unele țări, gerbili); sunt utilizate pentru obținerea liniilor celulare (biologie celulară - oncologie , obținerea hibridoamelor etc.; linia celulară ovarului de hamster chinezesc CHO este folosită și pentru producerea de medicamente terapeutice)
  • Maimuța Rhesus ( Macacus mulatta ) - cercetare medicală (inclusiv studiul bolilor infecțioase), etologie, neuroștiință
  • Cimpanzeii (două specii, cimpanzeul comun ( Pan troglodytes ) și cimpanzeul pigmeu ( Pan paniscus ) sunt rudele vii cele mai apropiate ale oamenilor. Acum sunt folosite în principal pentru a studia comportamentele complexe și activitățile cognitive ale animalelor. Genomul Pan troglodytes a fost secvențial .
  • Homo sapiens are  un genom complet secvențial . Cercetare clinică, biologie evolutivă, fiziologie, neuroștiință etc.

Model de organe și țesuturi

  • Ganglionul nervos stomatogastric al homarului ( Palinurus ) și a altor specii de crustacee decapode - un model special pentru studierea activității ritmice a neuronilor

Modelați celule și linii celulare

  • Linia celulară de tutun Nicotiana tabaccum BY-2  este utilizată pentru a studia fiziologia celulelor vegetale (citologia, fiziologia plantelor, biotehnologie)
  • Linia celulară HeLa a celulelor umane este celule nemuritoare obţinute dintr-o tumoare canceroasă a colului uterin în 1951; una dintre principalele linii celulare umane cultivate în laboratoare. Folosit pentru a dezvolta vaccinul antipolio .

Populații model

Note

  1. ↑ Resurse Chlamydomonas reinhardtii la Joint Genome Institute (link nu este disponibil) . Consultat la 13 septembrie 2009. Arhivat din original la 23 iulie 2008. 
  2. ↑ Chlamydomonas genome secvenced Arhivat 15 martie 2008 la Wayback Machine publicat în Science, 12 octombrie 2007
  3. ↑ Kües U. Life history and developmental processes in the basidiomycete Coprinus cinereus   // Microbiol . Mol. Biol. Rev. : jurnal. - 2000. - iunie ( vol. 64 , nr. 2 ). - P. 316-353 . — PMID 10839819 . Arhivat din original pe 13 septembrie 2019.
  4. ^ Davis, Rowland H. Neurospora : contribuții ale unui organism model  . - Oxford [Oxfordshire]: Oxford University Press , 2000. - ISBN 0-19-512236-4 .
  5. ↑ Ohm RA, de Jong JF, Lugones LG et al. Secvența genomică a ciupercii model Schizophyllum comune  (engleză)  // Nature Biotechnology . - Nature Publishing Group , 2010. - Vol. 28 . - P. 957-963 . - doi : 10.1038/nbt.1643 . Arhivat din original pe 22 ianuarie 2011.
  6. ↑ 1 2 3 Despre Arabidopsis pe pagina The Arabidopsis Information Resource (TAIR) . Consultat la 13 septembrie 2009. Arhivat din original la 12 noiembrie 2019.
  7. ↑ Copie arhivată (link nu este disponibil) . Preluat la 16 iunie 2021. Arhivat din original la 10 august 2020. 
  8. ↑ Rensing SA, Lang D., Zimmer AD, et al. Genomul Physcomitrella dezvăluie perspective evolutive în cucerirea pământului de către plante  //  Science : journal. - 2008. - ianuarie ( vol. 319 , nr. 5859 ). - P. 64-9 . - doi : 10.1126/science.1150646 . — PMID 18079367 . Arhivat din original pe 6 martie 2008.
  9. ↑ Putnam NH, Srivastava M., Hellsten U., Dirks B., Chapman J. et al. Genomul anemonei de mare dezvăluie repertoriul genelor ancestrale eumetazoare și organizarea genomică  (italiană)  // Science : diario. - 2007. - V. 317 . - P. 86-94 . — PMID 17615350 .
  10. ↑ Riddle, Donald L. C. elegans II  (neopr.) . — Plainview, NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1997. - ISBN 0-87969-532-3 . Arhivat pe 19 iunie 2009 la Wayback Machine
  11. ↑ Manev H., Dimitrijevic N., Dzitoyeva S. Tehnici: muștele fructelor ca modele pentru cercetarea neurofarmacologică  (neopr.)  // Trends Pharmacol Sci .. - 2003. - V. 24 , No. 1 . - S. 41-43 . - doi : 10.1016/S0165-6147(02)00004-4 . Arhivat din original pe 2 noiembrie 2017.
  12. ↑ Sea Urchin Genome Sequencing Consortium. 2006. Genomul ariciului de mare, Strongylocentrotus purpuratus. Science 314: 941-952.
  13. ↑ The Appendicularia Facility at the Sars International Center for Marine Molecular Biology Arhivat la 31 ianuarie 2009 la Wayback Machine .
  14. ↑ Dehal P, Satou. et al. 2002. Proiectul genomului Ciona intestinalis: perspective asupra originilor cordatelor și vertebratelor. Science 298: 2157-2167.
  15. ↑ Spitsbergen JM, Kent ML Stadiul actual al modelului de pește zebra pentru cercetarea toxicologiei și patologiei toxicologice - avantaje și limitări actuale  //  Toxicol Pathol : jurnal. - 2003. - Vol. 31 , nr. Supl . - P. 62-87 . - doi : 10.1080/01926230390174959 . — PMID 12597434 . Arhivat din original pe 16 iulie 2012.