PRPF3
Ribonucleoproteina mică U4/U6 Prp3 este o proteină care la om este codificată de gena PRPF3 . [unu]
Îndepărtarea intronilor din pre-ARNm nuclear are loc în complexe numite spliceozomi , care constau din 4 particule de ribonucleoproteină nucleară mică ( ARNsn ) și un număr nedeterminat de factori de co- splicing temporal . PRPF3 este una dintre numeroasele proteine care leagă snRNP-urile la U4 și U6. [unu]
Interacțiuni
S-a demonstrat că PRPF3 interacționează cu DVL3. [2]
Note
- ↑ 1 2 Gena Entrez: PRPF3 PRP3 pre-mARN factor de procesare 3 omolog (S. cerevisiae) . Arhivat din original pe 5 decembrie 2010. (nedefinit)
- ↑ Rual, Jean-François; Venkatesan Kavitha, Hao Tong, Hirozane-Kishikawa Tomoko, Dricot Amélie, Li Ning, Berriz Gabriel F., Gibbons Francis D., Dreze Matija, Ayivi-Guedehoussou Nono, Klitgord Niels, Simon Christophe, Boxem Mike, Milstein Stuart, Rosenberg Jennifer, Goldberg Debra S., Zhang Lan V., Wong Sharyl L., Franklin Giovanni, Li Siming, Albala Joanna S., Lim Janghoo, Fraughton Carlene, Llamosas Estelle, Cevik Sebiha, Bex Camille, Lamesch Philippe, Sikorski Robert S., Vandenhaute Jean, Zoghbi Huda Y., Smolyar Alex, Bosak Stephanie, Sequerra Reynaldo, Doucette-Stamm Lynn, Cusick Michael E., Hill David E., Roth Frederick P., Vidal Marc. Către o hartă la scară proteomă a rețelei de interacțiune proteină-proteină umană (engleză) // Nature : journal. - Anglia, 2005. - octombrie ( vol. 437 , nr. 7062 ). - P. 1173-1178 . - doi : 10.1038/nature04209 . — PMID 16189514 .
Link -uri
Literatură
- Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: o metodă simplă de înlocuire a structurii capacului ARNm eucariote cu oligoribonucleotide. (engleză) // Gene : jurnal. - Elsevier , 1994. - Vol. 138 , nr. 1-2 . - P. 171-174 . - doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . — PMID 8125298 .
- Xu SY, Schwartz M., Rosenberg T., Gal A. Un al nouălea loc (RP18) pentru hărțile retinitei pigmentare autosomale dominante în regiunea pericentromerică a cromozomului 1 // Genetica moleculară umană : jurnal. - Oxford University Press , 1997. - Vol. 5 , nr. 8 . - P. 1193-1197 . doi : 10.1093 / hmg/5.8.1193 . — PMID 8842740 .
- Wang A., Forman-Kay J., Luo Y., şi colab. Identificarea și caracterizarea genelor umane care codifică Hprp3p și Hprp4p, componente care interacționează ale spliceozomului // Genetica moleculară umană : jurnal. - Oxford University Press , 1997. - Vol. 6 , nr. 12 . - P. 2117-2126 . - doi : 10.1093/hmg/6.12.2117 . — PMID 9328476 .
- Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., et al. Construcția și caracterizarea unei biblioteci de ADNc îmbogățite cu lungimea completă și a unei biblioteci de ADNc îmbogățite la capătul 5’ // Gene : jurnal. - Elsevier , 1997. - Vol. 200 , nr. 1-2 . - P. 149-156 . - doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . — PMID 9373149 .
- Horowitz DS, Kobayashi R., Krainer AR O nouă ciclofilină și omologii umani ai drojdiei Prp3 și Prp4 formează un complex asociat cu snRNPs U4/U6 // ARN: jurnal. - 1997. - Vol. 3 , nr. 12 . - P. 1374-1387 . — PMID 9404889 .
- Heng HH, Wang A., Hu J. Cartografierea genelor umane HPRP3 și HPRP4 care codifică factorii de îmbinare asociați cu U4/U6 la cromozomii 1q21.1 și 9q31-q33 // Genomics : journal. - Academic Press , 1998. - Vol. 48 , nr. 2 . - P. 273-275 . doi : 10.1006/ geno.1997.5181 . — PMID 9521884 .
- Xu SY, Rosenberg T., Gal A. Cartografierea genetică rafinată a locusului retinitei pigmentare autosomal dominante RP18 reduce regiunea critică la 2 cM între D1S442 și D1S2858 pe cromozomul 1q (engleză) // Human Genetics : journal. - 1998. - Vol. 102 , nr. 4 . - P. 493-494 . - doi : 10.1007/s004390050728 . — PMID 9600251 .
- Reidt U., Reuter K., Achsel T., et al. Structura cristalină a particulelor de ribonucleoproteină nucleară mică umană U4/U6 SnuCyp-20, o ciclofilină nucleară (engleză) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 11 . - P. 7439-7442 . doi : 10.1074 / jbc.275.11.7439 . — PMID 10713041 .
