Oct-4

Oct-4
Identificatori
Simboluri POU clasa 5 homeobox 1 variantă de transcriere OCT4B2POU5F1 proteina de legare a octamerului 3Oct-4POU clasa 5 homeobox 1 variantă de transcriere OCT4B3POU-tip homeodomeniu care conține proteina de legare ADNPOU clasa 5 homeobox 1 variantă de transcriere OCT4B6OTF-3Oct-3Oct-3Oct-3POU clasa de descriere factor de clasa 1Ptran clasa 1Ptran 3POU clasa 5 homeobox 1 variantă de transcriere OCT4B1POU clasa 5 homeobox 1 variantă de transcriere OCT4B5POU clasa 5 homeobox 1 variantă de transcriere OCT4B4POU domeniu factor de transcripție factor de transcripție de legare a octamerului 3octamer-binding protein 4
ID-uri externe GeneCards:
Profilul expresiei ARN
Mai multe informatii
ortologii
feluri Uman Mouse
Entrez
Ansamblu
UniProt
RefSeq (ARNm)

N / A

N / A

RefSeq (proteină)

N / A

N / A

Locus (UCSC) N / A N / A
Căutare PubMed N / A
Editare (uman)

Oct-4 (abrevierea engleză  Octamer-4 ) este un factor de transcripție care conține homeobox din familia POU . Această proteină este implicată în auto-reînnoirea celulelor stem embrionare nediferențiate. [1] Folosit pe scară largă ca marker pentru celulele nediferențiate. Expresia Oct-4 este foarte fin reglată, deoarece o creștere sau o scădere poate duce la diferențierea celulelor. [2]

Expresie și funcții

Factorul de transcripție Oct-4 este deja activ în ovocit și rămâne activ până în momentul implantării. Expresia Oct-4 este asociată cu fenotipul celular nediferențiat și cu tumori. [3] Deteriorarea genei Oct-4 induce diferențierea și dovedește rolul acestui factor în auto-reînnoirea celulelor stem embrionare umane. [4] Oct-4 formează un heterodimer cu proteina Sox2 , cele două proteine ​​se leagă împreună de ADN. [5]

Embrionii de șoarece deficienți în gena Oct-4 au niveluri scăzute ale proteinei Oct-4 și nu reușesc să formeze o masă celulară interioară , să își piardă pluripotența și să se diferențieze în trofectoderm . Astfel, nivelul de expresie Oct-4 la șoareci este necesar pentru reglarea pluripotentei și diferențierea timpurie a celulelor, iar funcția sa principală este de a păstra embrionul de diferențiere.

Informații NCBI

feluri "Genetica" Poziţie
Mușchiul mus GeneID: 18999 , proteină refseq: NP_038661.1 , mARN refseq: NM_013633.1 Poziția în genom: NC_000083.4, 35114104..35118822 (de-a lungul lanțului plus). Cromozom: 17,17 B1; 17 19.23 pm
Homo sapiens GeneID: 5460 , proteină refseq: NP_002692.2 , mARN refseq: NM_002701.3 . Există două izoforme ale OCT4 la om, a doua izoformă arătând ca porțiunea N-terminală a primei. [1] . Poziția în genom: NC_000006.10, 31246432-31240107 (catenă negativă). Cromozom: 6, 6p21.31
Rattus norvegicus GeneID: 294562 , proteină refseq: NP_001009178 , mRNA refseq: NM_001009178 Poziția în genom: NW_001084776, 650467-655015 (lanț minus). Cromozom: 20.
Danio rerio GeneID: 303333 , proteină refseq: NP_571187 , mRNA reseq: NM_131112 Poziția în genom: NC_007127.1, 27995548-28000317 (catenă negativă). Cromozomul: 21.

