Histon deacetilaza 6

Introdus pe baza PDB 3C5K .

Structuri disponibile

Căutare ortolog: PDBe , RCSB

Lista ID-urilor PDB
3C5K , 3GV4 , 3PHD

Identificatori

Simbol

HDAC6 ; CPBHM; HD6; PPP1R90

ID-uri externe

OMIM: 300272 MGI : 1333752 HomoloGene : 31353 IUPHAR : ChEMBL : 1865 GeneCards : HDAC6 Gene

numărul CE

3.5.1.98

ontologie genetică
Funcţie	• legarea actinei • activitate histon deacetilazei • legarea proteinelor • legarea beta-cateninei • legarea microtubulilor • legarea ionilor de zinc • legarea enzimelor • legarea poliubiquitinei • Activitate histon deacetilazei dependentă de NAD (specifică H3-K14) • legarea histon deacetilazei • activitate tubulin deacetilazei • alfa-tubulină legarea • Activitatea histon-deacetilazei dependentă de NAD (specifică H3-K9) • Activitatea histon-deacetilazei dependentă de NAD (specifică H4-K16) • Legarea proteinei tau • Legarea beta-tubulinei • Legarea proteinei Hsp90 • Legarea complexului dineină • Activitate histon deacetilazei dependentă de NAD (specifică H3-K18)
componenta celulara	• complex de histon deacetilază • nucleu • citoplasmă • citosol • microtubul • complex asociat microtubuli • microtubul citoplasmatic • caveola • corp de incluziune • agresom • complex dineină • axon • dendrit • marginea anterioară a celulei • pericarion • regiunea perinucleară a citoplasmei
proces biologic	• poliubiquitinarea proteinelor • transcripție, model ADN • deacetilarea proteinelor • proces catabolic al proteinelor pliate greșit sau incomplet sintetizate • transportul intracelular al proteinelor • reglarea negativă a depolimerizării microtubulilor • răspunsul la substanța toxică • reglarea pozitivă a transducției semnalului • răspunsul la substanța organică • reglarea activității receptorului • pozitiv reglarea migrării celulelor epiteliale • reglarea negativă a procesului metabolic al peroxidului de hidrogen • reglarea pozitivă a procesului de biosinteză a receptorului • macroautofagie • deacetilarea histonelor • localizarea lizozomului • deacetilarea peptidil-lizinei • răspunsul celular la proteina incorectă din punct de vedere topologic • procesul catabolic al proteinelor dependent de ubiquitină prin intermediul multivezicular calea de sortare a organismului • dezasamblarea complexului proteic • reglarea negativă a dezasamblarii complexului proteic • reglarea negativă a proteolizei • reglarea negativă a transcripției, model ADN • reglarea negativă a activității oxidoreductazei • răspunsul la mi proteină pliată • reglarea mișcării pe bază de microtubuli • reglarea căii de semnalizare a receptorilor de androgeni • reglarea stabilirii localizării proteinei • răspunsul celular la peroxid de hidrogen • asamblarea agresomului • transportul proteinelor poliubiquitinate greșit pliate • deacetilarea Hsp90 • răspuns la factorul de creștere • deacetilarea histonei H3 • deacetilarea histonei H4 • răspuns celular la proteina pliată greșit • reglarea pozitivă a ansamblului complexului proteic mediat de chaperonă • deacetilarea tubulinei • reglarea pozitivă a morții celulare programate mediată de peroxid de hidrogen
Surse: Amigo / QuickGO

Profilul expresiei ARN

Mai multe informatii

ortologii

Vedere

Uman

Mouse

Entrez

RefSeq (ARNm)

RefSeq (proteină)

Locus (UCSC)

Chr HG1436_HG1432_PATCH:
48,66 – 48,68 Mb

Chr X:
7,93 – 7,95 Mb

Căutați în PubMed

[unu]

[2]

Histone deacetilaza 6 ( Histone deacetilaza 6 ) este o enzimă codificată la om de gena HDAC6 [1] [2] .

