ARNr -ul 5S (acid ribonucleic ribozomal 5S) este o componentă structurală și funcțională a subunității mari a ribozomului , care acționează ca o schelă pentru proteinele ribozomale și este o componentă catalitică cheie a peptidil transferazei. A fost găsit în aproape toți ribozomii ( bacterii , arhee și eucariote ), cu excepția mitocondriilor fungice , a animalelor superioare și a majorității protiștilor . Denumirea 5S se datorează factorului de sedimentare a 5 unități Swedberg în ultracentrifugare , se referă la viteza de sedimentare a unei molecule într-o ultracentrifugă, care este măsurată în unități Svedberg .(S). Are o lungime de aproximativ 120 de nucleotide și o greutate moleculară de 40 kDa . [1] .
Structura secundară a ARNr 5S constă din cinci elice (I-V), două bucle în ac de păr (C și D), două bucle interne (B și E) și o regiune balama (bucla A) care formează o joncțiune cu trei elice [1] .
Inițial, s-a considerat că ARNr-ul 5S joacă doar un rol structural ca schelă pentru proteinele ribozomale, dar recent s-a dovedit, de asemenea, a fi o componentă catalitică cheie a centrului peptidil transferazei al ribozomului. În Escherichia coli , delețiile genei ARNr 5S reduc rata de sinteză a proteinelor. Există, de asemenea, o serie de interacțiuni între ARNr 5S și proteinele ribozomale L5. În celulele eucariote, proteina ribozomală L5 se leagă și stabilizează ARNr-ul 5S pentru a forma o particulă de ribonucleoproteină pre-ribozomală (RNP) care se află atât în citosol, cât și în nucleu. Deficiența L5 împiedică transportul ARNr 5S în nucleu și duce la reducerea asamblarii ribozomilor. Există o singură interacțiune directă între domeniul y ARN 5S și helixul ARN ribozomal 38 23S [2] .