CHD4

Cromodomeniul helicază al proteinei de legare a ADN-ului 4

PDB este prezentat în 1 mm2 ca exemplu.

Structuri disponibile

Căutare ortolog: PDBe , RCSB

Lista ID-urilor PDB
1MM2 , 1MM3 , 2EE1 , 2L5U , 2L75

Identificatori

Simbol

CHD4 ; CHD-4; Mi-2b; Mi2-BETA

ID-uri externe

OMIM: 603277 MGI : 1344380 HomoloGene : 68175 GeneCards : CHD4 Gene

numărul CE

3.6.4.12

ontologie genetică
Funcţie	• Legarea ADN-ului specifică secvenței regiunii proximale a promotorului miez al ARN polimerazei II • Legarea ADN-ului specifică secvenței de amplificator distal ARN polimerazei II • Legarea ARN polimerazei II care reprimă factorul de transcripție • Legarea ADN • Activitate ADN helicaza dependentă de ATP • Legarea proteinelor • Legarea ATP • Legarea microtubulilor • Legarea ionilor de zinc • legarea de ADN nucleozomal
componenta celulara	• cromatina nucleară • nucleu • nucleoplasmă • citoplasmă • centrozom • membrană • complex NuRD • complex de proteine
proces biologic	• Procesul catabolic al ATP • transcripție, modelat cu ADN • reglarea transcripției din promotorul ARN polimerazei II • derularea duplexului ADN • remodelarea cromatinei dependentă de ATP • ansamblu ax
Surse: Amigo / QuickGO

Profilul expresiei ARN

Mai multe informatii

ortologii

Vedere

Uman

Mouse

Entrez

RefSeq (ARNm)

RefSeq (proteină)

Locus (UCSC)

Chr 12:
6,68 – 6,72 Mb

Chr 6:
125,1 – 125,13 Mb

Căutați în PubMed

[unu]

[2]

Cromodomeniul 4 helicaza de proteină care leagă ADN-ul este o enzimă codificată la om de gena CHD4 . [1] [2] [3]

Produsul acestei gene aparține familiei de helicaze SNF2/RAD54 . Este o componentă majoră a remodelării nucleozomale și a complexului de deacetilaze și joacă un rol important în reprimarea transcripțională epigenetică . Pacienții cu dermatomiozită dezvoltă anticorpi împotriva acestei proteine. [3]

Interacțiuni

S-a demonstrat că CHD4 interacționează cu HDAC1 , [4] [5] [6] histon deacetilaza 2 , [7] [8] [6] MTA2 , [4] SATB1 [9] și ATR . [opt]

Note

↑ Seelig HP, Moosbrugger I., Ehrfeld H., Fink T., Renz M., Genth E. Autoantigenul major Mi-2 specific dermatomiozitei este o presupusă helicază implicată în activarea transcripțională // Artrita Rheum : jurnal. - 1995. - noiembrie ( vol. 38 , nr. 10 ). - P. 1389-1399 . - doi : 10.1002/art.1780381006 . — PMID 7575689 .
↑ Seelig HP, Renz M., Targoff IN, Ge Q., Frank MB Două forme ale proteinei antigenice majore ale autoantigenului Mi-2 specific dermatomiozitei // Artrita Rheum : jurnal. - 1996. - noiembrie ( vol. 39 , nr. 10 ). - P. 1769-1771 . - doi : 10.1002/art.1780391029 . — PMID 8843877 .
↑ 1 2 Gena Entrez: proteina de legare la ADN a helicazei cromodomeniului CHD4 4 . (nedefinit)
↑ 1 2 Yao, Ya-Li; Yang Wen Ming. Proteinele 1 și 2 asociate metastazelor formează complexe proteice distincte cu activitate de histon deacetilază // J. Biol. Chim. : jurnal. - Statele Unite ale Americii, 2003. - Octombrie ( vol. 278 , nr. 43 ). - P. 42560-42568 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M302955200 . — PMID 12920132 .
↑ Grozinger, CM; Hassig C.A.; Schreiber S L. Trei proteine definesc o clasă de histon deacetilaze umane legate de drojdia Hda1p (engleză) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - STATELE UNITE, 1999. - Aprilie ( vol. 96 , nr. 9 ). - P. 4868-4873 . — ISSN 0027-8424 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
↑ 12 Tong , JK; Hassig C.A.; Schnitzler GR; Kingston RE; Schreiber S L. Deacetilarea cromatinei printr-un complex de remodelare a nucleozomului dependent de ATP (engleză) // Nature : journal. - ANGLIA, 1998. - octombrie ( vol. 395 , nr. 6705 ). - P. 917-921 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. O genă candidată de retard mental legată de X este o componentă a unei noi familii de complexe care conțin histon deacetilază // J. Biol. Chim. : jurnal. - Statele Unite ale Americii, 2003. - Februarie ( vol. 278 , nr. 9 ). - P. 7234-7239 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
↑ 12 Schmidt, D.R .; Schreiber S L. Asocierea moleculară între ATR și două componente ale complexului de remodelare și deacetilare a nucleozomilor, HDAC2 și CHD4 // Biochemistry : journal. - STATELE UNITE, 1999. - Noiembrie ( vol. 38 , nr. 44 ). - P. 14711-14717 . — ISSN 0006-2960 . - doi : 10.1021/bi991614n . — PMID 10545197 .
↑ Yasui, Dag; Miyano Masaru, Cai Shutao, Varga-Weisz Patrick, Kohwi-Shigematsu Terumi. SATB1 vizează remodelarea cromatinei pentru a regla genele pe distanțe lungi // Nature : journal. - Anglia, 2002. - Octombrie ( vol. 419 , nr. 6907 ). - P. 641-645 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature01084 . — PMID 12374985 .

