Familia de plastocianine a proteinelor care leagă cupru

Proteine ​​care leagă cupru, familia plastocianine/azurine

Structura plastocianinei de plop [1] .
Identificatori
Simbol cupru-bind
Pfam PF00127
InterPro IPR000923
PROZITA PDOC00174
SCOP 1plc
SUPERFAMILIE 1plc
Superfamilie OPM 101
proteina OPM 1sfd
CDD cd00920
Structuri proteice disponibile
Pfam structurilor
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsum Model 3D

Familia plastocianinei/azurină a proteinelor care leagă cupru (sau domeniul proteic albastru de tip 1)  este o familie de proteine ​​mici capabile să lege un singur atom de cupru și caracterizate printr-o absorbție puternică care atinge un vârf de aproximativ 600 nm, datorită căreia, în stare redusă, de obicei sunt colorate în albastru strălucitor (vezi proteinele care conțin cupru).proteine ​​) [2] [3] . Cei mai cunoscuți membri ai acestei clase de proteine ​​sunt plastocianinele vegetale , proteine ​​cloroplastice mici, solubile în apă, care transferă un electron din citocromul f și sunt înrudite la distanță cu proteinele bacteriene azurine., care schimbă electroni cu citocromul c551. Această familie include, de asemenea, proteina amicianina din bacterii precum Methylobacterium extorquens sau Paracoccus versutus ( Thiobacillus versutus ) care poate crește pe metilamină ; auracianine A și B din Chloroflexus aurantiacus ; [4] proteina de cupru albastru din Alcaligenes faecalis ; cupredoxină din cojile de Cucumis sativus (castraveți); [5] Cusacianina (proteina albastră de bază) din castraveți; halocianina, o proteină legată de membrană de la Natronomonas pharaonis ( Natronobacterium pharaonis ), [6] pseudoazurină de la Pseudomonas ; rusticyanin din Thiobacillus ferrooxidans ; [7] stellacyanin din Rhus vernicifera (arbore de lac japonez); umecianina din rădăcinile Armoracia rusticana (hrean); și alergenul Ra3 de la ambrozie . Această proteină de polen este evolutiv apropiată de polipeptidele enumerate mai sus, dar pare să fi pierdut capacitatea de a lega cuprul. Deși există o divergență marcată în structura primară a tuturor acestor proteine, locul de legare a cuprului rămâne foarte conservat.

Note

  1. Guss JM, Bartunik HD, Freeman HC . Acuratețe și precizie în analiza structurii proteinelor: rafinarea cu cele mai mici pătrate restricționate a structurii plastocianinei de plop la rezoluție de 1,33 A   // Acta Cryst . B : jurnal. - Uniunea Internațională de Cristalografie , 1992. - Decembrie ( vol. 48 , nr. 6 ). - P. 790-811 . - doi : 10.1107/S0108768192004270 . — PMID 1492962 .
  2. Clingeleffer DJ, Guss JM, Rogers SJ, Freeman HC, Garrett TP Structura cristalină a apoplastocianinei de plop la rezoluție de 1,8-A. Geometria situsului de legare a cuprului este creată de polipeptida  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 1984. - Vol. 259 , nr. 5 . - P. 2822-2825 . — PMID 6698995 .
  3. Hunt LT, Ryden LG Evoluția complexității proteinelor: oxidazele care conțin cupru albastru și proteinele înrudite  //  J. Mol. Evol. : jurnal. - 1993. - Vol. 36 , nr. 1 . - P. 41-66 . - doi : 10.1007/BF02407305 . — PMID 8433378 .
  4. Meyer TE, Han J., McManus JD, Brune DC, Sanders-Loehr J., Cusanovich MA, Tollin G., Blankenship RE Izolarea, caracterizarea și secvențele de aminoacizi ale auracianinelor, proteinelor de cupru albastru din bacteria fotosintetică verde Chloroflexus aurantiacus  (engleză)  // J. Biol. Chim.  : jurnal. - 1992. - Vol. 267 , nr. 10 . - P. 6531-6540 . — PMID 1313011 .
  5. Messerschmidt A., Mann K., Thoenes U., Mehrabian Z., Nalbandyan R., Schafer W. Secvența de aminoacizi a unei proteine ​​de cupru de tip I cu un domeniu C-terminal bogat în serină și hidroxiprolină izolat din castravete peelings  (engleză)  // FEBS Lett. : jurnal. - 1992. - Vol. 314 , nr. 3 . - P. 220-223 . - doi : 10.1016/0014-5793(92)81475-2 . — PMID 1468551 .
  6. Oesterhelt D., Mattar S., Scharf B., Rodewald K., Engelhard M., Kent SB Structura primară a halocianinei, o proteină de cupru albastru arheal, prezice o lipidă de ancorare pentru  fixarea membranei  J.// Chim.  : jurnal. - 1994. - Vol. 269 , nr. 21 . - P. 14939-14945 . — PMID 8195126 .
  7. Yano T., Fukumori Y., Yamanaka T. Secvența de aminoacizi a rusticyaninei izolate din Thiobacillus ferrooxidans  // FEBS Lett  . : jurnal. - 1991. - Vol. 288 , nr. 1 . - P. 159-162 . - doi : 10.1016/0014-5793(91)81025-4 . — PMID 1879547 .