IFITM3

Identificatori

IFITM3 , 1-8U, DSPA2b, IP15, proteină transmembranară 3 indusă de interferon

ID-uri externe

OMIM: 605579 MGI: 1913391 HomoloGene: 136199 GeneCards: 10410

ontologie genetică
Funcții	• GO:0001948, GO:0016582 legarea proteinelor plasmatice
componenta celulara	• parte membranară • endozom • membrană • membrană endozom tardiv • membrană celulară • membrană lizozomală • lizozom • GO:0009327 complex care conține proteine
proces biologic	• reglarea negativă a intrării virale în celula gazdă • răspunsul la interferon-gamma • procesul sistemului imunitar • răspunsul la virus • răspunsul la interferon-beta • răspunsul la stimulul biotic • reglarea negativă a replicării genomului viral • calea de semnalizare a interferonului de tip I • GO: 0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 răspuns imun • răspuns la interferon-alfa • imunitate înnăscută • reglare negativă a transcripției virale • răspuns de apărare la virus
Surse: Amigo / QuickGO

ortologii

feluri

Uman

Mouse

Entrez


10410


66141

Ansamblu


ENSG00000142089


ENSMUSG00000025492

UniProt


Q01628


Q9CQW9

RefSeq (ARNm)


NM_021034


NM_025378

RefSeq (proteină)


NP_066362


NP_079654

Locus (UCSC)

Chr 11: 0,32 – 0,33 Mb

Chr 7: 140,59 – 140,59 Mb

Căutare PubMed

[unu]

[2]

Editare (uman)

Editați (mouse)

IFITM3 ( Interferon-induced transmembrane protein 3; GGT1 ) este o proteină membranară din familia proteinelor membranare induse de interferon , un produs al genei umane IFITM3 [1] [2] [3] .

La om, familia IFITM este reprezentată de 4 gene pe cromozomul al 11-lea : IFITM1 , IFITM2, IFITM3 și IFITM5 [4] . La șoareci, familia include 7 proteine (există și IFITM6 și IFITM7).

Funcții

IFITM3 , ca și alți membri ai acestei familii, este o proteină antivirală care inhibă intrarea virusului în citoplasma celulară. Proteinele perturbă homeostazia colesterolului . Inhibă intrarea virusului în citoplasma celulei gazdă prin prevenirea fuziunii virusului cu endozomii sărăciți în colesterol. Poate inactiva particulele virale nou formate care înmuguresc din membrana unei celule infectate datorită înmuguririi lor dintr-o membrană sărăcită în colesterol. Proteina este activă împotriva virusului gripal A, coronavirus SARS , virusul Marburg , virusul Ebola , virusul febrei dengue , virusul West Nile , HIV-1 și virusul stomatitei veziculoase. Joacă un rol important în stabilitatea structurală și funcționarea ATPazei vacuolare ( v-ATPaza ). Interacționează cu v-ATPaza endozomală, care este esențială pentru localizarea corectă a clatrinei și este necesară pentru ca ATPaza să funcționeze pentru a deacidifica endozomii fagocitari, rezultând o stare antivirală a celulei.

Note

↑ Lewin AR, Reid LE, McMahon M., Stark GR, Kerr IM Analiza moleculară a unei familii de gene inductibile de interferon uman // Eur J Biochem : jurnal. - 1991. - August ( vol. 199 , nr. 2 ). - P. 417-423 . - doi : 10.1111/j.1432-1033.1991.tb16139.x . — PMID 1906403 .
↑ Tanaka SS, Yamaguchi YL, Tsoi B., Lickert H., Tam PP IFITM / Proteinele familiei Mil/fragilis IFITM1 și IFITM3 joacă roluri distincte în orientarea și repulsia celulelor germinale primordiale de șoarece // Dev Cell : jurnal. - 2005. - Decembrie ( vol. 9 , nr. 6 ). - P. 745-756 . - doi : 10.1016/j.devcel.2005.10.010 . — PMID 16326387 .
↑ Gena Entrez: proteina 3 transmembranară indusă de interferon IFITM3 (1-8U) . (nedefinit)
↑ Hickford D., Frankenberg S., Shaw G., Renfree MB Evolution of vertebrate interferon inductable transmembrane proteins // BMC Genomics : jurnal. - 2012. - Vol. 13 . — P. 155 . - doi : 10.1186/1471-2164-13-155 . — PMID 22537233 .

Literatură

Vaarala MH, Porvari K., Kyllönen A., Vihko P. Genele exprimate în mod diferențial în două linii de celule LNCaP de cancer de prostată care reflectă modificările în timpul progresiei cancerului de prostată // Lab . Investi. : jurnal. - 2000. - Vol. 80 , nr. 8 . - P. 1259-1268 . - doi : 10.1038/labinvest.3780134 . — PMID 10950117 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA Clonarea ADN-ului utilizând recombinare specifică site-ului in vitro // Genome Res . : jurnal. - 2001. - Vol. 10 , nr. 11 . - P. 1788-1795 . - doi : 10.1101/gr.143000 . — PMID 11076863 .
Simpson JC; Wellenreuther R; Postka A; Pepperkok, R; Wiemann, S. Localizare subcelulară sistematică a proteinelor noi identificate prin secvențierea cADN-ului la scară largă // EMBO Rep . : jurnal. - 2001. - Vol. 1 , nr. 3 . - P. 287-292 . - doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . — PMID 11256614 .
Strausberg R.L.; Feingold EA; Grouse LH; Derge, JG; Klausner, R.D.; Collins, F.S.; Wagner, L; Shenmen, C. M.; Schuler, GD Generarea și analiza inițială a mai mult de 15.000 de secvențe de ADNc umane și de șoarece de lungime completă // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Vol. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Gerhard D.S.; Wagner L; Feingold EA; Shenmen, C. M.; Grouse, LH; Schuler, G; Klein, S.L.; Vechi, S; Rasooly, R. Starea, calitatea și extinderea proiectului ADNc complet al NIH: Colecția de gene de mamifere (MGC ) // Genome Res. : jurnal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Wiemann S; Arlt D; Huber W; Wellenreuther, R; Schleeger, S; Mehrle, A; Bechtel, S; Sauermann, M; Korf, U. De la ORFeome la biologie: o conductă genomică funcțională // Genome Res . : jurnal. - 2004. - Vol. 14 , nr. 10B . - P. 2136-2144 . - doi : 10.1101/gr.2576704 . — PMID 15489336 .
Kimura K; Wakamatsu A; Suzuki Y; Ota, T; Nishikawa, T; Yamashita, R; Yamamoto, J; Sekine, M; Tsuritani, K. Diversificarea modulării transcripționale: identificarea și caracterizarea pe scară largă a promotorilor alternativi presupusi ai genelor umane // Genome Res . : jurnal. - 2006. - Vol. 16 , nr. 1 . - P. 55-65 . - doi : 10.1101/gr.4039406 . — PMID 16344560 .
Mehrle A; Rosenfelder H; Schupp I; Del Val, C; Arlt, D; Hahne, F; Bechtel, S; Simpson, J; Hofmann, O. Baza de date LIFEdb în 2006 // Nucleic Acids Res . : jurnal. - 2006. - Vol. 34 , nr. Problema baza de date . - P. D415-D418 . doi : 10.1093 / nar/gkj139 . — PMID 16381901 .