Colimovirusuri

Colimovirusuri
clasificare stiintifica
Grup:Viruși [1]Tărâm:RiboviriaRegatul:PararnaviraeTip de:ArtverviricotaClasă:RevtraviricetesOrdin:OrterviralesFamilie:Colimovirusuri
Denumire științifică internațională
Caulimoviridae
Grupul Baltimore
VII: dsDNA-RT-virusuri

Colimovirusurile [2] ( lat.  Caulimoviridae ) sunt o familie de virusuri vegetale care conțin ADN, cu mecanism de transcripție inversă și ADN dublu catenar , adică viruși care conțin o etapă de transcripție inversă în ciclul lor de replicare.

Structura virionilor

Virionul este simplu, fără înveliș lipidic. Morfologia nucleocapsidei este reprezentată de 2 forme principale: în formă de baston și icosaedric. Forma nucleocapsidei depinde de mărimea virusului. Virionii în formă de tijă au un diametru de aproximativ 35–50 nm și pot avea o lungime de până la 900 nm. Capsidul icosaedric are un diametru de 45–50 nm și aproximativ aceeași lungime.

Structura și replicarea genomului

Genomul acestui virus este un ADN dublu catenar liniar sau ciclic nesegmentat . Dimensiunea genomului este de aproximativ 6-8 kbs. În funcție de virus, genomul poate avea fie un cadru de citire deschis (ORF), ca în Petuvirus , fie mai mult de opt, ca în Soymovirus . Genomul acestei familii virale codifică următoarele proteine: revers transcriptază , protează , proteine ​​structurale, precum și alte proteine ​​cu funcții necunoscute, dar necesare într-un fel sau altul pentru replicarea virusului .

Replicarea are loc atât în ​​citoplasmă, cât și în nucleul celulei gazdă. În primul rând, genomul viral intră în citoplasmă. Acolo formează un minicromozom supraînfăşurat. Transcrie ARNm al virusului, care este redundant (deoarece este exprimat de două ori în unele părți ale genomului). Acest ARN transcris intră în citoplasmă, unde joacă două roluri. Poate fi folosit fie ca șablon pentru traducerea proteinelor virale, fie poate fi transcris invers la dsDNA folosind revertaseza virală . Deoarece acești viruși au multe în comun cu retrovirusurile , ei sunt adesea grupați împreună ca pararetrovirusuri. Cu toate acestea, există o diferență importantă aici între retrovirusuri și viruși din familia Caulimoviridae . Spre deosebire de retrovirusuri, ei nu își integrează genomul în cromozomi , deoarece genomul lor nu codifică enzima integrază .

Cu toate acestea, există specii din familia Colimovirus, cum ar fi Petunia vein clearing virus , care ocazional (în special în condiții de stres) își pot integra genomul în genomul economic [3] . De obicei, astfel de provirusuri sunt adesea denumite pararetrovirusuri endogene (EPRV).

Clasificare

Potrivit Comitetului Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV) , din martie 2016, familia include 8 genuri [4] :

Specia de virus Rose yellow vena are o organizare neobișnuită a genomului care o face o specie unică [5] .

Note

  1. ↑ Taxonomia Virușilor  pe site-ul web al Comitetului Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV) .
  2. ↑ Pinevici A. V. , Sirotkin A. K. , Gavrilova O. V. , Potekhin A. A. Virologie: manual. - Sankt Petersburg.  : St. Petersburg University Press, 2012. - P. 275. - ISBN 978-5-288-05328-3 .
  3. ↑ Harper G., Hull R., Lockhart B. și Olszewski N. (2002). Secvențe virale integrate în genomul plantelor. Revizuirea anuală a fitopatologiei 40 : 119-136. doi : 10.1146/annurev.phyto.40.120301.105642 . PMID 12147756 .
  4. ↑ Taxonomia Virușilor  pe site-ul web al Comitetului Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV) . (Accesat: 26 martie 2017) .
  5. ↑ Mollov D., Lockhart B., Zlesak DC, Olszewski N. (2012). Secvența completă de nucleotide a virusului venei galben trandafir, un membru al familiei Caulimoviridae având o nouă organizare a genomului. Arch Virol .

Link -uri