E-box

Versiunea actuală a paginii nu a fost încă examinată de colaboratori experimentați și poate diferi semnificativ de versiunea revizuită la 21 ianuarie 2022; verificarea necesită 1 editare .

E-box (Enhancer Box) este o secvență de ADN găsită în anumite regiuni promotoare la eucariote care acționează ca un loc de legare a proteinelor și s-a descoperit că reglează expresia genelor în neuroni , mușchi și alte țesuturi. [1] Specificația pentru o astfel de secvență de ADN este CANTG (unde N poate fi orice nucleotidă ), cu o secvență canonică palindromică . CACGTG [2] este recunoscut și legat de factorii de transcripție pentru a iniția transcripția genelor . Odată ce factorii de transcripție se leagă de promotori prin intermediul E-box, alte enzime se pot lega de promotor și facilitează transcripția ARNm din ADN .

Descoperire

E-box a fost descoperit într-o colaborare între Susumu Tonegawa și  Walter Gilbert Laboratories în 1985 ca element de control pentru amplificatorii de imunoglobuline din lanțul greu .  [3] [4] Ei au descoperit că o regiune de 140 de perechi de baze în elementul de amplificare a transcripției specific țesuturilor a fost suficientă pentru a crește diferite niveluri de transcripție în diferite țesuturi și secvențe. Ei au emis ipoteza că proteinele produse de anumite țesuturi sunt implicate în acești amplificatori pentru a activa seturi de gene atunci când celulele se diferențiază.

În 1989, laboratorul lui David Baltimore a descoperit primele două proteine ​​asociate cutiei E, E12 și E47. [5] Acești amplificatori de imunoglobuline pot fi legați ca heterodimeri proteici prin domenii bHLH. În 1990, folosind o altă proteină E, ITF-2A (redenumită mai târziu E2-2Alt), s-a constatat că este posibil să se lege o imunoglobuline de amplificatori ai lanțului ușor . [6] Doi ani mai târziu, o a treia proteină de legare a casetei E, HEB, a fost descoperită la examinarea unei biblioteci de ADNc din celulele HeLa . [7] Varianta de splicing E2-2 a fost descoperită în 1997 și a fost găsită inhibarea promotorului de către gene specializate în mușchi . [opt]

De atunci, cercetătorii au stabilit că E-box afectează transcripția genelor la unele eucariote și au descoperit factori de legare a E-box care identifică secvențele consensuale E-Box [9] În special, mai multe experimente au arătat că E-box este o parte integrantă a buclei de feedback transcripțional-translațional care conține ceasul circadian .

Conectarea cu o casetă electronică

Proteinele de legare a casetei E joacă un rol important în reglarea activității transcripționale. Aceste proteine ​​conțin, de obicei, un motiv structural de proteină de bază helix - buclă - helix care le permite să se lege ca dimeri .  [10] Acest motiv constă din două elice α amfipatice separate de o mică secvență de aminoacizi care formează una sau mai multe ture β. În interacțiunile hidrofobe dintre aceste elice α, dimerizarea este stabilizată. În plus, fiecare monomer bHLH are o regiune centrală care ajută la recunoașterea reciprocă între monomerul bHLH și cutia E (regiunea centrală interacționează cu canelura mare a ADN-ului ). În funcție de motivul ADN ("CAGCTG" sau "CACGTG"), proteina bHLH are un set diferit de reziduuri bazice.

Legarea E-box este modulată la şoareci de Zn2 + . Regiunile CT-Rich (CTRR), situate la aproximativ 23 de nucleotide în amonte de E-box, sunt esențiale pentru legarea E-box, transactivare (creșterea ratei de exprimare genetică) și transcripția genelor circadiene BMAL1 / NPAS2 și BMAL1/ CLOCK complexe. [unsprezece]

Specificitatea de legare a diferitelor cutii E se reflectă în funcția lor. Cutiile electronice cu diferite funcții au cantități și tipuri diferite de factori de legare. [12]

Secvența de consens a E-box este de obicei CANTG; Cu toate acestea, există și alte cutii E cu secvențe similare, numite cutii E non-canonice. Acestea includ, dar nu se limitează la:

Rolul în ceasul circadian

Legătura dintre reglarea genei E-box și ceasul circadian a fost descoperită în 1997, când Hao, Allen și Hardin (Departamentul de Biologie de la Universitatea Texas A&M) au analizat ritmicitatea perioadei de oscilație a genei la Drosophila melanogaster . [16] Ei au găsit o genă amplificatoare a transcripției circadiane într-un fragment de ADN de 69 bp . În funcție de nivelurile de proteine, amplificatorul crește nivelurile de transcripție ARNm atât în ​​condiții LD (luminos-întuneric) cât și DD (întuneric constant). Amplificatorul a fost necesar pentru a crește nivelul de expresie a genelor, dar nu pentru ritmul circadian. De asemenea, funcționează independent ca țintă a complexului BMAL1 / CLOCK .

E-box joacă un rol important în genele circadiene ; Până în prezent, au fost identificate nouă gene circadiene gated: PER1 , Per2 , BHLHB2 , BHLHB3 , CRY1 , DBP , Nr1d1 , Nr1d2 și RORC . [17] Deoarece E-box este conectat la mai multe gene circadiene, este posibil ca genele și proteinele asociate cu aceasta să fie „puncte importante și vulnerabile în sistemul circadian”. [optsprezece]

E-box este una dintre cele mai mari cinci familii de factori de transcripție în faza circadiană și se găsește în majoritatea țesuturilor. [19] Un total de 320 de cutii E care guvernează gene se găsesc în SCN ( nucleu suprachiasmatic ), ficat , aortă , glandele suprarenale , WAT ( țesut adipos alb ), creier , atriu , ventricul , cortexul prefrontal , mușchiul scheletic , BAT ( tesuturile adipoase brune ) si oasele boltii craniene.

E-box, precum elementele dependente de CLOCK (EL-box; GGCACGAGGC), este de asemenea importantă în menținerea ritmului circadian în genele de control al ceasului . Similar cu o cutie E obișnuită, o cutie E precum controalele de ceas poate induce, de asemenea , transcripția BMAL1 / CLOCK, care poate duce apoi la exprimarea în alte cutii EL care conțin gene (Ank, DBP, Nr1d1). [20] Cu toate acestea, există diferențe între EL-box și E-box obișnuit. Suprimarea Dec1 și DEC2 are un efect mai puternic asupra E-box decât asupra EL-box. În plus, Hes1, care se poate lega la o altă secvență consens (CACNAG, cunoscută sub numele de N-box), prezintă un efect de suprimare în EL-box, dar nu și în E-box.

Atât secvența E-box non-canonică, cât și secvența asemănătoare E-box sunt critice pentru oscilația circadiană. Cercetări recente în acest domeniu emetează ipoteza că fiecare E-box canonică sau non-canonică care urmează o secvență E-box similară, cu un interval de 6 bp între ele, este o combinație necesară pentru transcrierea circadiană. [21] Silicoanaliza arată, de asemenea, că intervalul a existat în alte gene cunoscute care controlează ceasul.

Rolul proteinelor în legarea E-box

Există mai multe proteine ​​care se leagă de cutia E și afectează transcripția genelor .

complex CLOCK-BMAL1

Acest complex este o parte integrantă a ciclului circadian al mamiferelor și este vital în menținerea ritmului circadian.

Știind că legarea activează transcripția genelor în regiunea promotoare , cercetătorii au descoperit în 2002 că DEC1 și DEC2 (factori de transcripție bHLH) reprimă complexul CLOCK-BMAL1 prin interacțiune directă pe BMAL1 și/sau competiție pentru elementele E-box. Ei au ajuns la concluzia că DEC1 și DEC2 erau regulatori ai ceasului molecular al mamiferelor. [22]

În 2006, Ripperger și Schibler au descoperit că legarea E-box a acestui complex accelerează transcripția circadiană a DBP și tranzițiile cromatinei (modificarea de la cromatină la heterocromatina facultativă ). [23] S-a ajuns la concluzia că CLOCK reglează expresia DBP prin legarea de motivele E-box ale regiunilor de amplificare situate în primul și al doilea introni .