Funcția

Histonele joacă un rol critic în reglarea transcripției , a ciclului celular și a procesului de dezvoltare. Acetilarea/dezacetilarea histonelor modifică structura cromatinei și afectează transcripția. Histon deacetilaza 6 aparține clasei II a familiei histon deacetilază/acuc/APHA. Conține două domenii catalitice care funcționează independent unul de celălalt. Proteina are activitate de histon deacetilază și inhibă transcripția [3] .

Relevanță clinică

Mutațiile acestei gene au fost asociate cu boala Alzheimer [4] .

Supraexprimarea acestei proteine se corelează cu oncogeneza și supraviețuirea celulară și, de asemenea, promovează metastazarea celulelor canceroase [ 5] .

Funcții

Histone deacetilaza 6 este implicată în dezasamblarea cililor celulari , care este necesar pentru declanșarea mitozei [6] . De asemenea, promovează migrarea celulelor și catalizează deacetilarea α-tubulinei [ 7] , care poate promova metastaza cancerului [5] . Influențează transcripția și translația prin reglarea proteinei de șoc termic Hsp90 și, respectiv, a granulelor de stres [5] .

Cunoscut pentru afinitatea sa mare pentru proteinele ubiquitinate [8] . Histone deacetilaza 6 joacă un rol important în formarea granulelor de stres ; cu inhibarea sau suprimarea farmacologică a sintezei histonei deacetilazei 6 la nivel genetic se oprește formarea granulelor de stres.

Interacțiuni

S-a demonstrat că HDAC6 interacționează cu HDAC11 [9] și ZBTB16 [10] .

HDAC6 interacționează, de asemenea, cu proteina granule de stres G3BP1 [8] .

Vezi și

Histone deacetilaze

Note

↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL Trei proteine definesc o clasă de histon deacetilaze umane legate de drojdia Hda1p // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 1999. - iunie ( vol. 96 , nr. 9 ). - P. 4868-4873 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
↑ Nagase T., Ishikawa K., Suyama M., Kikuno R., Hirosawa M., Miyajima N., Tanaka A., Kotani H., Nomura N., Ohara O. Predicția secvențelor de codificare ale genelor umane neidentificate. XII. Secvențele complete a 100 de noi clone de ADNc din creier care codifică proteine mari in vitro // Cercetare ADN : jurnal. - 1999. - Mai ( vol. 5 , nr. 6 ). - P. 355-364 . - doi : 10.1093/dnares/5.6.355 . — PMID 10048485 .
↑ Gena Entrez: HDAC6 histon deacetilaza 6 . (nedefinit)
↑ Cook C., Gendron TF, Scheffel K., Carlomagno Y., Dunmore J., DeTure M., Petrucelli L. Loss of HDAC6, a novel CHIP substrate, alleviates anormal tau accumulation // Human Molecular Genetics : jurnal. - Oxford University Press , 2012. - 5 aprilie. - doi : 10.1093/hmg/dds125 . — PMID 22492994 .
↑ 1 2 3 Aldana-Masangkay GI, Sakamoto KM Rolul HDAC6 în cancer // BioMed Research International : jurnal. - 2011. - Vol. 2011 . - P. 875824 . - doi : 10.1155/2011/875824 . — PMID 21076528 .
↑ Gradilone SA , Radtke BN , Bogert PS , Huang BQ , Gajdos GB , LaRusso NF Inhibarea HDAC6 restabilește expresia ciliară și scade creșterea tumorii. (engleză) // Cercetarea cancerului. - 2013. - Vol. 73, nr. 7 . - P. 2259-2270. - doi : 10.1158/0008-5472.CAN-12-2938 . — PMID 23370327 .
↑ Gao YS, Hubbert CC, Lu J., Lee YS, Lee JY, Yao TP Histone deacetilaza 6 reglează remodelarea actinei induse de factorul de creștere și endocitoza // Biologie moleculară și celulară : jurnal. - 2007. - Vol. 27 , nr. 24 . - P. 8637-8647 . - doi : 10.1128/MCB.00393-07 . — PMID 17938201 .
↑ 1 2 Kwon S., Zhang Y., Matthias P. Deacetilaza HDAC6 este o nouă componentă critică a granulelor de stres implicate în răspunsul la stres // Genes & Development : journal . - 2007. - Decembrie ( vol. 21 , nr. 24 ). - P. 3381-3394 . - doi : 10.1101/gad.461107 . — PMID 18079183 .
↑ Gao L., Cueto MA, Asselbergs F., Atadja P. Clonarea și caracterizarea funcțională a HDAC11, un nou membru al familiei histon-deacetilază umane // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - iulie ( vol. 277 , nr. 28 ). - P. 25748-25755 . - doi : 10.1074/jbc.M111871200 . — PMID 11948178 .
↑ Chauchereau A., Mathieu M., de Saintignon J., Ferreira R., Pritchard LL, Mishal Z., Dejean A., Harel-Bellan A. HDAC4 mediates transcriptional repression by the acute promyelocytic leucemia-associated protein PLZF . ) / / Oncogene : jurnal. - 2004. - noiembrie ( vol. 23 , nr. 54 ). - P. 8777-8784 . - doi : 10.1038/sj.onc.1208128 . — PMID 15467736 .

