Ro terminare independentă

Terminația internă , de asemenea terminația ρ-independentă , terminarea Rho - independentă , este un  mecanism de oprire a transcripției genelor la procariote [1] . Esența acestui mecanism este următoarea: ARNm conține o secvență îmbogățită cu guanină-citozină, care poate forma structuri de tip ac de păr cu lungimea de 7-20 de perechi de baze. Guanina și citozina formează trei legături de hidrogen între ele și, prin urmare, sunt destul de puternic legate [2] . Imediat după ac de păr, există o zonă îmbogățită cu uracil . Legăturile dintre uracil și adenină sunt foarte slabe. Proteina asociată cu ARN polimerazei ( nusA ) se leagă atât de strâns de ac de păr încât determină oprirea temporară a polimerazei și încetarea transcripției [3] . În acest moment, polimeraza este situată în regiunea poliuracil a secvenței. Legăturile slabe adenină-uracil reduc energia de destabilizare a duplexului ARN-ADN, ceea ce le permite să slăbească tensiunea lanțului polinucleotidic și să se disocieze de ARN polimeraza [2] .

Elementele Rho care nu conțin o secvență de poliuracil sunt capabile să oprească ARN polimerazei, dar de obicei continuă transcripția după un timp, deoarece duplexul este prea stabil pentru a provoca disocierea ARN polimerazei și terminarea ulterioară.

Terminarea transcripțională independentă de Rho este un mecanism comun care stă la baza activității elementelor ARN -reglatoare cis , cum ar fi riboswitch -urile .

Note

1. ↑ Farnham, PJ; Platt, T. Terminare Rho-independentă: simetria diadei în ADN face ca ARN polimeraza să se întrerupă în timpul transcripției in vitro  //  Nucleic Acids Research : jurnal. - 1981. - 11 februarie ( vol. 9 , nr. 3 ). - P. 563-577 . doi : 10.1093 / nar/9.3.563 . — PMID 7012794 .
2. ↑ 1 2 Lewin, Benjamin. Genele IX  (neopr.) . — Sudbury, MA: Jones and Bartlett Publishers, 2007. - ISBN 0-7637-4063-2 .
3. ↑ Wilson KS, von Hippel PH Terminarea transcripției la terminatorii intrinseci: rolul acului de păr ARN  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1995. - Septembrie ( vol. 92 , nr. 19 ). - P. 8793-8797 . - doi : 10.1073/pnas.92.19.8793 . — PMID 7568019 .