Informații structurale

domeniul conservator
domeniul conservator POU [6] homeodomeniu [7]
Lungime, reziduuri de aminoacizi 75 59
Descriere Găsit în factorii de transcripție Pit-Oct-Unc Domeniile de legare la ADN sunt implicate în reglarea transcripției unor procese importante de dezvoltare la eucariote; poate lega ADN-ul ca monomeri, dimeri sau heterodimeri, într-o manieră specifică secvenței.

Boli

Oct-4 a fost implicată în dezvoltarea tumorilor cu celule stem la adulți. Expresia factorului nenatural la șoarecii adulți poate duce la displazie cutanată și intestinală . Displazia intestinală este rezultatul transcripției crescute a β-cateninei și inhibarea diferențierii celulare. [opt]

Modele animale

În 2000, Niwa și colab., folosind expresia convențională a genelor și reprimarea în celulele stem embrionare de șoarece (ES), au determinat contribuția Oct-4 la menținerea potențialului de dezvoltare. [2] Deși se crede în general că transcripția este reglată într-un mod binar da/nu, s-a demonstrat că nivelurile Oct-4 guvernează trei căi diferite pentru dezvoltarea celulelor ES. O creștere mai mică de două ori a nivelului de expresie induce diferențierea în endoderm primar și mezoderm. Reprimarea Oct-4 are ca rezultat pierderea pluripotentei și diferențierea în trofectoderm. O cantitate strict definită de Oct-4 este necesară pentru a menține auto-reînnoirea, iar o schimbare a nivelului cauzează diferențierea de-a lungul diferitelor căi. Niwa și colab. cred că Oct-4 este principalul regulator al pluripotenței.

Factorii de transcripție Oct-4, Sox2 și Nanog se pot induce reciproc expresia și sunt necesari pentru auto-reînnoirea celulelor nediferențiate ale masei celulare interioare a blastocistului , precum și a celulelor stem embrionare (care sunt formate din masa celulară internă). ). [5]

Oct-4 este un factor de transcripție care a fost folosit pentru a genera celule stem induse , împreună cu Sox2 , Klf4 și adesea c - Myc la șoareci, [9] [10] [11] demonstrând capacitatea de a crea celule cu proprietăți stem. Ulterior s-a demonstrat că doar doi dintre acești patru factori Oct4 și Klf4 au fost necesari pentru reprogramarea celulelor stem neuronale de șoarece adulți [12] S-a demonstrat în cele din urmă că singurul factor Oct-4 a fost necesar pentru această transformare. [13]

Mai multe studii au arătat rolul Oct-4 în menținerea auto-reînnoirii celulelor stem somatice (epiteliu intestinal, măduvă osoasă, retină, creier, ficat). Grupul lui Rudolf Jenisch din octombrie 2007 nu a arătat nicio contribuție a lui Oct-4 la auto-reînnoirea celulelor stem somatice la șoareci. [paisprezece]

Vezi și

Note

  1. Young Lab- Core Transcriptional Regulatory Circuitry in Human Embryonic Stem Cells Arhivat 28 iunie 2009. la MIT
  2. 1 2 Niwa H., Miyazaki J., Smith AG Expresia cantitativă a Oct-3/4 definește diferențierea, dediferențierea sau auto-reînnoirea celulelor ES   // Nat . Genet.  : jurnal. - 2000. - Aprilie ( vol. 24 , nr. 4 ). - P. 372-376 . - doi : 10.1038/74199 . — PMID 10742100 .
  3. Looijenga LH, Stoop H., de Leeuw HP, și colab . POU5F1 (OCT3/4) identifică celule cu potențial pluripotent în tumorile cu celule germinale umane   // Cancer Research : jurnal. - Asociația Americană pentru Cercetarea Cancerului, 2003. - Vol. 63 , nr. 9 . - P. 2244-2250 . — PMID 12727846 .
  4. ^ Zaehres H., Lensch MW, Daheron L., Stewart SA, Itskovitz-Eldor J., Daley GQ Interferența ARN de înaltă eficiență în celulele stem embrionare umane  //  Stem Cells: journal. - 2005. - Vol. 23 , nr. 3 . - P. 299-305 . - doi : 10.1634/stemcells.2004-0252 . — PMID 15749924 .
  5. 1 2 Rodda DJ, Chew JL, Lim LH, et al . Reglarea transcripțională a nanog de către OCT4 și SOX2  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 2005. - iulie ( vol. 280 , nr. 26 ). - P. 24731-24737 . - doi : 10.1074/jbc.M502573200 . — PMID 15860457 .
  6. NCBI CDD smart00352 . Preluat: 20 iunie 2007.
  7. NCBI CDD cd00086 . Preluat: 20 iunie 2007.
  8. Hochedlinger K., Yamada Y., Beard C., Jaenisch R. Expresia ectopică a Oct-4 blochează diferențierea celulelor progenitoare și provoacă displazie în țesuturile epiteliale  // Cell  :  journal. - Cell Press , 2005. - Vol. 121 , nr. 3 . - P. 465-477 . - doi : 10.1016/j.cell.2005.02.018 . — PMID 15882627 .
  9. Okita K. , Ichisaka T. , Yamanaka S. Generation of germline-competent induced pluripotent stem cells.  (engleză)  // Natură. - 2007. - Vol. 448, nr. 7151 . - P. 313-317. - doi : 10.1038/nature05934 . — PMID 17554338 .
  10. ^ Wernig M. , Meissner A. , ​​Foreman R. , Brambrink T. , Ku M. , Hochedlinger K. , Bernstein BE , Jaenisch R. Reprogramarea in vitro a fibroblastelor într-o stare pluripotentă asemănătoare celulei ES. (engleză)  // Natură. - 2007. - Vol. 448, nr. 7151 . - P. 318-324. - doi : 10.1038/nature05944 . PMID 17554336 .  
  11. Maherali N. , Sridharan R. , Xie W. , Utikal J. , Eminli S. , Arnold K. , Stadtfeld M. , Yachechko R. , Tchieu J. , Jaenisch R. , Plath K. , Hochedlinger K. Direct reprogramat fibroblastele prezintă remodelare epigenetică globală și contribuție tisulară pe scară largă.  (ing.)  // Celulă stem celulară. - 2007. - Vol. 1, nr. 1 . - P. 55-70. - doi : 10.1016/j.stem.2007.05.014 . — PMID 18371336 .
  12. Kim JB, Zaehres H., Wu G., Gentile L., Ko K., Sebastiano V., Araúzo-Bravo MJ, Ruau D., Han DW, Zenke M., Schöler HR Celulele stem pluripotente induse din stem neuronale adulte celule prin reprogramare cu doi factori  //  Nature : journal. - 2008. - iulie ( vol. 454 , nr. 7204 ). - P. 646-650 . - doi : 10.1038/nature07061 . — PMID 18594515 .
  13. Kim JB, Sebastiano V., Wu G., Araúzo-Bravo MJ, Sasse P., Gentile L., Ko K., Ruau D., Ehrich M., van den Boom D., Meyer J., Hübner K. , Bernemann C., Ortmeier C., Zenke M., Fleischmann BK, Zaehres M., Schöler HR Oct4-Induced Pluripotence in Adult Neural Stem Cells  // Cell  :  journal. - Cell Press , 2009. - Februarie ( vol. 136 , nr. 3 ). - P. 411-419 . - doi : 10.1016/j.cell.2009.01.023 .
  14. Lengner CJ, Camargo FD, Hochedlinger K., et al . Expresia Oct4 nu este necesară pentru auto-reînnoirea celulelor stem somatice de șoarece  // Cell  Stem Cell : jurnal. - 2007. - octombrie ( vol. 1 , nr. 4 ). - P. 403-415 . - doi : 10.1016/j.stem.2007.07.020 . — PMID 18159219 .

Articole pentru lectură suplimentară

Link -uri