Literatură

Pazin MJ, Kadonaga JT Ce se întâmplă cu deacetilarea și transcripția histonelor? (Engleză) // Cell : journal. - Cell Press , 1997. - Vol. 89 , nr. 3 . - P. 325-328 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80211-1 . — PMID 9150131 .
Wolffe AP Control transcripțional. Reprimare păcătoasă (engleză) // Natura. - 1997. - Vol. 387 , nr. 6628 . - P. 16-7 . - doi : 10.1038/387016a0 . — PMID 9139815 .
Huynh KD, Fischle W., Verdin E., Bardwell VJ BCoR, un nou corepresor implicat în reprimarea BCL-6 // Genes & Development : journal . - 2000. - Vol. 14 , nr. 14 . - P. 1810-1823 . - doi : 10.1101/gad.14.14.1810 . — PMID 10898795 .
Mahlknecht U., Schnittger S., Landgraf F., Schoch C., Ottmann OG, Hiddemann W., Hoelzer D. Atribuirea genei histonei deacetilazei 6 umane (HDAC6) la cromozomul X p11.23 prin hibridizare in situ (ing. ) // Citogenetica și cercetarea genomului : jurnal. - 2001. - Vol. 93 , nr. 1-2 . - P. 135-136 . - doi : 10.1159/000056967 . — PMID 11474198 .
Kao HY, Lee CH, Komarov A., Han CC, Evans RM Izolarea și caracterizarea HDAC10 de mamifer, o nouă histonă deacetilază (engleză) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 1 . - P. 187-193 . - doi : 10.1074/jbc.M108931200 . — PMID 11677242 .
Seigneurin-Berny D., Verdel A., Curtet S., Lemercier C., Garin J., Rousseaux S., Khochbin S. Identification of Components of the Murine Histone Deacetylase Complex: Link between Acetylation and Ubiquitination Signaling Pathways ) // Biologie moleculară și celulară : jurnal. - 2001. - Vol. 21 , nr. 23 . - P. 8035-8044 . - doi : 10.1128/MCB.21.23.8035-8044.2001 . — PMID 11689694 .
Tong JJ, Liu J., Bertos NR, Yang XJ Identificarea HDAC10, o nouă histonă deacetilază umană de clasă II care conține un domeniu bogat în leucină // Cercetarea acizilor nucleici : jurnal. - 2002. - Vol. 30 , nr. 5 . - P. 1114-1123 . doi : 10.1093/nar/ 30.5.1114 . — PMID 11861901 .
Gao L., Cueto MA, Asselbergs F., Atadja P. Clonarea și caracterizarea funcțională a HDAC11, un nou membru al familiei histon-deacetilazelor umane // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 28 . - P. 25748-25755 . - doi : 10.1074/jbc.M111871200 . — PMID 11948178 .
Hubbert C., Guardiola A., Shao R., Kawaguchi Y., Ito A., Nixon A., Yoshida M., Wang XF, Yao TP HDAC6 este o deacetilază asociată microtubulilor // Nature . - 2002. - Vol. 417 , nr. 6887 . - P. 455-458 . - doi : 10.1038/417455a . — PMID 12024216 .