C-Myc (oncogene)

C-Myc, gena care codifică factorul de transcripție Myc , joacă un rol important în reglarea proliferării și apoptozei celulelor de mamifere .

În 1991, cercetătorii au testat dacă c-Myc s-ar putea lega de ADN prin dimerizarea acestuia cu E12. Dimerii proteinei himerice E6 sunt capabili să se lege de elementul E-box (GGCCACGTGACC), care a fost recunoscut de alte proteine ​​HLH. [24] Exprimarea lui E6 a suprimat funcția c-Myc care a determinat relația dintre cele două.

În 1996, s-a descoperit că Myc heterodimerizează cu MAX și că acest complex heterodimeric se poate lega la secvența E-box CAC(G/A)TG și poate activa transcripția. [25]

În 1998, s-a ajuns la concluzia că funcția c- Myc depinde de activarea transcripției anumitor gene prin intermediul elementelor E-box. [26]

MyoD

MyoD provine din familia Mrf bHLH și rolul său principal este în miogeneză, formarea țesutului muscular. [9] Alți membri ai acestei familii includ miogenină, Myf5 , Myf6 , Mist1 și NEX-1.

Când MyoD se leagă de motivul E-box CANTG, este inițiată diferențierea musculară și exprimarea proteinelor specifice mușchilor. [27] Cercetătorii au îndepărtat diferite părți ale MyoD recombinant și au concluzionat că MyoD utilizează elementele incluse pentru a lega cutia E și structura tetraplex a secvenței promotorului genei integrinei α7 specifice mușchilor și sMtCK sarcomeric .

MyoD reglează HB-EGF ( heparin-binding EGF-like growth factor ), un membru al familiei EGF ( Epidermal Growth Factor ) și stimulează creșterea și proliferarea celulelor. [9] Joacă un rol important în dezvoltarea carcinomului hepatocelular , a cancerului de prostată , a cancerului de sân , a cancerului esofagian și a cancerului gastric .

MyoD se poate lega, de asemenea, la cutiile MyoG E non-canonice și să-și regleze expresia. [28]

MyoG

MyoG aparține familiei MyoD de factori de transcripție. Cutia E de legare MyoG este esențială pentru formarea joncțiunii neuromusculare ca cale de semnalizare HDAC-Dach2-miogenină în expresia genei musculare scheletice . [29] Expresia redusă a MyoG a fost găsită la pacienții cu atrofie musculară simptomatică. [treizeci]

S-a demonstrat, de asemenea, că MyoG și MyoD au diferențiere de mioblast . [31] Acţionează prin transactivarea activităţii promotorului catepsinei B şi inducerea expresiei acesteia în ARNm .

E47

E47 este produs prin îmbinare alternativă a E2A în exoni bHLH codificați în mod specific pentru E47 . Rolul său este de a regla expresia și diferențierea genelor specifice țesutului. Multe kinaze au fost legate de E47, inclusiv 3PK și MK2. Aceste două proteine ​​formează un complex cu E47 și îi reduc activitatea transcripțională. [32] CKII și PKA au fost, de asemenea, demonstrate in vitro că fosforilează E47. [33] [34] [35]

Ca și în cazul altor cutii E care se leagă de proteine, E47 se leagă de asemenea la secvența CANTG din cutia E. La șoarecii homozigoți knockout E2A , dezvoltarea celulelor B este oprită înainte de etapa de plasare DJ și celulele B nu se pot maturiza. [36] S-a demonstrat că E47 se leagă ca heterodimer (cu E12) [37] sau ca homodimer (dar mai slab). [38]

Cercetări recente

Deși baza structurală pentru interacțiunea BMAL1/CLOCK cu E-box este necunoscută, studii recente au arătat că motivele bHLH ale domeniilor proteinei BMAL1/CLOCK sunt foarte asemănătoare cu bHLH-urile altor proteine ​​cristalizate E-box, cum ar fi Myc /Max. [39] Acest lucru sugerează că sunt necesare baze specifice pentru a susține această afinitate mare de legare. În plus, restricțiile de secvență din regiunea din jurul cutiei E circadiane nu sunt pe deplin înțelese: se crede că acest lucru este necesar, dar nu suficient; Cutiile E trebuie să fie distanțate aleatoriu în secvența genetică pentru ca transcripția circadiană să aibă loc . Studiile recente asupra cutiilor E s-au concentrat pe găsirea mai multor proteine ​​care se pot lega, precum și pe descoperirea mai multor mecanisme pentru inhibarea legării.

