HMG20B

Grupul de mobilitate ridicată 20B

PDB se bazează pe 2crj.

Structuri disponibile

Căutare ortolog: PDBe , RCSB

Lista ID-urilor PDB
2crj

Identificatori

Simbol

HMG20B ; BRAF25; BRAF35; HMGX2; HMGXB2; PP7706; SMARCE1r; SOXL; pp8857

ID-uri externe

OMIM: 605535 MGI : 1341190 HomoloGene : 74949 GeneCards : HMG20B Gene

ontologie genetică
Funcţie	• Legarea ADN-ului • legarea de proteine • activitate de heterodimerizare a proteinelor
componenta celulara	• nucleu • nucleoplasmă • cromozom • nucleol
proces biologic	• transcriere, ADN-şablon • reglarea transcripției, modelat de ADN • ciclu celular • coagularea sângelui • modificarea cromatinei • reglarea negativă a sumoilării proteinelor • diferențierea celulelor musculare scheletice • reglarea pozitivă a diferenţierii neuronilor
Surse: Amigo / QuickGO

Profilul expresiei ARN

Mai multe informatii

ortologii

Vedere

Uman

Mouse

Entrez

RefSeq (ARNm)

RefSeq (proteină)

Locus (UCSC)

Chr 19:
3,57 – 3,58 Mb

Chr 10:
81,35 – 81,35 Mb

Căutați în PubMed

[unu]

[2]

Regulatorul cromatinei asociat cu SWI/SNF, asociat cu șablon, dependent de actină, membru dependent de 1 al subfamiliei E , este o proteină codificată la om de gena HMG20B [1] [2] .

Interacțiuni

S-a demonstrat că HMG20B interacționează cu KIF4A [3] , HDAC1 [4] , histon deacetilaza 2 [4] [5] , PHF21A [4] [6] , RCOR1 [4] și BRCA2 [4] [7] .

Note

↑ Sumoy L., Carim L., Escarceller M., Nadal M., Gratacos M., Pujana MA, Estivill X., Peral B. HMG20A și HMG20B mapează pe cromozomii umani 15q24 și 19p13.3 și constituie o clasă distinctă de HMG -box gene cu expresie omniprezentă // Cytogenetics and Genome Research : jurnal. - 2000. - iunie ( vol. 88 , nr. 1-2 ). - P. 62-7 . - doi : 10.1159/000015486 . — PMID 10773667 .
↑ Gena Entrez: grupul 20B cu mobilitate ridicată HMG20B . Arhivat din original pe 5 decembrie 2010. (nedefinit)
↑ Lee, Young Mi; Kim Wankee. Asocierea membrului 4 al proteinei superfamiliei kinesinei umane cu factorul 35 asociat cu BRCA2 // Biochemical Journal : jurnal. — Anglia, 2003. — Septembrie ( vol. 374 , nr. Pt 2 ). - P. 497-503 . - doi : 10.1042/BJ20030452 . — PMID 12809554 .
↑ 1 2 3 4 5 Hakimi, Mohamed-Ali; Bochar Daniel A; Chenoweth Josh; Lane William S; Mandel Gail; Shiekhattar Ramin. Un complex core-BRAF35 care conține histon deacetilază mediază reprimarea genelor specifice neuronale (engleză) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - Statele Unite ale Americii, 2002. - Mai ( vol. 99 , nr. 11 ). - P. 7420-7425 . — ISSN 0027-8424 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. O genă candidată a retardului mental legat de X este o componentă a unei noi familii de complexe care conțin histon deacetilază (engleză) // Journal of Biological Chemistry : journal. - Statele Unite ale Americii, 2003. - Februarie ( vol. 278 , nr. 9 ). - P. 7234-7239 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
↑ Iwase, Shigeki; Januma Aya; Miyamoto Kiyoko; Shono Naomi Honda Arata; Yanagisawa Junn; Baba Tadashi. Caracterizarea BHC80 în complexul BRAF-HDAC, implicat în reprimarea genelor specifice neuronului // Comunicații de cercetare biochimică și biofizică : jurnal. - Statele Unite ale Americii, 2004. - Septembrie ( vol. 322 , nr. 2 ). - P. 601-608 . — ISSN 0006-291X . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
↑ Marmorstein, LY; Kinev A.V.; Chan GK; Bochar D.A.; Beniya H; Epstein JA; Yen TJ; Shiekhattar R. Un complex uman BRCA2 care conține o componentă structurală de legare a ADN-ului influențează progresia ciclului celular // Cell : journal. - Statele Unite: Cell Press , 2001. - Ianuarie ( vol. 104 , nr. 2 ). - P. 247-257 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . — PMID 11207365 .

