DNMT3A
ADN (citozin-5)-metiltransferaza 3A este o enzimă care catalizează transferul grupărilor metil la situsurile de metilare CpG din ADN ( metilarea ADN ). Enzima este codificată la om de gena DNMT3A [1] [2] .
Această proteină, împreună cu DNMT1 și DNMT3B , este un membru al familiei ADN-metiltransferazelor [1] [2] .
Funcția
Metilarea CpG este o modificare epigenetică importantă pentru dezvoltarea embrionară, imprimarea și inactivarea cromozomului X. Studiile la șoareci au arătat că metilarea ADN- ului este esențială pentru dezvoltarea mamiferelor. Această genă codifică o ADN metiltransferază despre care se crede că efectuează metilarea de novo, mai degrabă decât menținerea site-urilor de metilare existente. Proteina este localizată în citoplasmă și nucleu, iar expresia ei este reglată pe măsură ce organismul se dezvoltă. Există variante alternative de splicing care codifică diferite izoforme [3] .
Relevanță clinică
Studiul acestei gene la șoareci a arătat că o scădere a expresiei acesteia la animalele în vârstă determină o scădere a memoriei cognitive pe termen lung [4] .
Gena este, de asemenea, puternic mutată în cancer, fiind una dintre cele 127 de gene cu cele mai frecvente mutații identificate în proiectul Cancer Genome Atlas , un studiu care a efectuat secvențierea completă a genomului pentru 3281 de tipuri de cancer diferite [5] . În acest studiu, mutațiile DNMT3a au fost observate cel mai frecvent în leucemia mieloidă acută , unde au apărut în mai mult de 25% din cazuri. Aceste mutații apar cel mai adesea la poziția R882 din proteină și pot duce la pierderea funcției proteinei [6] . Mutațiile genei DNMT3A, indiferent de alți factori, sunt asociate cu un prognostic prost de supraviețuire în leucemia mieloidă acută [7] .
Interacțiuni
S-a demonstrat că Dnmt3a interacționează cu:
Note
- ↑ 1 2 Okano M. , Xie S. , Li E. Clonarea și caracterizarea unei familii de metiltransferaze ADN (citozină-5) noi de mamifere. (engleză) // Genetica naturii. - 1998. - Vol. 19, nr. 3 . - P. 219-220. - doi : 10.1038/890 . — PMID 9662389 .
- ↑ 1 2 Xie S. , Wang Z. , Okano M. , Nogami M. , Li Y. , He WW , Okumura K. , Li E. Clonarea, expresia și locațiile cromozomiale ale familiei de gene DNMT3 umane. (engleză) // Gene. - 1999. - Vol. 236, nr. 1 . - P. 87-95. — PMID 10433969 .
- ↑ Gena Entrez: DNMT3A ADN (citozină-5-)-metiltransferaza 3 alfa . (nedefinit)
- ^ Oliveira AM , Hemstedt TJ , Bading H. Salvarea declinului asociat îmbătrânirii în expresia Dnmt3a2 restabilește abilitățile cognitive. (engleză) // Nature neuroscience. - 2012. - Vol. 15, nr. 8 . - P. 1111-1113. - doi : 10.1038/nn.3151 . — PMID 22751036 .
- ↑ Kandoth C. , McLellan MD , Vandin F. , Ye K. , Niu B. , Lu C. , Xie M. , Zhang Q. , McMichael JF , Wyczalkowski MA , Leiserson MD , Miller CA , Welch JS , Walter MJ , Wendl MC , Ley TJ , Wilson RK , Raphael BJ , Ding L. Peisaj mutațional și semnificație în 12 tipuri majore de cancer. (engleză) // Natură. - 2013. - Vol. 502, nr. 7471 . - P. 333-339. - doi : 10.1038/nature12634 . — PMID 24132290 .
- ^ Shih AH , Abdel-Wahab O. , Patel JP , Levine RL Rolul mutațiilor în regulatorii epigenetici în afecțiunile maligne mieloide. (engleză) // Recenzii de natură. cancer. - 2012. - Vol. 12, nr. 9 . - P. 599-612. doi : 10.1038 / nrc3343 . — PMID 22898539 .