Un studiu recent al Universității din Uppsala din Suedia leagă complexul AST2-Rack1 de inhibarea legării complexului BMAL1-CLOCK de E-box. [40] Cercetătorii au examinat rolul Astakinei-2 în reglarea circadiană indusă de melatonină la crustacee și au descoperit că AST2 este necesar pentru a inhiba legarea complexului BMAL1-CLOCK de E-box. În plus, ei au descoperit că secreția de melatonină este responsabilă pentru reglarea expresiei AST2 și au emis ipoteza că inhibarea legării E-box afectează CLOCK la orice animal cu molecule AST2.

Cercetătorii de la Școala de Medicină a Universității Nanjing au descoperit că amplitudinea FBXL3 (repetări F-box/proteine ​​bogate în leucină) este exprimată prin E-box. [41] Ei au studiat șoarecii cu deficit de FBXL3 și au descoperit că acesta reglează o buclă de feedback în ritmurile circadiene , influențând perioada circadiană.

Un studiu publicat pe 4 aprilie 2013 de cercetătorii de la Harvard Medical School a descoperit că nucleotidele de pe ambele părți ale cutiei E afectează factorii de transcripție care se pot lega de cutia E în sine. [42] Aceste nucleotide definesc aranjamentul spațial 3-D al catenei în ADN și limitează dimensiunea de legare a factorilor de transcripție. Studiul a arătat, de asemenea, diferențe în legarea matricei între in vivo și in vitro ( in vivo și in vitro ).

Note

  1. ↑ Massari, M.E.; Murre, C. Proteine ​​Helix-loop-helix: regulatori ai transcripției în organismele eucariote   // Biologie moleculară și celulară : jurnal. - 2000. - Vol. 20 , nr. 2 . - P. 429-440 . - doi : 10.1128/mcb.20.2.429-440.2000 . — PMID 10611221 .
  2. ↑ Chaudhary, J; Skinner, M K. Proteinele de bază helix-loop-helix pot acționa la cutia E din elementul de răspuns seric al promotorului c-fos pentru a influența activarea promotorului indusă de hormoni în celulele Sertoli  //  Mol Endocrinol : jurnal. - 1999. - Mai ( vol. 13 , nr. 5 ). - P. 774-786 . - doi : 10.1210/mend.13.5.0271 . — PMID 10319327 .
  3. ↑ Ephrussi, A; Biserica, G.M.; Tonegawa, S; Gilbert, W. B interacțiuni specifice liniei unui amplificator de imunoglobuline cu factori celulari in vivo  //  Science: journal. - 1985. - Vol. 227 , nr. 4683 . - P. 134-140 . - doi : 10.1126/science.3917574 . — PMID 3917574 .
  4. ↑ Biserica, GM; Ephrussi, A; Gilbert, W; Tonegawa, S. Contacte specifice tipului de celule la amplificatori de imunoglobuline în nuclee  (engleză)  // Nature : journal. - 1985. - Vol. 313 , nr. 6005 . - P. 798-801 . - doi : 10.1038/313798a0 . — Cod . — PMID 3919308 .
  5. ↑ Murre, C; McCaw, PS; Vaessin, H; Caudy, M; Jan, L.Y.; Cabrera, C.V.; Buskin, JN; Hauschka, SD; Lassar, A.B.; si altii; Weintraub, Harold; Baltimore, David și colab. Interacțiunile dintre proteinele heterologe helix-buclă-helix generează complexe care se leagă în mod specific la o secvență comună de ADN  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1989. - August ( vol. 58 , nr. 3 ). - P. 537-544 . - doi : 10.1016/0092-8674(89)90434-0 . — PMID 2503252 .
  6. ↑ Henthorn, P; Kiledjian, M; Kadesch, T. Doi factori de transcripție distincți care leagă motivul amplificator de imunoglobulină microE5/kappa 2  //  Science : journal. - 1990. - Vol. 247 , nr. 4941 . - P. 467-470 . - doi : 10.1126/science.2105528 . - . — PMID 2105528 .
  7. ↑ Hu SJ, Olson EN; Kingston, RE. HEB  //  Mol Cell Biol : jurnal. - 1992. - Vol. 12 , nr. 3 . - P. 1031-1042 . — PMID 1312219 .
  8. ↑ Chen, B; Lim, R W. Interacțiuni fizice și funcționale între inhibitorii transcripționali Id3 și ITF-2b. Dovezi către un mecanism nou de reglare a expresiei genelor specifice mușchilor  // J Biol Chem  : jurnal  . - 1997. - ianuarie ( vol. 272 ​​, nr. 4 ). - P. 2459-2463 . doi : 10.1074 / jbc.272.4.2459 . — PMID 8999959 .
  9. ↑ 1 2 3 Mädge B.: E-Box. În: Schwab M. (Ed.) Encyclopedia of Cancer: SpringerReference (www.springerreference.com). Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2009. doi : 10.1007/SpringerReference_173452
  10. ↑ Ellenberger, T; Fass, D; Arnaud, M; Harrison, S C. Structura cristalină a factorului de transcripție E47: recunoașterea cutiei E de către un dimer helix-loop-helix regiune de bază  // Genes Dev  : journal  . - 1994. - Aprilie ( vol. 8 , nr. 8 ). - P. 970-980 . doi : 10.1101 / gad.8.8.970 . — PMID 7926781 .
  11. ↑ Muñoz; Michelle Brewer; Ruben Baler. Modularea activității complexului BMAL/CLOCK/E-Box de către un element cu acțiune cis bogat în CT   // Endocrinologie moleculară și celulară : jurnal. - 2006. - Vol. 252 , nr. 1-2 . - P. 74-81 . - doi : 10.1016/j.mce.2006.03.007 . — PMID 16650525 .
  12. ↑ Bose; Boockfor FR Episoadele de expresie a genei prolactinei în celulele GH3 sunt dependente de legarea selectivă a promotorului a mai multor elemente circadiene  //  Endocrinology: journal. - 2010. - Vol. 151 , nr. 5 . - P. 2287-2296 . - doi : 10.1210/en.2009-1252 . — PMID 20215567 .
  13. ↑ Yoo, S.H.; Ko, CH; Lowrey, P.L.; Buhr, E.D.; Song, EJ; Chang, S.; Yoo, OJ; Yamazaki, S.; Lee, C.; şi alţii şi colab. Un amplificator noncanonic E-box conduce la șoarecele Perioada 2 oscilații circadiene in vivo  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2005. - Vol. 102 , nr. 7 . - P. 2608-2613 . - doi : 10.1073/pnas.0409763102 . — PMID 15699353 .
  14. ↑ Zhang, X.; Patel, S. P.; McCarthy, JJ; Rabcevsky, A.G.; Goldhamer, DJ; Esser, KA O cutie E non-canonică în cadrul amplificatorului de miez MyoD este necesară pentru exprimarea circadiană în mușchiul scheletic  // Nucleic Acids Res  . : jurnal. - 2012. - Vol. 40 , nr. 8 . - P. 3419-3430 . doi : 10.1093 / nar/gkr1297 . — PMID 22210883 .
  15. ↑ Enrique, Salero; Cecilio, Gimenez; Francisco, Zafra. {{{titlu}}}  (ing.)  // Biochem J. : jurnal. - 2003. - Martie ( vol. 370 , nr. 3 ). - P. 979-986 .
  16. ↑ Hao, H; Allen, D.L.; Hardin, P E. Un amplificator circadian mediază ciclul ARNm dependent de PER în Drosophila melanogaster  //  Mol Cell Biol : jurnal. - 1997. - iulie ( vol. 17 , nr. 7 ). - P. 3687-3693 . — PMID 9199302 .
  17. ↑ Panda, S; AntochMP; Miller BH; SuAI; Schook AB; Straume M; Schultz P.G.; Kay SA; TakahashiJS; Hogenesch JB Transcriere coordonată a căilor cheie la șoarece de către ceasul circadian  (engleză)  // Cell  : journal. - Cell Press , 2002. - Mai ( vol. 109 , nr. 3 ). - P. 307-320 . - doi : 10.1016/S0092-8674(02)00722-5 . — PMID 12015981 .
  18. ↑ Herzog, Erik. Neuroni și rețele în ritmuri zilnice  (engleză)  // Nature Reviews Neuroscience  : jurnal. - 2007. - octombrie ( vol. 8 , nr. 10 ). - P. 790-802 . - doi : 10.1038/nrn2215 . — PMID 17882255 .
  19. ↑ Yan, iunie; Haifang Wang; Yuting Liu; Chunxuan Shao. Analiza rețelelor de reglementare a genelor în ritmul circadian al mamiferelor  // PLOS Computational Biology  : journal  . - 2008. - octombrie ( vol. 4 , nr. 10 ). — P.e1000193 . - doi : 10.1371/journal.pcbi.1000193 . - Cod biblic . — PMID 18846204 .
  20. ↑ Ueshima, T; Kawamoto T; Honda KK; Noshiro M; Fujimoto K; Nakao S; Ichinose N; Hashimoto S; Gotoh O; Kato Y. Identificarea unui nou element legat de ceas EL-box implicat în reglarea circadiană de către BMAL1  / CLOCK și HES1  // Gene : jurnal. - Elsevier , 2012. - Decembrie ( vol. 510 , nr. 2 ). - P. 118-125 . - doi : 10.1016/j.gene.2012.08.022 . — PMID 22960268 .
  21. ↑ Nakahata, Y; Yoshida M; Takano A; Soma H; Yamamoto T; Yasuda A; Nakatsu T; Takumi T. O repetare directă a elementelor de tip E-box este necesară pentru ritmul circadian al genelor de ceas autonom de celule  (engleză)  // BMC Mol Biol : jurnal. - 2008. - ianuarie ( vol. 9 , nr. 1 ). — P. 1 . - doi : 10.1186/1471-2199-9-1 . — PMID 18177499 .
  22. ↑ Honma, S; Kawamoto, T; Takagi, Y; Fujimoto, K; Sato, F; Noshiro, M; Kato, Y; Honma, K. Dec1 și Dec2 sunt regulatori ai ceasului molecular al mamiferelor  //  Nature : journal. - 2002. - Vol. 419 , nr. 6909 . - P. 841-844 . - doi : 10.1038/nature01123 . — Cod . — PMID 12397359 .
  23. ↑ Ripperger, J A.; Schibler, U. Legarea Rhythmic CLOCK-BMAL1 la mai multe motive E-box conduce transcripția circadiană Dbp și tranzițiile cromatinei  (engleză)  // Nat. Genet  : jurnal. - 2006. - Martie ( vol. 38 , nr. 3 ). - P. 369-374 . - doi : 10.1038/ng1738 . — PMID 16474407 .