Literatură

Wattler F., Wattler S., Kelly M., et al. Clonarea, localizarea cromozomială și analiza expresiei murine Smarce1 legate, un nou membru al familiei de gene de grup 365 cu mobilitate ridicată // Genomics: journal. - 1999. - Vol. 60 , nr. 2 . - P. 172-178 . - doi : 10.1006/geno.1999.5913 . — PMID 10486208 .
Marmorstein LY, Kinev AV, Chan GK și colab. Un complex BRCA2 uman care conține o componentă structurală de legare a ADN-ului influențează progresia ciclului celular // Cell : journal. - Cell Press , 2001. - Vol. 104 , nr. 2 . - P. 247-257 . - doi : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . — PMID 11207365 .
Lee YM, Shin H., Choi W., et al. Caracterizarea proteinei umane de grup SMARCE1r cu mobilitate ridicată (engleză) // Biochimica et Biophysica Acta : jurnal. - 2002. - Vol. 1574 , nr. 3 . - P. 269-276 . - doi : 10.1016/s0167-4781(01)00373-6 . — PMID 11997092 .
Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., et al. Un complex core-BRAF35 care conține histon deacetilază mediază reprimarea genelor specifice neuronale (engleză) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2002. - Vol. 99 , nr. 11 . - P. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
Wang C., McCarty IM, Balazs L., et al. Clonarea unui ADNc care codifică o proteină îmbinată alternativ a factorului 35 asociat BRCA2 // Comunicații de cercetare biochimică și biofizică : jurnal. - 2002. - Vol. 295 , nr. 1 . - P. 129-135 . - doi : 10.1016/S0006-291X(02)00624-1 . — PMID 12083779 .
Wang C., McCarty IM, Balazs L., et al. Detectarea imunohistologică a BRAF25 în probele de tumoră și cancer de prostată umană // Comunicații de cercetare biochimică și biofizică : jurnal. - 2002. - Vol. 295 , nr. 1 . - P. 136-141 . - doi : 10.1016/S0006-291X(02)00625-3 . — PMID 12083780 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH și colab. Generarea și analiza inițială a mai mult de 15.000 de secvențe de ADNc umane și de șoarece de lungime completă // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, et al. O genă candidată a retardului mental legat de X este o componentă a unei noi familii de complexe care conțin histon deacetilază (engleză) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2003. - Vol. 278 , nr. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
Lee YM, Kim W. Asociația membrului 4 al proteinei superfamiliei kinesinei umane cu factorul 35 asociat cu BRCA2 // Biochemical Journal : jurnal. - 2003. - Vol. 374 , nr. Pt 2 . - P. 497-503 . - doi : 10.1042/BJ20030452 . — PMID 12809554 .
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Secvențierea și caracterizarea completă a 21.243 de ADNc umani de lungime completă // Nature Genetics : journal . - 2004. - Vol. 36 , nr. 1 . - P. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Grimwood J., Gordon LA, Olsen A., et al. Secvența ADN și biologia cromozomului uman 19 (engleză) // Nature : journal. - 2004. - Vol. 428 , nr. 6982 . - P. 529-535 . - doi : 10.1038/nature02399 . — PMID 15057824 .
Iwase S., Januma A., Miyamoto K., et al. Caracterizarea BHC80 în complexul BRAF-HDAC, implicat în reprimarea genelor specifice neuronului // Comunicații de cercetare biochimică și biofizică : jurnal. - 2004. - Vol. 322 , nr. 2 . - P. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA, et al. Starea, calitatea și extinderea proiectului ADNc complet al NIH: Colecția de gene de mamifere (MGC ) // Cercetarea genomului : jurnal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Rual JF, Venkatesan K., Hao T., et al. Către o hartă la scară proteomă a rețelei de interacțiune proteină-proteină umană (engleză) // Nature : journal. - 2005. - Vol. 437 , nr. 7062 . - P. 1173-1178 . - doi : 10.1038/nature04209 . — PMID 16189514 .