Secvența Shine-Dalgarno

Secvența Shine-Dalgarno ( Eng.  Secvența Shine-Dalgarno, caseta Shine-Dalgarno ) este un situs de legare a ribozomului pe o moleculă de ARNm procariotă , de obicei la o distanță de aproximativ 10 nucleotide de codonul de pornire AUG. [1] Descris de oamenii de știință australieni John Shine și Lynn Dalgarno . [2]

Consensul este o secvență de șase nucleotide AGGAGG; în cazul E. coli , secvența Shine-Dalgarno este AGGAGGU. Secvența complementarăCCUCCU , numită secvență anti-Shine-Dalgarno, este situată la capătul 3’ al moleculei de ARN ribozomal 16S . Interacțiunea complementară dintre secvențele Shine-Dalgarno și anti-Shine-Dalgarno servește la plasarea codonului de pornire a ARNm la locul P al ribozomului pentru a iniția biosinteza proteinei. [3]

Mutațiile din secvența Shine-Dalgarno reduc eficiența translației . Acest lucru se datorează unei scăderi a eficienței formării complexului de subunități ribozomale mARN- 30S . S-a demonstrat că mutațiile complementare în secvența anti-Shine-Dalgarno restabilesc eficiența translației.

În momentul formării complexului de secvență Shine-Dalgarno și anti-Shine-Dalgarno, factorii de inițiere a translației IF2-GTP, IF1, IF3, precum și inițiatorul formilmetionil - ARNt ( fMet-ARNt ) se leagă de 30S-ribozomal. subunitate. Subunitatea ribozomală 50S se alătură apoi complexului de pre-inițiere format. [patru]

Proteina S1 a ribozomilor bacteriilor Gram-negative

În bacteriile Gram-negative , prezența unei secvențe Shine-Dalgarno nu este necesară pentru recunoașterea codonului de pornire . De exemplu, s-a demonstrat că ștergerea secvenței Shine-Dalgarno din ARNr 16S nu conduce la inițierea translației la locurile greșite. Mai mult, unele ARNm procariote nu conțin deloc secvența Shine-Dalgarno. Aparent, proteina ribozomală S1 se leagă AUde secvențe bogate în β care sunt la 15-30 de nucleotide distanță de codonul de pornire.

Vezi și

Note

  1. ↑ Kapp LD, Lorsch JR Mecanica moleculară a traducerii eucariote // Annual Review of Biochemistry 73/2004, 657-704
  2. ↑ Shine J., Dalgarno L. Determinant of cistron specificity in bacterial ribosomes // Nature. - 1975. - Vol. 254, nr. 5495 . — P. 34–8. - doi : 10.1038/254034a0 . — PMID 803646 .
  3. ↑ Noller HF Structura ribozomului bacterian și unele implicații pentru reglarea translațională // Translational Control in Biology and Medicine / Editat de N. Sonenberg, JWB Hershey și MB Mathews. Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Press, 2007. P. 41-58
  4. ↑ Benelli D., Londei P. Begin at the early: evolution of translational initiation // Research in Microbiology 160, 2009, 493-501

Literatură

Link -uri