  24. ↑ Prendergast, GC; Ziff, E B. Legarea ADN-ului specifică secvenței sensibile la metilare de către regiunea de bază c-Myc  //  Science : journal. - 1991. - ianuarie ( vol. 251 , nr. 4990 ). - P. 186-189 . - doi : 10.1126/science.1987636 . - Cod biblic . — PMID 1987636 .
  25. ↑ Desbarats, L; Gaubatz, S; Eilers, M. Discriminarea între diferite proteine ​​de legare a casetei E la o genă țintă endogenă a c-myc  // Genes Dev  : journal  . - 1996. - Februarie ( vol. 10 , nr. 4 ). - P. 447-460 . doi : 10.1101 / gad.10.4.447 . — PMID 8600028 .
  26. ↑ Xiao, Q; Claassen, G; Shi, J; Adachi, S; Seivy, J; Hann, S R. Transactivation-defective c-MycS păstrează capacitatea de a regla proliferarea și apoptoza  // Genes Dev  : journal  . - 1998. - Decembrie ( vol. 12 , nr. 24 ). - P. 3803-3808 . doi : 10.1101 / gad.12.24.3803 . — PMID 9869633 .
  27. ↑ Shklover, J; Etzioni, S; Weisman-Shomer, P; Yafe, A; Bengal, E; Fry, M. MyoD utilizează elemente suprapuse, dar distincte pentru a lega structurile E-box și tetraplex ale secvențelor reglatoare ale genelor specifice mușchilor  //  Nucleic Acids Res : jurnal. - 2007. - Vol. 35 , nr. 21 . - P. 7087-7095 . - doi : 10.1093/nar/gkm746 . — PMID 17942416 .
  28. ↑ Bergström, D.A.; Penn, BH; Strand, A.; Perry, R.L.; Rudnicki, M.A.; Tapscott, SJ Reglarea specifică promotorului a legării MyoD și transducția semnalului cooperează la expresia genei model   // Mol . celulă : jurnal. - 2002. - Vol. 9 , nr. 3 . - P. 587-600 . - doi : 10.1016/s1097-2765(02)00481-1 . — PMID 11931766 .
  29. ↑ Tang, H; Goldman, D. Reglarea genelor dependente de activitate în mușchiul scheletic este mediată de o cascadă de transducție a semnalului histone deacetilază (HDAC)-Dach2-miogenină  (engleză)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 2006. - Vol. 103 , nr. 45 . - P. 16977-16982 . - doi : 10.1073/pnas.0601565103 . - . — PMID 17075071 .
  30. ↑ Ramamoorthy, S; Donohue, M; Buck, M. Scăderea expresiei Jun-D și a miogeninei în pierderea musculară a cașexiei umane   // American Physiological Society : jurnal. - 2009. - Vol. 297 , nr. 2 . - P.E392-401 . - doi : 10.1152/ajpendo.90529.2008 . — PMID 19470832 .
  31. ↑ Jane, D.T.; Morvay, L.C.; Koblinski, J.; Yan, S.; Saad, F.A.; Sloane, BF; şi alţii şi colab. Dovezi că elementele promotoare E-box și factorii de transcripție MyoD joacă un rol în inducerea expresiei genei catepsinei B în timpul diferențierii mioblastelor umane   // Biol . Chim. : jurnal. - 2002. - Vol. 383 , nr. 12 . - P. 1833-1844 . - doi : 10.1515/BC.2002.207 . — PMID 12553720 .
  32. ↑ Neufeld; b.; ; Hoffmeyer, A.; Iordania, BWM; Chen, P.; Dinev, D.; Ludwig, S.; Rapp, UR şi colab. Serin/Treonin Kinaze 3pK și Protein Kinaza 2 activată de MAPK Interacționează cu factorul de transcripție Helix-Loop-Helix E47 și reprimă activitatea sa transcripțională  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 27 . - P. 20239-20242 . - doi : 10.1074/jbc.C901040199 . — PMID 10781029 .
  33. ↑ Johnson; Wang X.; Hardy S.; Taparowski, EJ; Konieczny, SF Casein kinaza II crește activitățile transcripționale ale MRF4 și MyoD independent de fosforilarea lor directă   // Mol . celulă. Biol. : jurnal. - 1996. - Vol. 16 , nr. 4 . - P. 1604-1613 . — PMID 8657135 .
