PRPF31

Omologul 31 al factorului de procesare pre-ARNm PRP31 (S. cerevisiae [  1] ) , cunoscut și ca PRPF31 , este o proteină codificată de genomul uman PRPF31. [2]

Funcția

PRPF31 este gena care codifică factorul de splicing hPRP31. Acest lucru este important pentru formarea splicing-urilor hPRP31 asociate cu di-snRNP-urile U4/U4 și interacționarea cu un alt factor de splicing hPRP6 pentru a forma tri-snRNP-urile U4/U6-U5. S-a descoperit că atunci când hPRP31 ARNi eșuează, di-snPRNP-urile U4/U6 se acumulează în corpurile Cajal și nu se poate forma tri-snRNP U4/U6-U5. [3]

PRPF31 câștigă introni după adăugarea de ARN-uri U4 și U6 și 15,5K din proteina NHP2L1. Adăugarea de PRPF31 este critică pentru tranziția complexului spliceosome la o stare activată. [patru]

Semnificație clinică

O mutație în PRPF31 este una dintre cele 4 mutații cunoscute ale factorului de despicare cunoscute pentru a provoca retinită pigmentară . Prima mutație în PRPF31 a fost descoperită de Vithana și colab. în 2001. [2] Retinita pigmentară (RP) este un grup eterogen clinic și genetic de distrofie retiniană caracterizată prin degenerarea progresivă a fotoreceptorilor care duce în cele din urmă la tulburări vizuale severe. [5]

Moștenire

Mutațiile din PRPF31 sunt moștenite într-o manieră autosomal dominantă, rezultând 2,5% din cazurile de retinită pigmentară autosomal dominantă (adRP) în populația mixtă din Marea Britanie. [6] Cu toate acestea, modelul de moștenire al mutațiilor PRPF31 nu este în mod obișnuit moștenirea dominantă, arătând fenomenul de penetrare parțială, prin care mutațiile dominante apar cu generațiile „sărite”. Se crede că acest lucru se datorează prezenței a două alele de tip sălbatic , o alele cu expresie  ridicată și o alele cu expresie scăzută. Dacă pacientul are o alelă mutantă și o alelă foarte exprimată, atunci acestea nu reprezintă un fenotip de boală. Daca pacientul are o alela mutanta si o alela cu expresivitate scazuta, nivelul de proteine ​​reziduale scade sub pragul de functionare normala, caz in care reprezinta un fenotip de boala. Prin urmare, modelul de moștenire PRPF31 poate fi considerat un tip de haploinsuficiență. Această variantă de haploinsuficiență este observată doar în alte două boli umane: protoporfiria eritrocitară cauzată de mutații ale genei FECH; și ovalocitoză ereditară cauzată de mutații ale genei spectrinei . [7] [8]

