PHF21A

Proteina degetului PHD 21A

Introdus pe baza PDB 2PUY .

Structuri disponibile

Căutare ortolog: PDBe , RCSB

Lista ID-urilor PDB
2PUY , 2YQL

Identificatori

Simbol

PHF21A ; BHC80

ID-uri externe

OMIM: 608325 HomoloGene : 9597 GeneCards : PHF21A Gene

ontologie genetică
Funcţie	• Legarea ADN-ului • legarea cromatinei • legarea ionilor de zinc
componenta celulara	• complex histon deacetilază • nucleoplasmă
proces biologic	• reglarea negativă a transcripției din promotorul ARN polimerazei II • comportament al alăptării • transcripție, model ADN • reglarea transcripției, model ADN • coagulare a sângelui • modificarea cromatinei
Surse: Amigo / QuickGO

Profilul expresiei ARN

Mai multe informatii

ortologii

Vedere

Uman

Mouse

Entrez

RefSeq (ARNm)

RefSeq (proteină)

Locus (UCSC)

Chr 11:
45,95 – 46,14 Mb

Chr 2:
92,09 – 92,36 Mb

Căutați în PubMed

[unu]

[2]

Proteina degetului PHD 21A este codificată la om de gena PHF21A . [1] [2] [3]

Funcția

PHF21A este o componentă a complexului BRAF35 (MIM 605535)/Histone Deacetylase ( HDAC , vezi MIM 601241) complex (BHC), care mediază reprimarea genelor specifice neuronului prin elemente de reglare cis cunoscute ca element represor 1 (RE1) sau restrictiv neuronal. amortizor de zgomot (NRS) (Hakimi et al., 2002). [3]

Interacțiuni

S-a demonstrat că PHF21A interacționează cu:

Note

↑ Nagase T., Kikuno R., Hattori A., Kondo Y., Okumura K., Ohara O. Prediction of the coding sequences of neidentified human genes. XIX. Secvențele complete a 100 de noi clone de ADNc din creier care codifică proteine mari in vitro // Cercetare ADN : jurnal. - 2000. - Februarie ( vol. 7 , nr. 6 ). - P. 347-355 . - doi : 10.1093/dnares/7.6.347 . — PMID 11214970 .
↑ 1 2 3 4 5 Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., Lane WS, Mandel G., Shiekhattar R. A core-BRAF35 complex containing histone deacetylase mediates repression of neuronal-specific genes // Proceedings of the National Academy of Sciences al Statelor Unite ale Americii : jurnal. - 2002. - Mai ( vol. 99 , nr. 11 ). - P. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
↑ 1 2 Gena Entrez: PHF21A PHD finger protein 21A . Arhivat din original pe 5 decembrie 2010. (nedefinit)
↑ 1 2 3 4 Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Caracterizarea BHC80 în complexul BRAF-HDAC, implicat în reprimarea genelor specifice neuronului .) // Comunicari de cercetare biochimică și biofizică : jurnal. - 2004. - Septembrie ( vol. 322 , nr. 2 ). - P. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
↑ Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. O genă candidată a retardului mental legat de X este o componentă a unei noi familii de complexe care conțin histon deacetilază // Journal of Biological Chemistry : journal . - 2003. - Februarie ( vol. 278 , nr. 9 ). - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .

Literatură

Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. O genă candidată a retardului mintal legată de X este o componentă a unei noi familii de complexe care conțin histon deacetilază (engleză) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2003. - Vol. 278 , nr. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Caracterizarea BHC80 în complexul BRAF-HDAC, implicat în reprimarea genelor specifice neuronului (engleză) // Biochimic și Comunicarea cercetării biofizice : jurnal. - 2004. - Vol. 322 , nr. 2 . - P. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
Shi YJ, Matson C., Lan F., Iwase S., Baba T., Shi Y. Reglarea activității histon-demetilazei LSD1 prin factorii săi asociați // Molecular Cell : jurnal. - 2005. - Vol. 19 , nr. 6 . - P. 857-864 . - doi : 10.1016/j.molcel.2005.08.027 . — PMID 16140033 .
Rual JF, Venkatesan K., Hao T., Hirozane-Kishikawa T., Dricot A., Li N., Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M., Ayivi-Guedehoussou N., Klitgord N., Simon C., Boxem M., Milstein S., Rosenberg J., Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G., Li S., Albala JS, Lim J., Fraughton C., Llamosas E., Cevik S., Bex C. , Lamesch P., Sikorski RS, Vandenhaute J., Zoghbi HY, Smolyar A., Bosak S., Sequerra R., Doucette-Stamm L., Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M. Towards a proteome -harta la scară a rețelei de interacțiune proteină-proteină umană (ing.) // Nature : journal. - 2005. - Vol. 437 , nr. 7062 . - P. 1173-1178 . - doi : 10.1038/nature04209 . — PMID 16189514 .
Hailesellasse Sene K., Porter CJ, Palidwor G., Perez-Iratxeta C., Muro EM, Campbell PA, Rudnicki MA, Andrade-Navarro MA Funcția genei în diferențierea timpurie a celulelor stem embrionare de șoarece // BMC Genomics : jurnal. - 2007. - Vol. 8 . — P. 85 . - doi : 10.1186/1471-2164-8-85 . — PMID 17394647 .