Docking@Home

Docking@Home

Grafică din software-ul client
Tip de Calcul distribuit
Sistem de operare Software multiplatformă
Platformă hardware x86
ultima versiune • Charmm 34a2: 6,23
Stat Închidere 23.05.2014
Site-ul web andocare.cis.udel.edu
 Fișiere media la Wikimedia Commons
Docking@Home
Platformă BOINC
Dimensiunea de descărcare a software -ului 7,7 MB
Dimensiunea datelor încărcate de job 1,2 MB
Cantitatea de date despre job trimisă 75-100 KB
Spațiu pe disc 11 MB
Cantitatea de memorie folosită 169 MB
GUI există
Timp mediu de calcul al sarcinii 5,5 ore
termen limita 14 zile
Abilitatea de a utiliza GPU Nu
 Fișiere media la Wikimedia Commons

Docking@Home  este un proiect de calcul voluntar alimentat de platforma BOINC . Proiectul este găzduit de Universitatea din Delaware . Obiectivul principal al proiectului este de a modela interacțiunea potențialelor medicamente cu proteinele ( docking ). [1] Pe 7 aprilie, conducerea Docking@Home a anunțat că proiectul a fost închis pe 23 mai 2014. [2]

Andocare

Andocarea moleculară este o căutare a complexelor ligand-proteină care au o energie liberă minimă , adică acelea ale căror componente „se potrivesc” între ele într-un mod optim. Căutarea unor astfel de complexe este o sarcină care este bine paralelizată și, prin urmare, potrivită pentru calculul distribuit. [3] În proiectul Docking@Home, modelarea legării ligandului la locul de legare a proteinei este realizată folosind modulul software CHARMM . Procesul constă din mai multe încercări independente cu orientare spațială și conformație ligand diferită. [unu]

Detalii și statistici ale proiectului

Realizări științifice

Note

  1. 1 2 http://ieeexplore.ieee.org/xpl/freeabs_all.jsp?arnumber=4228396 Arhivat 27 martie 2014 la Wayback Machine pdf Arhivat 10 iunie 2010 la Wayback Machine
  2. Știri despre închiderea proiectului Arhivat 17 octombrie 2014.
  3. Stephen Childs; Luc Bouge; Martti Forsell; Traff, Jesper; Strada Achim; Ziegler, Wolfgang; Alexander, Michael Van Cleave. Ateliere Euro-Par 2007: Procesare paralelă: HPPC 2007, UNICORE Summit 2007 și VHPC 2007, Rennes, Franța, 28-31 august 2007, Lucrări selectate revizuite (Note de curs în informatică  ) . - Berlin: Springer, 2008. - P. 85. - ISBN 3-540-78472-1 .

Vezi și

Link -uri