- ↑ Ley TJ , Ding L. , Walter MJ , McLellan MD , Lamprecht T. , Larson DE , Kandoth C. , Payton JE , Baty J. , Welch J. , Harris CC , Lichti CF , Townsend RR , Fulton DJ RS , Dooling , Koboldt DC , Schmidt H. , Zhang Q. , Osborne JR , Lin L. , O'Laughlin M. , McMichael JF , Delehaunty KD , McGrath SD , Fulton LA , Magrini VJ , Vickery TL , Hundal J. , Cook LL , Conyers JJ , Swift GW , Reed JP , Alldredge PA , Wylie T. , Walker J. , Kalicki J. , Watson MA , Heath S. , Shannon WD , Varghese N. , Nagarajan R. , Westervelt P. , Tomasson MH , Link DC , Graubert TA , DiPersio JF , Mardis ER , Wilson RK DNMT3A mutații în leucemia mieloidă acută. (engleză) // Jurnalul de medicină din New England. - 2010. - Vol. 363, nr. 25 . - P. 2424-2433. - doi : 10.1056/NEJMoa1005143 . — PMID 21067377 .
- ↑ 1 2 Kim GD , Ni J. , Kelesoglu N. , Roberts RJ , Pradhan S. Cooperare și comunicare între întreținerea umană și metiltransferazele ADN (citozină-5) de novo. (engleză) // Jurnalul EMBO. - 2002. - Vol. 21, nr. 15 . - P. 4183-4195. — PMID 12145218 .
- ↑ 1 2 3 4 Ling Y. , Sankpal UT , Robertson AK , McNally JG , Karpova T. , Robertson KD Modificarea de novo a ADN metiltransferazei 3a (Dnmt3a) de către SUMO-1 modulează interacțiunea cu histon deacetilaze (HDAC) și capacitatea sa a reprima transcrierea. (engleză) // Cercetarea acizilor nucleici. - 2004. - Vol. 32, nr. 2 . - P. 598-610. doi : 10.1093 / nar/gkh195 . — PMID 14752048 .
- ^ Lehnertz B. , Ueda Y. , Derijck AA , Braunschweig U. , Perez-Burgos L. , Kubicek S. , Chen T. , Li E. , Jenuwein T. , Peters AH Suv39h-mediat de histonă H3 lizină ADN directă de metilare 9 metilarea la repetările majore ale satelitului la heterocromatina pericentrică. (Engleză) // Biologie actuală : CB. - 2003. - Vol. 13, nr. 14 . - P. 1192-1200. — PMID 12867029 .
- ↑ 1 2 Fuks F. , Burgers WA , Godin N. , Kasai M. , Kouzarides T. Dnmt3a leagă deacetilazele și este recrutat de un represor specific secvenței pentru a reduce transcripția. (engleză) // Jurnalul EMBO. - 2001. - Vol. 20, nr. 10 . - P. 2536-2544. - doi : 10.1093/emboj/20.10.2536 . — PMID 11350943 .
- ↑ Brenner C. , Deplus R. , Didelot C. , Loriot A. , Viré E. , De Smet C. , Gutierrez A. , Danovi D. , Bernard D. , Boon T. , Pelicci PG , Amati B. , Kouzarides T. , de Launoit Y. , Di Croce L. , Fuks F. Myc reprimă transcripția prin recrutarea corepresorului ADN-metiltransferază. (engleză) // Jurnalul EMBO. - 2005. - Vol. 24, nr. 2 . - P. 336-346. - doi : 10.1038/sj.emboj.7600509 . — PMID 15616584 .
- ↑ Fuks F. , Hurd PJ , Deplus R. , Kouzarides T. ADN-metiltransferazele se asociază cu HP1 și histona metiltransferaza SUV39H1. (engleză) // Cercetarea acizilor nucleici. - 2003. - Vol. 31, nr. 9 . - P. 2305-2312. — PMID 12711675 .