Note

1. ↑ Probabil Saccharomyces cerevisiae este o drojdie de brutărie, adică omologul uman al acestei ciuperci.
2. ↑ 1 2 Vithana EN, Abu-Safieh L., Allen MJ, Carey A., Papaioannou M., Chakarova C., Al-Maghtheh M., Ebenezer ND, Willis C., Moore AT, Bird AC, Hunt DM, Bhattacharya SS Un omolog uman al genei de splicing pre-ARNm de drojdie, PRP31, stă la baza retinitei pigmentare autosomal dominante pe cromozomul 19q13.4 (RP11  )  // Celulă moleculară : jurnal. - 2001. - august ( vol. 8 , nr. 2 ). - P. 375-381 . - doi : 10.1016/S1097-2765(01)00305-7 . — PMID 11545739 .
3. ↑ Schaffert N., Hossbach M., Heintzmann R., Achsel T., Lührmann R. Reducerea RNAi a hPrp31 duce la o acumulare de di-snRNP U4/U6 în corpurile Cajal  //  Jurnalul EMBO : jurnal. - 2004. - august ( vol. 23 , nr. 15 ). - P. 3000-3009 . - doi : 10.1038/sj.emboj.7600296 . — PMID 15257298 .
4. ^ Liu S., Li P., Dybkov O., Nottrott S., Hartmuth K., Lührmann R., Carlomagno T., Wahl MC Legarea domeniului uman Prp31 Nop la o platformă compozită ARN-proteină în U4  ​​snRNP.)  // Știință: jurnal. - 2007. - Aprilie ( vol. 316 , nr. 5821 ). - P. 115-120 . - doi : 10.1126/science.1137924 . — PMID 17412961 .
5. ↑ Gena Entrez: PRPF31 PRP31 pre-mARN factor de procesare 31 omolog (S. cerevisiae) . (nedefinit)
6. ↑ Waseem NH, Vaclavik V., Webster A., ​​​​Jenkins SA, Bird AC, Bhattacharya SS Mutații în gena care codifică factorul de splicing pre-mRNA, PRPF31, la pacienții cu retinită pigmentară autosomal dominantă   // Investigative Oftalmologie și vizuale Ştiinţă : jurnal. - 2007. - Martie ( vol. 48 , nr. 3 ). - P. 1330-1334 . - doi : 10.1167/iovs.06-0963 . — PMID 17325180 .
7. ↑ Randon J., Boulanger L., Marechal J., Garbarz M., Vallier A., ​​​​Ribeiro L., Tamagnini G., Dhermy D., Delaunay J. A variant of spectrin low-expression alele alpha LELY carrying a mutație ereditară de eliptocitoză în codonul 28  // British  Journal of Hematology : jurnal. - 1994. - noiembrie ( vol. 88 , nr. 3 ). - P. 534-540 . - doi : 10.1111/j.1365-2141.1994.tb05070.x . — PMID 7819065 .
8. ↑ Gouya L., Puy H., Lamoril J., Da Silva V., Grandchamp B., Nordmann Y., Deybach JC. Moștenirea în protoporfiria eritropoietică: o variantă aleică comună a ferochelatazei de tip sălbatic, cu expresie scăzută, reprezintă manifestarea clinică  // American  Journal of Human Genetics : jurnal. - 1998. - iunie ( vol. 93 , nr. 6 ). - P. 2150-2110 . — PMID 10068685 .