- Chakarova CF, Hims MM, Bolz H., et al. Mutații în HPRP3, un al treilea membru al genelor factorului de splicing pre-ARNm, implicate în retinita pigmentară autosomal dominantă // Genetica moleculară umană : jurnal. - Oxford University Press , 2002. - Vol. 11 , nr. 1 . - P. 87-92 . - doi : 10.1093/hmg/11.1.87 . — PMID 11773002 .
- Horowitz DS, Lee EJ, Mabon SA, Misteli T. A cyclophilin functions in pre-mRNA splicing // The EMBO Journal : jurnal. - 2002. - Vol. 21 , nr. 3 . - P. 470-480 . - doi : 10.1093/emboj/21.3.470 . — PMID 11823439 .
- Gonzalez-Santos JM, Wang A., Jones J., et al. Regiunea centrală a factorului uman de îmbinare Hprp3p interacționează cu Hprp4p (engleză) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 26 . - P. 23764-23772 . - doi : 10.1074/jbc.M111461200 . — PMID 11971898 .
- Nottrott S., Urlaub H., Lührmann R. Interacțiuni ierarhice, grupate de proteine cu snRNA U4/U6: un rol biochimic pentru proteinele U4/U6 // Jurnalul EMBO : jurnal. - 2002. - Vol. 21 , nr. 20 . - P. 5527-5538 . - doi : 10.1093/emboj/cdf544 . — PMID 12374753 .
- Ajuh P., Chusainow J., Ryder U., Lamond AI O funcție nouă pentru factorul uman C1 (HCF-1), o proteină gazdă necesară pentru infecția cu virusul herpes simplex, în splicing pre-mARN // Jurnalul EMBO : jurnal. - 2003. - Vol. 21 , nr. 23 . - P. 6590-6602 . - doi : 10.1093/emboj/cdf652 . — PMID 12456665 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH și colab. Generarea și analiza inițială a mai mult de 15.000 de secvențe de ADNc umane și de șoarece de lungime completă // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
- Martínez-Gimeno M., Gamundi MJ, Hernan I., et al. Mutații în genele factorului de splicing pre-mRNA PRPF3, PRPF8 și PRPF31 în familiile spaniole cu retinită pigmentară autosomal dominantă // Investigative Oftalmologie și Științe vizuale : jurnal. - 2003. - Vol. 44 , nr. 5 . - P. 2171-2177 . - doi : 10.1167/iovs.02-0871 . — PMID 12714658 .
- Reidt U., Wahl MC, Fasshauer D., et al. Structura cristalină a unui complex între ciclofilina H spliceosomală umană și o peptidă U4/U6 snRNP-60K // Journal of Molecular Biology : jurnal. - 2003. - Vol. 331 , nr. 1 . - P. 45-56 . - doi : 10.1016/S0022-2836(03)00684-3 . — PMID 12875835 .
- Wada Y., Itabashi T., Sato H., Tamai M. Caracteristici clinice ale unei familii japoneze cu retinită pigmentară autosomal dominantă asociată cu o mutație Thr494Met în gena HPRP3 (engleză) // Graefes Arch. Clin. Exp. Oftalmol. : jurnal. - 2005. - Vol. 242 , nr. 11 . - P. 956-961 . - doi : 10.1007/s00417-004-0923-x . — PMID 15085354 .
- Stanĕk D., Neugebauer KM Detectarea intermediarilor de asamblare snRNP în corpurile Cajal prin transferul de energie prin rezonanță fluorescentă // Journal of Cell Biology : jurnal. - 2004. - Vol. 166 , nr. 7 . - P. 1015-1025 . - doi : 10.1083/jcb.200405160 . — PMID 15452143 .
- Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA, et al. Starea, calitatea și extinderea proiectului ADNc complet al NIH: Colecția de gene de mamifere (MGC ) // Cercetarea genomului : jurnal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
- Maita H., Kitaura H., Ariga H., Iguchi-Ariga SM Asociația PAP-1 și Prp3p, produse ale genelor cauzatoare ale retinitei pigmentare dominante, în complexul tri-snRNP // Cercetare experimentală celulară : jurnal. - 2005. - Vol. 302 , nr. 1 . - P. 61-8 . - doi : 10.1016/j.yexcr.2004.08.022 . — PMID 15541726 .
Modificări post-transcripționale |
---|
Nuclear |
- precursor ARNm
- Capac
- Poliadenilare ( CPSF
- CstF
- Polinucleotid adenililtransferaza
- PABPN1
- Factori de tăiere )
- Poly(A) binding protein
- Editarea ARN
- Poliuridilare
| Îmbinare |
| factori pre-ARNm |
- PLRG1 ( PRPF3
- PRPF4
- PRPF4B
- PRPF6
- PRPF8
- PRPF18
- PRPF19
- PRPF31
- PRPF38A
- PRPF38B
- PRPF39
- PRPF40A
- PRPF40B )
|
---|
|
---|
|
---|
Citosolic |
- Metilarea capacului
- decapsularea ARNm ( DCP1A
- DCP1B
- DCP2
- DCPS
- EDC3
- EDC4 )
|
---|