Proiectul Proteom uman

Human Proteome Project ( HPP ) este un proiect internațional pentru a crea o hartă a proteomelor care include toate proteinele codificate de genomul uman . Sarcina principală a proiectului este compilarea hărților proteomice ale principalelor proteine ​​din plasma sanguină , ficat , creier [1] .

Istorie

Proiectul internațional „Human Proteome” a început în septembrie 2010 la Sydney , devenind o continuare a proiectului „Human Genome” [2] . Participanții la proiectul Human Proteome includ șase țări inițiatoare: Republica Coreea , SUA , Federația Rusă , Suedia , Canada și Iran ). În ceea ce privește amploarea problemei puse și intensitatea estimată a muncii a muncii, proiectul Human Proteome s-a dovedit a fi mult mai mare decât proiectul Human Genome. În timp ce genomul uman este format din aproximativ 20 de mii de gene, numărul de proteine ​​din corpul uman datorită prezenței diferitelor proteoforme proteice depășește 2 milioane [3] . În plus, spre deosebire de genomul, proteomul este în continuă schimbare în funcție de influența factorilor intracelulari și externi și, de fapt, este un set de proteine ​​fixate în timp într-un anumit obiect biologic și într-o anumită situație.

Metode

Printre metodele de studiu a proteomului acceptate de comunitatea internațională, una dintre cele mai dezvoltate cu succes a devenit o abordare centrată pe cromozomi sau pe gene, în care rezultatele analizei proteinelor sunt mapate la genele lor corespunzătoare care codifică proteine . Formalizarea sarcinii științifice datorită abordării centrate pe genă face implementarea acesteia mult mai realistă în comparație cu abordările alternative (tiparea totală a proteinelor), permițându-vă să vă concentrați pe proteinele codificate de genele unui anumit cromozom și, astfel, să împărțiți proiectul în separat. subproiecte – în funcție de numărul de perechi de cromozomi din genomul uman [4] .

Vezi și

Note

  1. Dedov, I. I., Tyulpakov, A. N., Cekhonin, V. P., Baklaushev, V. P., Archakov, A. I. și Moshkovsky, S. A. Medicina personalizată: starea actuală și perspective // ​​Buletinul Academiei Ruse de Științe Medicale. - 2012. - T. 67 , Nr. 12 . - S. 4-12 . — ISSN 0869-6047 . - doi : 10.15690/vramn.v67i12.474 .
  2. Legrain P., Aebersold R., Archakov A., Bairoch A., Bala K., Beretta L., Bergeron J., Borchers CH, Corthals GL, Costello CE et al. Proiectul proteomului uman: starea actuală și direcția viitoare // Proteomică moleculară și celulară. - 2011. - T. 10 , Nr. 7 . - S. M111. 009993 . - doi : 10.1074/mcp.M111.009993 .
  3. Archakov A., Zgoda V., Kopylov A., Naryzhny S., Chernobrovkin A., Ponomarenko E., Lisitsa A. Abordare centrată pe cromozomi pentru depășirea blocajelor în proiectul Human Proteome // Expert review of proteomics. - 2012. - T. 9 , Nr. 6 . - S. 667-676 . - doi : 10.1021/pr300821n .
  4. Ponomarenko, E. A., Zgoda, V. G., Kopylov, A. T., Attorney, E. V., Ilgisonis, E. V., Lisitsa, A. V., & Archakov, A. I. Rusia în proiectul internațional „proteomul uman”: primele rezultate și perspective // ​​Chimie biomedicală. - 2015. - T. 61 , nr 2 . - S. 169-175 . - doi : 10.18097/PBMC20156102169 .

Literatură