Kirsh O., Seeler JS, Pichler A., Gast A., Müller S., Miska E., Mathieu M., Harel-Bellan A., Kouzarides T., Melchior F., Dejean A. The SUMO E3 ligase RanBP2 promovează modificarea deacetilazei HDAC4 // The EMBO Journal : jurnal. - 2002. - Vol. 21 , nr. 11 . - P. 2682-2691 . - doi : 10.1093/emboj/21.11.2682 . — PMID 12032081 .
Hook SS, Orian A. , Cowley SM , Eisenman RN . - 2002. - Vol. 99 , nr. 21 . - P. 13425-13430 . - doi : 10.1073/pnas.172511699 . — PMID 12354939 .
Westendorf JJ, Zaidi SK, Cascino JE, Kahler R., van Wijnen AJ, Lian JB, Yoshida M., Stein GS, Li X. Runx2 (Cbfa1, AML-3) Interacționează cu Histone Deacetylase 6 și reprimă promotorul p21CIP1/WAF1 (Engleză) // Biologie moleculară și celulară : jurnal. - 2002. - Vol. 22 , nr. 22 . - P. 7982-7992 . - doi : 10.1128/MCB.22.22.7982-7992.2002 . — PMID 12391164 .
North BJ, Marshall BL, Borra MT, Denu JM, Verdin E. Ortologul uman Sir2, SIRT2, este o tubulin deacetilază dependentă de NAD+ // Celulă moleculară : jurnal. - 2003. - Vol. 11 , nr. 2 . - P. 437-444 . - doi : 10.1016/S1097-2765(03)00038-8 . — PMID 12620231 .
Voelter-Mahlknecht S., Mahlknecht U. Clonarea și caracterizarea structurală a genei histonei deacetilază 6 umană // Jurnalul Internațional de Medicină Moleculară : jurnal. - 2004. - Vol. 12 , nr. 1 . - P. 87-93 . - doi : 10.3892/ijmm.12.1.87 . — PMID 12792815 .
Brush MH, Guardiola A., Connor JH, Yao TP, Shenolikar S. Inhibitorii de deactilază perturbă complexele celulare care conțin proteine fosfataze și deacetilaze // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2004. - Vol. 279 , nr. 9 . - P. 7685-7691 . - doi : 10.1074/jbc.M310997200 . — PMID 14670976 .
Pandey UB, Batlevi Y., Baehrecke EH, Taylor JP HDAC6 la intersecția dintre autofagie, sistemul ubiquitin-proteazom și neurodegenerarea (engleză) // Autophagy: journal. — Vol. 3 , nr. 6 . - P. 643-645 . - doi : 10.4161/auto.5050 . — PMID 17912024 . (Epub 2007 10 septembrie)
Pandey UB, Nie Z., Batlevi Y., McCray BA, Ritson GP, Nedelsky NB, Schwartz SL, DiProspero NA, Knight MA, Schuldiner O., Padmanabhan R., Hild M., Berry DL, Garza D., Hubbert CC, Yao TP, Baehrecke EH, Taylor JP HDAC6 salvează neurodegenerarea și oferă o legătură esențială între autofagie și UPS // Nature : journal. - 2007. - 14 iunie ( vol. 447 , nr. 7146 ). - P. 859-863 . - doi : 10.1038/nature05853 . — PMID 17568747 .