Literatură

• Tarizzo ML Organizația Mondială a Sănătății și prevenirea orbirii  (engleză)  // Tranzacții. Secția de Oftalmologie. Academia Americană de Oftalmologie și Otolaringologie: jurnal. - 1975. - Vol. 79 , nr. 3 Pt 2 . - P. OP453-6 . — PMID 1154573 .
• al-Maghtheh M., Inglehearn CF, Keen TJ, et al. Identificarea unui al șaselea locus pentru retinita pigmentară autosomal dominantă pe cromozomul 19  // Human  Molecular Genetics : jurnal. - Oxford University Press , 1994. - Vol. 3 , nr. 2 . - P. 351-354 . - doi : 10.1093/hmg/3.2.351 . — PMID 8004108 .
• Al-Maghtheh M., Vithana E., Tarttelin E., et al. Dovezi pentru un locus major al retinitei pigmentare pe 19q13.4 (RP11) și asocierea cu un fenotip unic de expresivitate bimodală  //  American Journal of Human Genetics : jurnal. - 1996. - Vol. 59 , nr. 4 . - P. 864-871 . — PMID 8808602 .
• Hartley JL, Temple GF, Brasch MA Clonarea ADN-ului folosind recombinarea specifică site-ului in vitro   // Cercetarea genomului : jurnal. - 2001. - Vol. 10 , nr. 11 . - P. 1788-1795 . - doi : 10.1101/gr.143000 . — PMID 11076863 .
• Wiemann S., Weil B., Wellenreuther R., et al. Către un catalog de gene și proteine ​​umane: secvențierea și analiza a 500 de proteine ​​complete noi care codifică ADNc  uman  // Cercetarea genomului : jurnal. - 2001. - Vol. 11 , nr. 3 . - P. 422-435 . - doi : 10.1101/gr.GR1547R . — PMID 11230166 .
• Simpson JC, Wellenreuther R., Poustka A., et al. Localizarea subcelulară sistematică a proteinelor noi identificate prin secvențierea cADN-ului la scară largă  // Rapoarte  EMBO : jurnal. - 2001. - Vol. 1 , nr. 3 . - P. 287-292 . - doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . — PMID 11256614 .
• Vithana EN, Abu-Safieh L., Allen MJ, et al. Un omolog uman al genei de splicing pre-ARNm de drojdie, PRP31, stă la baza retinitei pigmentare autosomal dominante pe cromozomul 19q13.4 (RP11  )  // Celulă moleculară : jurnal. - 2001. - Vol. 8 , nr. 2 . - P. 375-381 . - doi : 10.1016/S1097-2765(01)00305-7 . — PMID 11545739 .
• Makarova OV, Makarov EM, Liu S., et al. Proteina 61K, codificată de o genă (PRPF31) legată de retinita pigmentară autosomal dominantă, este necesară pentru formarea U4/U6 U5 tri-snRNP și splicing pre-ARNm  //  The EMBO Journal : jurnal. - 2002. - Vol. 21 , nr. 5 . - P. 1148-1157 . - doi : 10.1093/emboj/21.5.1148 . — PMID 11867543 .
• Deery EC, Vithana EN, Newbold RJ, et al. Mecanismul bolii pentru retinita pigmentară (RP11) cauzată de mutații în gena factorului de splicing PRPF31   // Human Molecular Genetics : jurnal. - Oxford University Press , 2003. - Vol. 11 , nr. 25 . - P. 3209-3219 . - doi : 10.1093/hmg/11.25.3209 . — PMID 12444105 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH și colab. Generarea și analiza inițială a mai mult de 15.000 de secvențe de ADNc umane și de șoarece de lungime completă  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
• Martínez-Gimeno M., Gamundi MJ, Hernan I., et al. Mutații în genele factorului de splicing pre-mRNA PRPF3, PRPF8 și PRPF31 în familiile spaniole cu retinită pigmentară autosomal dominantă   // Investigative Oftalmologie și Științe vizuale : jurnal. - 2003. - Vol. 44 , nr. 5 . - P. 2171-2177 . - doi : 10.1167/iovs.02-0871 . — PMID 12714658 .
• Scanlan MJ, Gout I., Gordon CM, et al. Imunitatea umorală la cancerul de sân uman: definiția antigenului și analiza cantitativă a expresiei ARNm  (engleză)  // Cancer Immun. : jurnal. - 2003. - Vol. 1 . — P. 4 . — PMID 12747765 .
• Wang L., Ribaudo M., Zhao K., et al. O nouă ștergere în gena de îmbinare pre-mRNA PRPF31 provoacă retinită pigmentară autozomală dominantă într-o familie numeroasă chineză  //  Jurnalul American de Genetică Medicală : jurnal. - 2003. - Vol. 121 , nr. 3 . - P. 235-239 . - doi : 10.1002/ajmg.a.20224 . — PMID 12923864 .
• Reuter TY, Medhurst AL, Waisfisz Q., et al. Ecranele cu două hibride de drojdie implică implicarea proteinelor din anemie Fanconi în reglarea transcripției, semnalizarea celulară, metabolismul oxidativ și transportul celular  // Cercetarea celulară  experimentală : jurnal. - 2003. - Vol. 289 , nr. 2 . - P. 211-221 . - doi : 10.1016/S0014-4827(03)00261-1 . — PMID 14499622 .
• Vithana EN, Abu-Safieh L., Pelosini L., et al. Exprimarea ARNm PRPF31 la pacienții cu retinită pigmentară autosomal dominantă: un indiciu molecular pentru penetranța incompletă? (engleză)  // Investigative oftalmologie și științe vizuale : jurnal. - 2003. - Vol. 44 , nr. 10 . - P. 4204-4209 . - doi : 10.1167/iovs.03-0253 . — PMID 14507862 .
• Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Secvențierea și caracterizarea completă a 21.243 de ADNc umani de lungime completă  // Nature Genetics  : journal  . - 2004. - Vol. 36 , nr. 1 . - P. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
• Grimwood J., Gordon LA, Olsen A., et al. Secvența ADN și biologia cromozomului uman 19  (engleză)  // Nature : journal. - 2004. - Vol. 428 , nr. 6982 . - P. 529-535 . - doi : 10.1038/nature02399 . — PMID 15057824 .
• Xia K., Zheng D., Pan Q., și colab. O nouă mutație a locului de îmbinare PRPF31 într-o familie chineză cu retinită pigmentară autosomal dominantă   // Molecular Vision : jurnal. - 2004. - Vol. 10 . - P. 361-365 . — PMID 15162096 .
• Schaffert N., Hossbach M., Heintzmann R., et al. Reducerea RNAi a hPrp31 duce la o acumulare de di-snRNP U4/U6 în corpurile Cajal  //  The EMBO Journal : jurnal. - 2005. - Vol. 23 , nr. 15 . - P. 3000-3009 . - doi : 10.1038/sj.emboj.7600296 . — PMID 15257298 .
• Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA, et al. Starea, calitatea și extinderea proiectului ADNc complet al NIH: Colecția de gene de mamifere (MGC  )  // Cercetarea genomului : jurnal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .