| Ficoeritrina, lanțuri α/β | |
|---|---|
| Identificatori | |
| Simbol | Phycoerythr_ab |
| Pfam | PF02972 |
| InterPro | IPR004228 |
| SCOP | 1qgw |
| SUPERFAMILIE | 1qgw |
| Structuri proteice disponibile | |
| Pfam | structurilor |
| PDB | RCSB PDB ; PDBe ; PDBj |
| PDBsum | Model 3D |
Ficoeritrina (din altă greacă φῦκος - alge și ἐρῠθρός - roșu) este un pigment fotosintetic roșu suplimentar găsit în cianobacterii și algele roșii . Ficoeritrina, ca toate ficobiliproteinele , constă dintr-o porțiune proteică construită din particule α și β organizate într-un hexagon și legate covalent de cromofori , numite ficobiline . Ficoeritrinele sunt capabile să se lege la cel mai mare număr de ficobiline (până la șase per dimer α-β).
Maximul de absorbție în partea vizibilă a spectrului este de aproximativ 495 și 546/566 nm și depinde de organismul specific . Vârful de emisie este în regiunea de 575 ± 10 nm (ficoeritrina absoarbe lumină verde-albastru deschis/gălbuie și emite lumină galben-portocalie).
Ficoeririna este un pigment auxiliar în clorofilă . Energia luminii este captata de ficoeritrina si apoi transferata in centrul de reactie prin intermediul ficobiliproteinelor ficocianina si aloficocianina .
R-Ficoeritrina este utilizată în laboratoare ca indicator fluorescent pentru prezența cianobacteriilor și pentru marcarea anticorpilor într-o tehnică numită imunofluorescență . Există și alte tipuri de ficoeritrine, cum ar fi B-ficoeritrina, care au caracteristici spectrale ușor diferite. B-Ficoeritrina absoarbe în principal aproximativ 545 nm (verde gălbui deschis) și emite 572 nm (galben), ceea ce o face mai potrivită pentru unele aplicații de laborator. B-Ficoeritrina este, de asemenea, mai puțin lipicioasă decât R-Ficoeritrina și este mai puțin sensibilă la semnalele de fundal datorită legării nespecifice în anumite condiții.
R-Phycoerythrin și B-Phycoerythrin sunt printre cei mai strălucitori coloranți fluorescenți descoperiți.
R-Ficoeritrina este produsă în principal de algele roșii. Proteina este formată din trei subunități diferite, iar compoziția sa variază în funcție de algele care o produc. Cel mai comun aranjament al subunităților R-ficoeritrină este (αβ) 6 γ. Două ficoeritrobiline (PEB) sunt atașate la subunitatea α, două sau trei PEB și o ficourobilină (FUB) sunt atașate la subunitatea β, dar subunitatea γ, conform datelor recente, conține trei PEB și două FUB (γ1) sau unul. sau două PEB și un FUB (γ2). Greutatea moleculară a R-ficoeritrinei este de 250.000 daltoni .
După cum sa menționat mai sus, ficoeritrina poate fi găsită în multe tipuri diferite de alge și, prin urmare, există multe varietăți ale acesteia, care diferă în ceea ce privește nivelul de absorbție și emisie de lumină care este necesar pentru a facilita fotosinteza . Acesta poate fi rezultatul locuirii algelor în coloana de apă și al schimbării rezultate în eficacitatea pigmentului auxiliar.
Odată cu dezvoltarea tehnologiei pentru a evita fotoalbirea rapidă, fluoroforele proteice au devenit un instrument puternic pentru cercetare în domenii precum microscopie , analiza microtubulilor și Western blotting. Având în vedere toate acestea, a devenit avantajos pentru cercetători să caute varietăți de R-Ficoeritrina pentru a determina pe cea mai potrivită pentru fiecare tip de cercetare. Chiar și cea mai mică creștere a fluorescenței poate reduce zgomotul de fundal și poate reduce negativul fals.