Rețeaua metabolică

Rețeaua metabolică  este un set de procese metabolice și fizice care determină proprietățile fiziologice și biochimice ale unei celule . Ca atare, aceste rețele includ reacțiile chimice ale metabolismului , căile metabolice , precum și interacțiunile de reglementare care ghidează aceste reacții.

Datorită secvențierii întregului genom , acum este posibil să se reconstruiască rețeaua de reacții biochimice în multe organisme, de la bacterii la oameni. Unele dintre aceste rețele sunt disponibile online: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) [1] , EcoCyc [2] , BioCyc [3] și metaTIGER [4] . Rețelele metabolice sunt instrumente puternice pentru studierea și modelarea metabolismului.

Utilizare

Rețelele metabolice pot fi utilizate pentru a identifica modelele de comorbiditate la pacienții bolnavi [5] . Unele boli, precum obezitatea și diabetul, pot fi prezente la aceeași persoană în același timp, uneori o boală este un factor de risc semnificativ pentru o altă boală [6] . Fenotipurile bolii în sine sunt de obicei rezultatul incapacității unei celule de a descompune sau de a produce substratul necesar. Cu toate acestea, un defect enzimatic într-o reacție poate afecta fluxurile altor reacții ulterioare. Aceste efecte în cascadă sunt asociate cu boli metabolice asociate cu reacții ulterioare care conduc la efecte comorbide. Astfel, rețelele de boli metabolice pot fi utilizate pentru a determina dacă două tulburări sunt legate datorită răspunsurilor lor corelate [5] .

Vezi și

• Modelarea rețelelor metabolice
• cale metabolică

Referințe

1. ↑ GenomeNet . www.genome.ad.jp . Consultat la 1 aprilie 2020. Arhivat din original pe 24 februarie 2009. (nedefinit)
2. ^ EcoCyc : Encyclopedia of E. coli Genes and Metabolic Pathways . www.ecocyc.org . (nedefinit)
3. ↑ BioCyc Pathway/Genome Database Collection . biocyc.org . (nedefinit)
4. ↑ metaTIGER-Acasă . www.bioinformatics.leeds.ac.uk . Consultat la 9 iunie 2010. Arhivat din original pe 4 martie 2012. (nedefinit)
5. ↑ 1 2 Lee, D.-S. (2008). „Implicațiile topologiei rețelei metabolice umane pentru comorbiditatea bolii.” Proceedings of the National Academy of Sciences . 105 (29): 9880-9885. DOI : 10.1073/pnas.0802208105 . PMID  18599447 .
6. ↑ Ross, R. (2000). „Reducerea obezității și a afecțiunilor comorbide asociate după pierderea în greutate indusă de dietă sau pierderea în greutate indusă de exerciții fizice la bărbați. Un studiu randomizat, controlat” . Analele de Medicină Internă . 133 (2): 92-103. DOI : 10.7326/0003-4819-133-2-200007180-00008 . PMID  10896648 .