Faustovirus

Faustovirus

Reconstrucția virionului Faustovirus folosind microscopia crioelectronică
clasificare stiintifica
Grup:Viruși [2]Tărâm:incertae sedis [1]Vedere:Faustovirus
Denumire științifică internațională
Faustovirus
Grupul Baltimore
I: virusuri dsDNA

Faustovirus  (în latină) este un virus gigant care este apropiat din punct de vedere morfologic și genetic de alți doi viruși giganți , Pacmanvirus și Kaumoebavirus , precum și viruși din familia Asfarviridae . Faustovirusul a fost izolat în 2015 de la protistul Vermamoeba vermiformis [3] .

Din noiembrie 2018, genul Faustovirus nu este înregistrat în baza de date a Comitetului Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV) [4] .

Descriere

Faustovirusul are virioni icosaedrici de aproximativ 200 nm în dimensiune [3] . În 2016, virionii de Faustovirus au fost studiați în detaliu folosind microscopia crioelectronică . Proteina majoră a capsidei ( MCP ) a învelișului extern al acestui virus formează trimeri , fiecare monomer al cărora este format din două motive structurale jelly roll situate unul după altul . Un motiv de rulou de jeleu include 8 foi beta . O organizare similară a proteinei majore a capsidei se găsește în mulți viruși. Capsomerul este reprezentat de hexamerul MCP și are un diametru de aproximativ 75 Å . Spre deosebire de majoritatea altor virusuri gigantice, Faustovirusul are, de asemenea, un al doilea strat interior de capside, format tot din hexameri proteici [5] .  

Genomul

Genomul Faustovirus este reprezentat de o moleculă circulară de ADN dublu catenar de 466265 perechi de baze (bp). Compoziția GC a genomului este de 36%. Există 451 de gene care codifică proteine ​​în genom , lungimile produselor lor sunt cuprinse în intervalul de la 47 la 2980 de resturi de aminoacizi (a.a.). Nu au fost identificate gene care codifică ARNt în genomul Faustovirusului . Doar 31% dintre proteinele Faustovirus au găsit omologi în bazele de date . Majoritatea proteinelor Faustovirus sunt omoloage proteinelor Asfarviridae ; există și proteine ​​înrudite cu proteinele virusurilor din familiile Phycodnaviridae , Mimiviridae , Marseilleviridae și Ascoviridae . Unele proteine ​​sunt legate de proteinele bacteriofage , în plus, o serie de proteine ​​au rude numai între organismele celulare : eucariote , bacterii și arhee . În genele care codifică proteinele capsidelor, au fost identificați mulți introni [5] , inclusiv 6 introni de grup I auto-splicing — un caz foarte atipic pentru virusuri [3] .

Ciclul de viață

Infecția celulelor Vermamoeba vermiformis începe cu fagocitoza particulelor virale de către protist. La 2-4 ore după infectare , virionii sunt detectați în interiorul fagozomilor , dintre care unii pot fi chiar localizați în apropierea nucleului celulei , deși nu a fost găsită nicio interacțiune a particulelor virale cu nucleul. Apoi, fagozomii își eliberează conținutul în citoplasma celulei gazdă: membrana interioară a virusului fuzionează cu membrana fagozomului și conținutul virionului iese, similar cu ceea ce se întâmplă în mimivirus . După aceea, unii dintre virioni încetează să fie vizibili. Eliberarea proteinelor Faustovirusului și a ADN -ului în celulă are loc la 4-6 ore după infectare. În mod curios, în paralel, nucleul celulei gazdă suferă o oarecare reorganizare și anume își pierde forma sferică. La 8-10 ore de la infectare, celula se rotunjește și pierde contactul cu substratul, iar în citoplasmă devine clar fabrica virală , conținând particule virale nou formate și înconjurată de mitocondrii . Unele celule au doar capside goale în fabricile lor virale. La 12–14 ore de la infectare, fabrica virală ocupă aproape tot spațiul liber din celulă, iar după 18–20 de ore, majoritatea celulelor sunt lizate și sunt eliberați noi virioni [3] .

Filogenie și relații

Conform arborelui filogenetic construit pe baza secvenței genelor familiei ADN polimerazei B , , Kaumoebavirus , Faustovirus și Asfarviridae formează o cladă monofiletică . Aparent, acești viruși au avut un strămoș comun . Secvența locusului care codifică proteina principală a capsidei aduce Pacmanvirusul mai aproape de Asfarviridae , dar arhitectura virionului este mai apropiată de cea a Faustovirusului [6] .  

Note

  1. ↑ Taxonul nu este recunoscut de Comitetul Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV).
  2. ↑ Taxonomia Virușilor  pe site-ul web al Comitetului Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV) .
  3. ↑ 1 2 3 4 Reteno DG , Benamar S. , Khalil JB , Andreani J. , Armstrong N. , Klose T. , Rossmann M. , Colson P. , Raoult D. , La Scola B. Faustovirus, an asfarvirus-related new descendență de viruși giganți care infectează amibe.  (Engleză)  // Journal Of Virology. - 2015. - iulie ( vol. 89 , nr. 13 ). - P. 6585-6594 ​​. - doi : 10.1128/JVI.00115-15 . — PMID 25878099 .
  4. ↑ Căutați Faustovirus în baza de date ICTV (downlink) . Consultat la 11 noiembrie 2018. Arhivat din original la 4 octombrie 2013. 
  5. ↑ 1 2 Klose T. , Reteno DG , Benamar S. , Hollerbach A. , Colson P. , La Scola B. , Rossmann MG Structure of faustovirus, a large dsDNA virus.  (engleză)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States Of America. - 2016. - 31 mai ( vol. 113 , nr. 22 ). - P. 6206-6211 . - doi : 10.1073/pnas.1523999113 . — PMID 27185929 .
  6. ↑ Andreani J. , Khalil JYB , Sevvana M. , Benamar S. , Di Pinto F. , Bitam I. , Colson P. , Klose T. , Rossmann MG , Raoult D. , La Scola B. Pacmanvirus, a New Giant Icosahedral Virus la răscrucea dintre Asfarviridae și Faustoviruses.  (Engleză)  // Journal Of Virology. - 2017. - 15 iulie ( vol. 91 , nr. 14 ). - doi : 10.1128/JVI.00212-17 . — PMID 28446673 .