Literatură

Denslow SA, Wade PA Complexul uman Mi-2 / NuRD și reglarea genelor // Oncogene. - 2007. - Vol. 26 , nr. 37 . - P. 5433-5438 . - doi : 10.1038/sj.onc.1210611 . — PMID 17694084 .
Ge Q., Nilasena DS, O'Brien CA, et al. Analiza moleculară a unei regiuni antigenice majore a proteinei de 240 kD a autoantigenului Mi-2 // J. Clin. Investi. : jurnal. - 1995. - Vol. 96 , nr. 4 . - P. 1730-1737 . - doi : 10.1172/JCI118218 . — PMID 7560064 .
Woodage T., Basrai MA, Baxevanis AD, et al. Caracterizarea familiei de proteine CHD (engleză) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1997. - Vol. 94 , nr. 21 . - P. 11472-11477 . - doi : 10.1073/pnas.94.21.11472 . — PMID 9326634 .
Zhang Y., LeRoy G., Seelig HP și colab. Autoantigenul specific dermatomiozitei Mi2 este o componentă a unui complex care conține histon deacetilază și activități de remodelare a nucleozomilor (engleză) // Cell : journal. - Cell Press , 1998. - Vol. 95 , nr. 2 . - P. 279-289 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . — PMID 9790534 .
Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR și colab. Deacetilarea cromatinei de către un complex de remodelare a nucleozomului dependent de ATP (engleză) // Nature : journal. - 1998. - Vol. 395 , nr. 6705 . - P. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., și colab. Analiza subunităților NuRD relevă un complex de miez de histon deacetilază și o legătură cu metilarea ADN-ului // Genes Dev . : jurnal. - 1999. - Vol. 13 , nr. 15 . - P. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
Schmidt DR, Schreiber SL Asocierea moleculară între ATR și două componente ale complexului de remodelare și deacetilare a nucleozomilor, HDAC2 și CHD4 (engleză) // Biochimie : jurnal. - 1999. - Vol. 38 , nr. 44 . - P. 14711-14717 . - doi : 10.1021/bi991614n . — PMID 10545197 .
Humphrey GW, Wang Y., Russanova VR, et al. Complexe stabile de histonă deacetilază se disting prin prezența proteinelor din domeniul SANT CoREST/kiaa0071 și Mta-L1 // J. Biol. Chim. : jurnal. - 2001. - Vol. 276 , nr. 9 . - P. 6817-6824 . - doi : 10.1074/jbc.M007372200 . — PMID 11102443 .
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, et al. Analiza proteomică dirijată a nucleolului uman (engleză) // Curr. Biol. : jurnal. - 2002. - Vol. 12 , nr. 1 . - P. 1-11 . - doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . — PMID 11790298 .
Koipally J., Georgopoulos K. O disecție moleculară a circuitelor de represiune a lui Ikaros // J. Biol. Chim. : jurnal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 31 . - P. 27697-27705 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .
Saito M., Ishikawa F. Domeniul de legare a mCpG al MBD3 uman nu se leagă de mCpG, ci interacționează cu componentele NuRD/Mi2 HDAC1 și MTA2 // J. Biol. Chim. : jurnal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 38 . - P. 35434-35439 . - doi : 10.1074/jbc.M203455200 . — PMID 12124384 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH și colab. Generarea și analiza inițială a mai mult de 15.000 de secvențe de ADNc umane și de șoarece de lungime completă // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, et al. O genă candidată de retard mental legată de X este o componentă a unei noi familii de complexe care conțin histon deacetilază // J. Biol. Chim. : jurnal. - 2003. - Vol. 278 , nr. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
Kwan AH, Gell DA, Verger A., și colab. Proiectarea unei schele de proteine dintr-un deget de doctorat (neopr.) // Structură. - 2004. - T. 11 , nr 7 . - S. 803-813 . - doi : 10.1016/S0969-2126(03)00122-9 . — PMID 12842043 .
Shimono Y., Murakami H., Kawai K., et al. Mi-2 beta se asociază cu proteina deget BRG1 și RET la regiunile distincte cu abilități de activare și reprimare a transcripției // J. Biol. Chim. : jurnal. - 2004. - Vol. 278 , nr. 51 . - P. 51638-51645 . - doi : 10.1074/jbc.M309198200 . — PMID 14530259 .
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Secvențierea și caracterizarea completă a 21.243 de ADNc umani de lungime completă // Nat . Genet. : jurnal. - 2004. - Vol. 36 , nr. 1 . - P. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Williams CJ, Naito T., Arco PG, et al. Remoderatorul de cromatină Mi-2beta este necesar pentru exprimarea CD4 și dezvoltarea celulelor T // Immunity : journal. - Cell Press , 2004. - Vol. 20 , nr. 6 . - P. 719-733 . - doi : 10.1016/j.immuni.2004.05.005 . — PMID 15189737 .
Lehner B., Sanderson CM Un cadru de interacțiune cu proteine pentru degradarea mARN-ului uman // Genome Res . : jurnal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 7 . - P. 1315-1323 . - doi : 10.1101/gr.2122004 . — PMID 15231747 .