  34. ↑ Singur; Shen CP; McCarrick-Walmsley R.; Kadesch T. Fosforilarea E47 ca potențial determinant al activității specifice celulelor B   // Mol . celulă. Biol. : jurnal. - 1996. - Vol. 16 , nr. 12 . - P. 6900-6908 . — PMID 8943345 .
  35. ↑ Shen; Kadesch T. Legarea ADN-ului specific celulei B de către un homodimer E47  (engleză)  // Mol. celulă. Biol. : jurnal. - 1995. - Vol. 15 , nr. 8 . - P. 4518-4524 . — PMID 7623842 .
  36. ↑ Bain; ; Izon, DJ; Amsen, D; Kruisbeek, A.M.; Weintraub, B.C.; Krop, eu; Schlissel, MS; Feeney, AJ; Van Roon, M. şi colab. Proteinele E2A sunt necesare pentru dezvoltarea corectă a celulelor B și inițierea rearanjamentelor genelor imunoglobulinei  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1994. - Vol. 79 , nr. 5 . - P. 885-892 . - doi : 10.1016/0092-8674(94)90077-9 . — PMID 8001125 .
  37. ↑ Lasar; Davis R.L.; Wright W.E.; Kadesch T.; Murre C.; Voronova A.; Baltimore D.; Weintraub H. Activitatea funcțională a proteinelor HLH miogenice necesită hetero-oligomerizare cu proteine ​​asemănătoare E12/E47 in vivo  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1991. - Vol. 66 , nr. 2 . - P. 305-315. . - doi : 10.1016/0092-8674(91)90620-e . — PMID 1649701 .
  38. ↑ Murre; McCaw PS, Vaessin H., Caudy M., Jan LY, Jan YN, Cabrera CV, Buskin JN, Hauschka SD, Lassar AB, ; Vaessin, H; Caudy, M; Jan, L.Y.; Jan, YN; Cabrera, C.V.; Buskin, JN; Hauschka, SD; Lassar, AB și colab. Interacțiunile dintre proteinele heterologe helix-buclă-helix generează complexe care se leagă în mod specific la o secvență comună de ADN  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1989. - Vol. 58 , nr. 3 . - P. 537-544 . - doi : 10.1016/0092-8674(89)90434-0 . — PMID 2503252 .
  39. ↑ Muñoz, E; Berărie, M; Baler, R. Circadian Transcription: THINKING OUTSIDE THE E-BOX  // J Biol Chem  : journal  . - 2002. - Septembrie ( vol. 277 , nr. 39 ). - P. 36009-36017 . - doi : 10.1074/jbc.m203909200 . — PMID 12130638 .
  40. ↑ Wattanasurorot, A; Saelee, N; Phongdara, A; Roytrakul, S; Jiranavichpaisal, P; Söderhäll, K; Söderhäll, I. Astakine 2 — Cavalerul Întunecat care leagă melatonina de reglementarea circadiană la crustacee  //  PLOS Genetics : jurnal. - 2013. - martie ( vol. 3 , nr. 3 ). — P.e1003361 . - doi : 10.1371/journal.pgen.1003361 .
  41. ↑ Shi, G; Xing, L; Liu, Z; Qu, Z; Wu, X; Dong, Z; Wang, X; Gao, X; Huang, M; si altii; Yang, L.; Liu, Y.; Ptacek, LJ; Xu, Y. şi colab. Rolurile duble ale FBXL3 în buclele de feedback circadiene ale mamiferelor sunt importante pentru determinarea perioadei și robustețea ceasului  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2013. - Vol. 110 , nr. 12 . - P. 4750-4755 . - doi : 10.1073/pnas.1302560110 . - Cod . — PMID 23471982 .
  42. ↑ Gordân, R; Shen, N; Dror, eu; Zhou, T; Horton, J; Rohs, R; Bulyk, M.L. Regiunile genomice care flanchează site-urile de legare E-Box influențează specificitatea de legare a ADN-ului factorilor de transcripție bHLH prin forma ADN-ului   // Reprezentare celulară : jurnal. - 2013. - Aprilie ( vol. 3 , nr. 4 ). - P. 1093-1104 . - doi : 10.1016/j.celrep.2013.03.014 . — PMID 23562153 .
 Transcriere (biologie)
Reglementarea
transcripției
procariote
eucariote
Enzime de
modificare a
histonelor
( histone / nucleozom )
Metilarea ADN-uluiADN metiltransferaza
Remodelarea
cromatinei		CHD7
Comun pentru
pro- și eucariote
Activare
IniţiereSite de începere a transcripției
Elongaţie
Încetarea